www.wikidata.de-de.nina.az
Haloarcula ist eine Gattung extrem halophiler Archaeen die heute meist in eine neue Familie Haloarculaceae gestellt wird 3 4 1 statt sie wie herkommlich der Familie Halobacteriaceae 5 zuzuordnen beide Familien gehoren zur Ordnung Halobacteriales der Euryarchaeota Haloarcula Arten sind in neutralen salzhaltigen Umgebungen wie Salzseen Meeressalinen und salzhaltigen Boden zu finden Wie andere Mitglieder ihrer Familie benotigen die Archaeen von Haloarcula mindestens 1 5 ᴍ mol ℓ NaCl fur ihr Wachstum und wachsen optimal bei 2 0 bis 4 5 ᴍ NaCl 6 Die Arten Spezies der Gattung Haloarcula sind gramnegativ und extrem halophil dabei konnen sie verschiedene Kohlenstoffquellen nutzen 7 Sie unterscheiden sich von anderen Gattungen der Halobacteriaceae durch das Vorhandensein spezifischer Derivate des polaren Lipids TGD 2 Trigalactosyl Diacyl Glycerol 2 8 6 Der G C Gehalt der genomischen DNA liegt zwischen 62 7 und 68 0 2 HaloarculaSystematikDomane Archaeen Archaea Abteilung EuryarchaeotaKlasse HalobacteriaOrdnung HalobacterialesFamilie HaloarculaceaeGattung HaloarculaWissenschaftlicher NameHaloarculaTorreblanca et al 1986 emend Oren et al 2009 1 2 Typusart ist Haloarcula vallismortis 4 eine Spezies mesophiler massig thermophiler d h hitzeliebender Archaeen erstmals isoliert aus Salzbecken im Death Valley im US Bundesstaat Kalifornien 3 9 Sie wurde ursprunglich als Halobacterium vallismortis Gonzalez et al 1979 der Gattung Halobacterium zugeordnet 9 aber 1986 von Marina Torreblanca et al als Typusart zusammen mit anderen Arten in die neu geschaffene Gattung Haloarcula gestellt 10 2 Inhaltsverzeichnis 1 Arten 2 Etymologie 3 Haloarcula vallismortis 4 Haloarcula hispanica 5 Haloarcula quadrata 6 Haloarcula japonica 7 Haloarcula californiae und H sinaiiensis 8 Viren 9 Weiterfuhrende Literatur 10 Weblinks 11 EinzelnachweiseArten BearbeitenDie gegenwartig Februar 2022 akzeptierte Taxonomie der Gattung basiert auf folgenden Quellen B Bacterial Diversity BacDive Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen DSMZ 3 L List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature LPSN Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen DSMZ 4 C Catalogue for Life 11 N National Center for Biotechnology Information NCBI 1 W World Register of Marine Species WoRMS 5 sowie Oren et al 2014 12 Es gibt nach der LPSN derzeit 12 gultig publizierte Spezies in der LPSN nicht gefuhrte oder dort als nicht gultig publiziert gekennzeichnete Arten sind in Anfuhrungszeichen gesetzt Gattung Haloarcula Torreblanca et al 1986 B L N syn Haloarcula Javor et al 1982 N Haloarcula Torreblanca et al 1986 emend Oren et al 2009 N 2 bzw Torreblanca Rodriquez Valera Juez Ventosa Kamekura amp Kates 1986 emend Oren Arahal amp Ventosa 2009 W Spezies Haloarcula aidinensis Zhou et al 1994 B L N Spezies Haloarcula algeriensis N Spezies Haloarcula amylolytica Yang et al 2007 B L N Spezies Haloarcula argentinensis Ihara et al 1997 B L C N Spezies Haloarcula californiae Torreblanca et al 1986 2 B L N bzw Javor et al 1982 13 L Spezies Haloarcula hispanica Juez et al 1986 14 15 16 17 B L C N Spezies Haloarcula japonica Takashina et al 1991 18 B L C N Spezies Haloarcula mannanilytica Enomoto et al 2020 B L N Spezies Haloarcula marismortui ex Volcani 1940 Oren et al 1990 B L bzw ex Elazari Volcani 1940 Oren et al 1990 C N bzw Elazari Volcani 1940 N W 19 20 21 22 alias Flavobacterium Halobacterium maris mortui N 23 Spezies Haloarcula morrhuae Torreblanca et al 1986 2 L Spezies Haloarcula quadrata Oren et al 1999 6 B L C N Spezies Haloarcula rubripromontorii Sanchez Nieves et al 2016 L N Spezies Haloarcula salaria Namwong et al 2011 B L N Spezies Haloarcula sebkhae Barreteau et al 2019 B L N Spezies Haloarcula siamensis N Spezies Haloarcula sinaiiensis Torreblanca et al 1986 2 B L bzw Javor et al 1982 13 L bzw ex Javor et al 1982 Torreblanca et al 1986 N Spezies Haloarcula taiwanensis Chen et al 2018 L N Spezies Haloarcula tradensis Namwong et al 2011 B L N Spezies Haloarcula vallismortis Gonzalez et al 1979 Torreblanca et al 1986 2 B L C N ursprunglich Halobacterium vallismortis Gonzalez et al 1979 9 Typus L weitere ca 385 Stamme die mogliche Spezies darstellen mit vorlaufigen Bezeichnungen 24 N Ausgliederung en Haloarcula mukohataei Ihara et al 1997 L C zu Halomicrobium mukohataei Ihara et al 1997 Oren et al 2002 B L C Etymologie BearbeitenDer Gattungsname Haloarcula leitet sich ab von altgriechisch ἅls hals deutsch Salz Meer Genitiv halos und von lateinisch arcula deutsch Kastchen englisch small box bedeutet also Salz benotigendes Kastchen 4 Bedeutung einiger der Art Epitheta 4 californiae ist neulateinischer Genitiv mit Bedeutung Kaliforniens hispanica ist lat fem Adjektiv mit Bedeutung zu Spanien gehorig oder spanisch 4 japonica ist neulateinisch fur zu Japan gehorig oder japanisch marismortui leitet sich ab von lateinisch maris des Meeres und mortuus tot bedeutet somit Totes Meer quadrata ist lateinisch fem fur quadratisch vallismortis leitet sich ab vom lat Genitiv vallis des Tales und mortis des Todes bedeutet also vom Tal des Todes Death Valley Haloarcula vallismortis BearbeitenH vallismortis ist die Typusart der Gattung Haloarcula 4 Diese Spezies Art mesophiler massig thermophiler d h hitzeliebender aber extrem halophiler salzvertraglicher Archaeen wurde Ende der 1970er Jahre erstmals isoliert aus Salzbecken im Death Valley USA 3 9 Referenzstamm J F 54 alias ATCC 29715 oder DSM 3756 1 9 Sie wurde von Carmen Gonzalez et al zunachst als Spezies Halo bacterium vallismortis Gonzalez et al 1979 der damals noch unter den Bakterien statt Archaeen klassifizierten Gattung Halobacterium zugeordnet 9 wurde sie 1986 von Marina Torreblanca et al als Typusart zusammen mit einigen anderen Arten in die neu geschaffene Gattung Haloarcula gestellt 10 2 Die Zellen des Referenzstammes wurden beschrieben als motile bewegliche gramnegative extrem pleomorphe vielgestaltige Organismen Sie sind aerob aber fakultativ anaerob Eine Vielzahl von Kohlenhydraten wird mit oder ohne Saureproduktion assimiliert losliche Starke wird hydrolysiert Der Organismus ist nicht proteolytisch aber es gibt Katalase Oxidase und DNase Reaktionen Polysorbat 20 Tween 2 wird leicht hydrolysiert die Polysorbate Tweens 40 60 und 80 jedoch nicht Nitrate werden unter Gasbildung zu Nitriten reduziert Nitrite werden aber nicht weiter reduziert Die optimale Wachstumstemperatur liegt bei 40 C Das Wachstum wird durch Bacitracin und Novobiocin 25 gehemmt 9 Es sind auch Viren bekannt die diese Spezies parasitieren s u Haloarcula hispanica BearbeitenH hispanica wurde 1986 im Zug einer umfassenden Studie uber extrem halophile Halobacteria 15 in Spanien aus einem Salzgarten englisch solar saltern isoliert 14 Der Referenzstamm Y27 alias ATCC 33960 1 wurde 1989 als neue Art Haloarcula hispanica an er kannt dabei wurde auch der Stamm MA2 38 alias ATCC 33959 als ebenfalls neue Art Haloferax gibbonsii registriert 17 26 14 Ein weiterer 2014 untersuchter Stamm dieser Spezies ist N601 1 16 H hispanica wird haufig im Labor gezuchtet um diese Spezies parasitierende Viren wie das SH1 Virus Spezies Haloarcula hispanica virus SH1 aus der Familie Sphaerolipoviridae zu untersuchen siehe auch Viren Der Grund dafur ist seine geringe Restriktionsaktivitat im Vergleich zu anderen Mitgliedern seiner Familie Halobacteriaceae 26 Daher wurde H hispanica als Modellarchaeon fur solche und andere Studien zu verwenden 17 27 26 Neben der Untersuchung von Wirt Biologie Virus Interaktionen in salzhaltiger Umgebung wurden auch die Stoffwechselwege von H hispanica untersucht Insbesondere besitzt H hispanica Stamm N601 die Fahigkeit unter sonst nahrstofflimitierenden Bedingungen Polyhydroxyalkanoate PHAs herzustellen falls ein Uberschuss an Kohlenstoff vorliegt PHAs sind wichtig fur die Speicherung von Kohlenstoff und Energie 16 26 Daruber hinaus wurden Studien durchgefuhrt um den Schwefel Stoffwechselweg zu kartieren und die Biosynthese von Aminosauren zu erkennen 26 Das Genom des Referenzstamms Y27 alias ATCC 33960 besteht aus zwei ringformigen DNA Doppelstrangen als Chromosom 1 28 und 2 29 bezeichnet Auch ein Plasmid wurde sequenziert pHH400 30 Haloarcula quadrata BearbeitenH quadrata wurde erstmals bei Versuchen isoliert das bis 2004 als unkultivierbar geltende Haloarchaeon Haloquadratum walsbyi Walsby Bakterium korrekter ware Walsby Archaeon zu kultivieren Die Zellen von H quadrata haben ahnlich wie die Walsby Haloarchaeen eine uberwiegend quadratische flache etwas pleomorphe unregelmassige Gestalt en predominantly flat square shaped somewhat pleomorphic 6 Der Referenzstamm von H quadrata 801030 1 alias ATCC 700850 oder DSM 11927 1 wurde einem Solebecken en brine pool auf der Sinai Halbinsel in Agypten entdeckt 6 3 Dies war einer der ersten Stamme von Prokaryoten deren Zellen eine flache kastenformige Form zeigen Die Klassifizierung als Haloarcula Spezies erfolgte aufgrund ihrer polaren Lipidzusammensetzung 6 Die Spezies d h ihr Referenzstamm ist mesophil d h bevorzugt mittlere Hitze 31 Die Zellen sind motil sie bewegen sich mit Hilfe von einzelnen oder mehreren Geisseln Es fehlen Gasvakuolen 6 Haloarcula japonica BearbeitenH japonica ist eine 1990 isolierte 1991 veroffentlichte Spezies extrem halophiler Archaeen aus einem japanischen Salinenboden auf der Noto Halbinsel Japan Dieser Organismus hat unter normalen Wachstumsbedingungen eine typische dreieckige Form 18 3 Der Referenzstamm ist TR 1 alias ATCC 49778 oder DSM 6131 4 In einer 2014 veroffentlichten Studie untersuchten Rie Yatsunami et al die Carotinoide dieser Art 32 Es sind auch Viren bekannt die diese Spezies parasitieren s u Haloarcula californiae und H sinaiiensis BearbeitenH californiae ist ein mesophiles mittlere Temperaturbereiche bevorzugendes Archaeon dessen Referenzstamm BJGN 2 alias JCM 8912 oder ATCC 33799 aus der Sole einer Saline in Guerrero Negro GN Niederkalifornische Halbinsel Baja California isoliert wurde 3 Die Erstbeschreibung stammt aus dem Jahr 1982 von Barbara Javor et al 13 Damals wurden drei morphologisch ahnliche Stamme halophiler kastenformiger Prokaryonten wurden aus Solen isoliert die sich auf der Sinai in Niederkalifornien Baja California Mexiko und in Sudkalifornien Sudkalifornien befinden Obwohl die Isolate in ihrer Morphologie den quadratischen Walsby Bakterien korrekt Walsby Haloarchaeen Haloquadratum walsbyi ahnelten welche in den Solen des Roten Meeres und von Baja California vorherrschen wurden sie als von diesen verschieden charakterisiert Die Zellen weisen die allgemeinen Merkmale von extremen Halophilen und Archaeen auf Sie enthalten Pigmente die dem Bakteriorhodopsin ahneln und offenbar die lichtgesteuerte Protonenpumpe en light driven ion translocation und Photophosphorylierung vermitteln 13 Im Jahr 1986 erfolgte dann eine erneute Beschreibung der Art als Mitglied der neuen Archaeen Gattung Haloarcula durch Marina Torreblanca et al 2 Es sind Viren bekannt die diese Spezies parasitieren s u Die Typusprobe von H sinaiiensis wurde ebenfalls 1982 von Barbara Javor et al geborgen aus der Saline arabisch سبخة Sabkha auch Sabcha oder Sebkha DMG Sabḫa Gavish ar جافيش benannt nach dem Erforscher solcher Solebecken Eliezer Gavish 1937 1981 Diese Saline fruher auch englisch Nabq sea marginal pool genannt ist Teil des Nabeq Naturschutzgebiets en Nabq Protected Area 33 auf der Sinai Halbinsel nordlich von Scharm El Scheich am Golf von Akaba 34 3 13 Der Referenzstamm ATCC 33800 wird daher auch kurz als SG fur Sabkha Gavish bezeichnet 3 13 2 Auch diese Spezies wurde 1986 von Marina Torreblanca et al erneut beschrieben als Mitglied der Archaeen Gattung Haloarcula 2 Viren BearbeitenDerzeit sind alle bekannten Viren die Haloarcula Spezies infizieren DNA Viren das gilt sowohl fur die vom International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV bestatigen 35 als auch fur alle weiteren vorgeschlagenen und beim National Center for Biotechnology Information NCBI Taxonomy Browser gelisteten 36 Virusarten Sie gehoren aber drei verschiedenen Realms an in diesen Realms jeweils einer einzigen Klasse Realm Varidnaviria Klasse Biologie Laserviricetes Ordnung Halopanivirales Familie Sphaerolipoviridae Gattung Alphasphaerolipovirus fruher Halosphaerovirus Spezies Haloarcula Virus HCIV1 wissenschaftlich Haloarcula virus HCIV1 Haloarcula californiae icosahedral virus 1 HCIV 1 Spezies Haloarcula hispanica icosahedral virus 2 37 Spezies PH1 Virus wiss Haloarcula hispanica virus PH1 38 Spezies SH1 Virus wiss Haloarcula hispanica virus SH1 39 26 Realm Monodnaviria Klasse Huolimaviricetes Ordnung Haloruvirales Familie Pleolipoviridae Gattung Alphapleolipovirus Spezies Alphapleolipovirus HHPV1 alias Haloarcula Virus HHPV1 wiss Haloarcula virus HHPV1 40 Haloarcula hispanica pleomorphic virus 1 HHPV 1 Spezies Alphapleolipovirus HHPV2 alias Haloarcula Virus HHPV2 wiss Haloarcula virus HHPV 41 Haloarcula hispanica pleomorphic virus 2 HHPV 2 Gattung Betapleolipovirus Spezies Betapleolipovirus HHPV3 alias Haloarcula Virus HHPV3 wiss Haloarcula virus HHPV3 42 Haloarcula hispanica pleomorphic virus 3 HHPV 3 Spezies Betapleolipovirus HHPV4 alias Haloarcula Virus HHPV43 wiss Haloarcula virus HHPV4 43 Haloarcula hispanica pleomorphic virus 4 HHPV 4 Gattung Gammapleolipovirus Spezies Gammapleolipovirus His2 alias Haloarcula Virus His2 wiss Haloarcula virus His2 44 His2 Virus wiss His2 virus alias Halovirus His2 His2V Keiner Gattung zugewiesene Vorschlage innerhalb dieser Familie Spezies Haloarcula Virus Hardyhisp2 wiss Haloarcula virus Hardyhisp2 alias Haloarcula hispanica virus Hardyhisp2 Spezies Haloarcula Virus Harhisp1 wiss Haloarcula virus Harhisp1 Klasse Caudoviricetes Ordnung Thumleimavirales Familie Hafunaviridae Morphotyp Myoviren Gattung Haloferacalesvirus alias Hfunalikevirus Spezies Haloarcula Virus HCTV 6 wiss Haloarcula virus HCTV 6 Spezies Haloarcula Virus HCTV 7 wiss Haloarcula virus HCTV 7 Spezies Haloarcula Virus HCTV 8 wiss Haloarcula virus HCTV 8 Spezies Haloarcula Virus HCTV 9 wiss Haloarcula virus HCTV 9 Spezies Haloarcula Virus HCTV 10 wiss Haloarcula virus HCTV 10 Spezies Haloarcula Virus HCTV 11 wiss Haloarcula virus HCTV 11 Spezies Haloarcula Virus HCTV 15 wiss Haloarcula virus HCTV 15 Spezies Haloarcula Virus HJTV 1 wiss Haloarcula virus HJTV 1 Spezies Haloarcula Virus HJTV 2 wiss Haloarcula virus HJTV 2 Spezies Haloarcula Virus HJTV 3 wiss Haloarcula virus HJTV 3 Klasse Caudoviricetes Ordnung Kirjokansivirales Familie Pyrstoviridae Morphotyp Siphoviren Gattung Hatrivirus Spezies Hatrivirus HATV3 fruher Haloarcula tailed virus 3 Klasse Caudoviricetes Ordnung Kirjokansivirales Familie Shortaselviridae Morphotyp Podoviren Gattung Lonfivirus Spezies Lonfivirus HSTV1 fruher Haloarcula sinaiiensis tailed virus 1 Klasse Caudoviricetes Nicht naher zugewiesene Vorschlage innerhalb dieser Klasse Stand 16 Juli 2022 Spezies Haloarcula Virus HCTV 16 wiss Haloarcula virus HCTV 16 Spezies Haloarcula Virus HVTV 2 wiss Haloarcula virus HVTV 2 dd Anmerkungen Vom ICTV unbestatigte aber im NCBI Taxonomy Browser gelistete Kandidaten sind in Anfuhrungszeichen wiedergegeben Meist ist an der Namensgebung erkenntlich ob der erste nachgewiesen naturliche Wirt H californiae H hispanica H japonica oder H vallismortis ist Beispielsweise ist Alphapleolipovirus HHPV1 35 eine ICTV bestatigte Spezies doppelstrangiger DNA Viren Ihr Wirt ist H hispanica 15 Die Viren dieser Spezies verfugen uber eine Reihe spezifischer Merkmale die sich von allen zuvor beschriebenen Viren unterscheiden 45 46 Die Virusteilchen Virionen verlassen den Wirt ohne Lyse was auf einen Knospungsmechanismus schliessen lasst 15 Die obige Liste beinhaltet keine Aussage uber die Wirtsspezifitat diese ist bei Vertretern der Caudoviricetes aber meist hoch aber im Allgemeinen konnen von einem der obigen Viren unter Umstanden auch andere Stamme derselben Wirtsspezies gattung oder gar familie befallen werden Weiterfuhrende Literatur BearbeitenMarina Torreblanca Francisco Rodriguez Valera Guadalupe Juez Antonio Ventosa Masahiro Kamekura Morris Kates Classification of non alkaliphilic halobacteria based on numerical taxonomy and polar lipid composition and description of Haloarcula gen nov and Haloferax gen nov In Syst Appl Microbiol 8 Jahrgang Nr 1 2 Juli 1986 S 89 99 doi 10 1016 s0723 2020 86 80155 2 PDF Aharon Oren Antonio Ventosa International Committee on Systematic Bacteriology Subcommittee on the taxonomy of Halobacteriaceae Minutes of the meetings 16 August 1999 Sydney Australia In Int J Syst Evol Microbiol 50 Jahrgang Nr 3 2000 S 1405 1407 doi 10 1099 00207713 50 3 1405 PMID 10843089 Barbara Javor Carol Requadt Walther Stoeckenius Box shaped halophilic bacteria In J Bacteriol 151 Jahrgang Nr 3 September 1982 S 1532 1542 doi 10 1128 jb 151 3 1532 1542 1982 PMID 6286602 PMC 220435 freier Volltext Weblinks BearbeitenAnnual Checklist Search results for Haloarcula auf Species2000 Catalogue of Life Search results Haloarcula auf MicrobeWiki Kenyon College Department of 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