Die Einteilung der Viren in Systematiken ist kontinuierlicher Gegenstand der Forschung. So existieren neben- und nacheinander verschiedene Virusklassifikationen sowie die offizielle Virus-Taxonomie des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Die hier behandelte Gruppe ist als Taxon durch neue Forschungen obsolet geworden oder aus anderen Gründen nicht Teil der offiziellen Virus-Taxonomie.
Myoviren | ||||||||||||
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P2-Phagen im TEM | ||||||||||||
Systematik | ||||||||||||
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Taxonomische Merkmale | ||||||||||||
Wissenschaftlicher Name | ||||||||||||
„Myoviruses“ | ||||||||||||
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Die morphologisch begründete (nicht-taxonomische) Gruppe der Myoviren (englisch myoviruses, früher auch Morphotyp A genannt) umfasst eine Reihe von Familien, Unterfamilien und Gattungen von Viren mit einem linearen Molekül doppelsträngiger DNA (dsDNA) als Genom.
Die Myoviren werden unterteilt in Subtypen: 1: Kopf ohne „Fühler“, aber kurze Anhängsel am Schwanz; 2: kragenartige Struktur zwischen Kopf und Schwanz und kurze Anhängsel am Schwanz.
Alle Mitglieder gehören zur Klasse der Caudoviricetes („Schwanzviren“ – Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur): Ihre Mitglieder besitzen ein ikosaedrisches Kapsid und ein Schwanzteil; wegen dessen kontraktiler Eigenschaft leitet sich der Gruppenname von griechisch μυός myos, deutsch ‚Muskel‘ ab. Als Wirte dienen Prokaryoten, meist Bakterien (Bakteriophagen), aber teilweise auch Archaeen. Innerhalb der Klasse Caudoviricetes zeichnen sich die Myoviren außerdem durch besonders große, teilweise langgestreckte Kapside (z. B. T4-Phage: 111 × 78 nm) und ein sehr großes Genom (34–169 kBp) aus (siehe Riesenphagen). Der wichtigste Vertreter ist der schon früh entdeckte T4-Phage (Spezies Enterobacteria-Virus T4, Gattung Tequatrovirus), dessen besondere Morphologie und genetische Eigenschaften in der molekularbiologischen Forschung eine herausragende Rolle spielte. Die von diesem Phagen abgeleitete T4-DNA-Ligase findet heute noch Verwendung in der Molekularbiologie. Weitere Mitglieder von Bedeutung sind der Vibrio-Phage KVP40 (Spezies Vibrio-Virus KVP40, Gattung Schizotequatrovirus), der Pseudomonas-Phage phiKZ (Spezies Pseudomonas-Virus phiKZ, Gattung Phikzvirus), der Bakteriophage P1 (Spezies Escherichia-Virus P1, Gattung Punavirus, siehe P1 Artificial Chromosome) u. a.
Die Gruppe galt lange Zeit als ein Virustaxon im Rang einer Virusfamilie mit der Bezeichnung Myoviridae. Im März 2021 wurde vorgeschlagen, diese Familie mitsamt der Ordnung Caudovirales wegen fehlender Monophylie aufzulösen und (wie damals bereits z. T. geschehen) durch neu zu schaffende Familien zu ersetzen, damit neue Ergebnisse aus der Metagenomik in die Taxonomie aufgenommen werden können. Das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) hat dem im März 2022 entsprochen. Gemäß Vorschlag bleibt die Bezeichnung „Myoviren“ (englisch myoviruses) aber als informeller Sammelbegriff morphologisch ähnlicher Prokaryotenviren mit einem linearen Doppelstrang-DNA-Genom erhalten.
Systematik Bearbeiten
Die folgende Systematik nach ICTV (Stand 13. Juni 2022) umfasst nur einen Teil der zugehörigen Spezies:
Nicht-taxonomische Gruppe Myoviren (en. myoviruses, auch Caudoviricetes „Morphotyp A“)
- Ordnung Thumleimavirales (Archaeen-Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur mit Myo- und Siphoviren-Morphologie, hier nur die Myoviren-Familie(n))
- Myoviren ohne aktuelle Ordnungszuweisung
- Unterfamilie Eucampyvirinae
- Unterfamilie Gorgonvirinae
- Unterfamilie Kantovirinae
- Unterfamilie Ounavirinae
- Unterfamilie Stephanstirmvirinae
- Spezies Justusliebigvirus muut (mit Escherichi-Phage muut)
- Spezies Justusliebigvirus phi92 (mit Enterobacteria-Phage phi92, en. Enterobacteria phage phi92)
- Unterfamilie Vequintavirinae
- small myoviruses (auch dwarf myoviruses, φPLPE-like phages, französisch myovirus nains, Plpelikevirus-Gruppe, Myovirus-Mu-ähnliche Phagen – informelle Gruppe kleiner Myoviren)
- Gattung Myoalterovirus
- Spezies Alteromonas-Myovirus V22 (wiss. Myoalterovirus PT11V22, früher Alteromonas virus AltPT11-V22, mit Alteromonas phage AltPT11-V22)
- Gattung Myosmarvirus
- Gattung Naesvirus (früher Vidavervirus, Bcep78virus, Bcep78likevirus, Bcep78-ähnliche Viren)
- Spezies Naesvirus bcep1 (früher Burkholderia virus Bcep1)
- Spezies Naesvirus bcep43 (früher Burkholderia virus Bcep43)
- Spezies Naesvirus bcep781 (früher Burkholderia virus Bcep781)
- Spezies Naesvirus bcepNY3
- Gattung Tijeunavirus
- Gattung Toutatisvirus
- Gattung Vhmlvirus (3 Spezies)
- Spezies Vibrio-Virus VHML (wiss. Vhmlvirus VHML)
- Gattung Vibakivirus
- Gattung Wellingtonvirus
- Gattung Wifcevirus
- Gattung Yokohamavirus (früher Msw3virus)
- Gattung Yoloswagvirus
- Gattung Yongloolinvirus
- Gattung „Cbasmlikevirus“ (vorgeschlagen)
- Spezies „Cellulophaga-Phage phiSM“
- Spezies „Cellulophaga-Phage phi3:1“
- Spezies „Cellulophaga-Phage phi3ST:2“
- Spezies „Cellulophaga-Phage phi38:2“
- Spezies „Cellulophaga-Phage phi47:1“
- Gattung „Cyanomyovirus“ (informell, nicht zugeordnete Cyanophagen mit Myoviren-Morphologie)
- Spezies „Synechococcus-Phage S-RSM2“ (en. „Synechococcus phage S-RSM2“ alias „Bacteriophage S-RSM2“)
- Spezies „Synechococcus-Phage S-BM4“ (en. „Synechococcus phage S-BM4“ alias „Cyanophage S-BM4“, „Bacteriophage S-BM4“)
- Spezies „Synechococcus-Phage S-WHM1“ (en. „Synechococcus phage S-WHM1“ alias „Cyanophage S-WHM1“)
- Spezies „Synechococcus-Phage S-RSM88“ (en. „Synechococcus phage S-RSM88“ alias „Cyanophage S-RSM88“, „Bacteriophage S-RSM88“)
- Spezies „Anabaena-Phage N-1“ (alias „Cyanophage N1“)
- Spezies „Cyanophage A-1(L)“ (alias „Cyanophage A-1“)
- Gattung „Shigella phage Sfv and relatives“ (informell, zu unterscheiden von Spezies Rabbit fibroma virus alias Shope fibroma virus, Gattung Leporipoxvirus, Poxviridae und Sulfolobus filamentous virus 1, Tristromaviridae)
- Spezies „Enterobacteria-Phage SfV“ (alias „Shigella-Phage SfV“, „Shigella flexneri bacteriophage V“)
- ohne Gattungszuweisung
Anmerkungen Bearbeiten
- ↑ Das Material wurde von dieser Quelle kopiert, die unter einer Creative Commons Attribution 4.0 International License verfügbar ist.
Literatur Bearbeiten
- A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (Hrsg.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012, ISBN 978-0-12-384684-6, S. 46–62.
- C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London / San Diego 2004.
- C. M. Mizuno, F. Rodriguez-Valera, N. E. Kimes, R. Ghai: Expanding the Marine Virosphere Using Metagenomics. In: PLoS Genetics. 9. Jahrgang, Nr. 12, 2013, S. e1003987, doi:10.1371/journal.pgen.1003987, PMID 24348267, PMC 3861242 (freier Volltext) – (englisch).
Weblinks Bearbeiten
- Bildergalerie der Familie Myoviridae. Big Picture Book of Viruses
- Karthik Chamakura: How does the energy for contraction get built into the tails of myophages? Research Projekt at Texas A&M University AgriLife Research. Center for Phage Technology.
Einzelnachweise Bearbeiten
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- ↑ Dann Turner, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy. In: MDPI Viruses, Band 13, Nr. 3, Section Bacterial Viruses, 18. März 2021, 506, doi:10.3390/v13030506
- ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
- Y. Liu et al. (ICTV Archaeal Viruses Subcommittee): Proposal 2021.001A. Create three new orders and 14 new families in the class Caudoviricetes (Duplodnaviria, Uroviricota) for classification of archaeal tailed viruses. Oktober 2020. Siehe insbes. Tbl. 1.
- SIB: Ackermannviridae, auf: ViralZone
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- Ana Senčilo, Elina Roine: A Glimpse of the genomic diversity of haloarchaeal tailed viruses. In: Front. Microbiol., Band 5, Nr. 84, 12. März 2014; Reihe: Proceedings of Halophiles 2013: The international congress on halophilic microorganisms; doi:10.3389/fmicb.2014.00084, PMC 3950731 (freier Volltext), PMID 24659986.
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- NCBI: Campylobacter phage F379 (species)
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- S. B. Santos, A. M. Kropinski, P.-J. Ceyssens, H.-W. Ackermann, A. Villegas, R. Lavigne, V. N. Krylov, C. M. Carvalho, E. C. Ferreira, J. Azeredo: Genomic and Proteomic Characterization of the Broad-Host-Range Salmonella Phage PVP-SE1: Creation of a New Phage Genus. In: Journal of Virology. 85. Jahrgang, Nr. 21, 2011, S. 11265–11273, doi:10.1128/JVI.01769-10, PMID 21865376, PMC 3194984 (freier Volltext) – (englisch).
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- NCBI: Cyanophage A-1(L) (species), equivalent Cyanophage A-1.
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- Enterobacteria phage SfV (species). NCBI
- ↑ Yunfen Hua, Tingting Luo, Yiqi Yang, Dong Dong, Rui Wang, Yanjun Wang, Mengsha Xu, Xiaokui Guo, Fupin Hu, Ping He: Phage Therapy as a Promising New Treatment for Lung Infection Caused by Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii in Mice. In: Front. Microbiol., 9. Januar 2018; doi:10.3389/fmicb.2017.02659
- NCBI: Ochrobactrum phage vB_OspM_OC (species)
- Przemyslaw Decewicz, Piotr Golec, Mateusz Szymczak, Monika Radlinska, Lukasz Dziewit: Identification and Characterization of the First Virulent Phages, Including a Novel Jumbo Virus, Infecting Ochrobactrum spp. In: MDPI Int. J. Mol. Sci, Band 21, Nr. 6, Special Issue Bacteriophage Molecular Studies, 18. März 2020, 2096; doi:10.3390/ijms21062096
- NCBI: Pseudomonas phage OBP (species)
- NCBI: Sphingomonas phage PAU (species)
- Richard Allen White III, Curtis A. Suttle: The Draft Genome Sequence of Sphingomonas paucimobilis Strain HER1398 (Proteobacteria), Host to the Giant PAU Phage, Indicates That It Is a Member of the Genus Sphingobacterium (Bacteroidetes). In: Genome Announc., Band 1, Nr. 4, Juli-August 2013, S. e00598-13; doi:10.1128/genomeA.00598-13, PMID 23929486, PMC 3738902 (freier Volltext)
- NCBI: Bacillus phage PBS2 (species)
- NCBI: Staphylococcus phage S6 (species)
- Natalia Bagińska, Anna Pichlak, Andrzej Górski1, Ewa Jończyk-Matysiak: Specific and Selective Bacteriophages in the Fight against Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii (PDF) in: Virologica Sinica, Band 34, S. 347–357; doi:10.1007/s12250-019-00125-0, Tbl. 1
- Kaitlyn E. Kortright, Rachel E. Done, Benjamin K. Chan, Valeria Souza, Paul E. Turner: Selection for phage resistance reduces virulence of Shigella flexneri, in: ASM Appl. and Env. Microbiol. (AEM), 17. November 2021, doi:10.1128/AEM.01514-21. Dazu: Erin Garcia de Jesús: A bacteria-virus arms race could lead to a new way to treat shigellosis, auf: ScinceNews vom 14. Dezember 2021.
- Basem Al-Shayeb, Rohan Sachdeva, L. Chen, Jillian F. Banfield et al.: Clades of huge phages from across Earth’s ecosystems. In: Nature, 12. Februar 2020, doi:10.1038/s41586-020-2007-4
- Ed Yong: A Huge Discovery in the World of Viruses. The Atlantic, 20. Februar 2020
- Audra E. Devoto, Joanne M. Santini et al.: Megaphages infect Prevotella and variants are widespread in gut microbiomes. In: Nature Microbiology, Band 4, S. 693–700, 28. Januar 2019, doi:10.1038/s41564-018-0338-9, insbes. Tabelle 1 und Supplementary Figure 11.
- NCBI: Lak megaphage sp. (species)