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Schizotequatrovirus Elektronenmikroskopische Aufnahmeeines Virions von SchizotequattrovirusSystematikKlassifikation Vire

Schizotequatrovirus

Schizotequatrovirus

Elektronenmikroskopische Aufnahme
eines Virions von Schizotequattrovirus

Systematik
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch, tailed
(Myoviren)
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Schizotequatrovirus
Links
NCBI Taxonomy: 1198137
ViralZone (Expasy, SIB): 2820
ICTV Taxon History: 201900313

Die Gattung Schizotequatrovirus (veraltet Schizot4virus oder Schizot4likevirus) umfasst Viren der Unterfamilie Tevenvirinae der Familie Straboviridae in der Klasse Caudoviricetes. Ihre Virionen (Viruspartikel) sind vom Morphotyp der Myoviren mit Kopf-Schwanz-Aufbau. Ihre natürlichen Wirte sind Bakterien, es handelt sich also um Bakteriophagen (nicht-taxonomische Klassifizierung). Mit Stand März 2022 gibt es in dieser Gattung vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) drei anerkannte Arten (Spezies), darunter die Typusart Vibrio-Virus KVP40 (wiss. Schizotequatrovirus KVP40).

Systematik Bearbeiten

Mit der neuen Master Species List (MSL) #37 (Ende März 2022) hat das ICTV die frühere Ordnung Caudovirales und Familie Myoviridae aufgelöst. Die Ordnung ist jetzt ersetzt durch die Klasse Caudoviricetes, die Myoviren sind nur noch ein nicht-taxonomischer Morphotyp; neue Familie ist jetzt Straboviridae.

Zur Gattung Schizotequatrovirus gehören (mit Stand Ende März 2022) folgende vom ICTV per Master Species List (MSL) 2021 v1 bestätigten bzw. vom US National Center for Biotechnology Information (NCBI) aufgeführten unklassifizierten Vertreter:

Baltimore-Gruppe 1: dsDNA

Die Spezies Vibrio-Virus nt1 (en. Vibrio virus nt1, mit Vibrio-Phage nt-1) wurde als Mylasvirus persius in die neue Gattung Mylasvirus der Straboviridae verschoben.

Aufbau Bearbeiten

Schemazeichnung eines Virus­teilchens des Vibrio-Virus KVP40 (Querschnitt und Seitenansicht)

Die Virionen (Virusteilchen) von Viren der Gattung Schizotequatrovirus sind nicht umhüllt und haben einen Kopf und Schwanz. Der Kopf ist ein verlängertes Ellipsoid (englisch prolate spheroid) mit einer Länge von ungefähr 140 nm und einer Breite von 70 nm. Der Schwanz ist ca. 140 nm lang, hat 6 lange Endfasern (en. terminal fibers), 6 kurze Spikes (Peplomere) und eine kleine Grundplatte. Der Schwanz ist von einer Hülle umgeben, die sich beim Zusammenziehen löst und um den Schwanzkern gleitet.

Das Kapsid hat eine Symmetrie mit einer Triangulationszahl T=13 Q=21. Die Virionen sind unbehüllt.

Genom Bearbeiten

Das Genom ist ein einzelner linearer dsDNA-Strang, d. h. unsegmentiert (monopartit).

Alle drei Arten wurden vollständig sequenziert. Die Genomlänge beträgt zwischen 244 und 248 kbp (Kilobasenpaare), das Genom kodiert 381 bis 405 Proteinen. Das vollständige Genom ist zusammen mit dem vollständigen Genom für den (bislang nicht klassifizierten) Vibrio-Phagen VH7D beim NCBI abrufbar.

Vermehrungszyklus Bearbeiten

Die Virusreplikation ist zytoplasmatisch (d. h. sie geschieht im Zellplasma, nicht im Kern). Die Virionen binden sich unter Verwendung ihrer terminalen Fasern an die Wirtszelle. Mit Hilfe eines viralen Exolysins (Murein-Hydrolase) wird die Zellwand des Bakteriums so weit abgebaut, dass die virale DNA durch Kontraktion der Schwanzhülle in das Wirtszytoplasma ausgestoßen wird. Die Methode der Transkription ist die DNA-gestützte Transkription. Sobald die viralen Gene repliziert wurden, wird (als Vorläufer des Kapsids) ein Prokapsid zusammengesetzt (assembliert) und verpackt. Anschließend wird auch der Schwanz assembliert und schließlich werden die reifen Virionen durch Lyse des Bakteriums (Platzen mit Tod) freigesetzt.

Die Übertragung geschieht durch passive Diffusion.

Historie Bearbeiten

Laut dem ICTV-Bericht 2010–11 wurde die Gattung Schizot4likevirus erstmals als neue Gattung akzeptiert, gleichzeitig mit ihrer Typusart Vibrio Phage KVP40 und der sie enthaltenden Unterfamilie Tevenvirinae. Gleichzeitig wurde der Vibrio-Phage nt-1 aus seiner vorherigen Klassifizierung T4-like viruses (später T4virus, heute Tequatrovirus) in diese Gattung verschoben. 2015 wurde die Gattung in Schizot4virus umbenannt. Mit der Master Species List #34 wurde die Gattung 2019 erneut umbenannt (nach Schizotequatrovirus).

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
  2. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterobacteria phage T4, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  3. ↑ Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 30. März 2020.
  4. ↑ ICTV Master Species List 2018b v2 MSL #34v, März 2019
  5. ncbi. Schizotequatrovirus (genus)
  6. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2021.v1, New MSL including all taxa updates since the 2020 release, March 2022 (MSL #37)
  7. NCBI: unclassified Schizotequatrovirus
  8. ICTV Taxonomy history: Schizot4virus. In: International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).
  9. NCBI: Vibrio phage VH1_2019 (species)
  10. NCBI: Vibrio phage ValKK3 (no rank)
  11. NCBI: Vibrio phage phi-Grn1 (species)
  12. NCBI: Vibrio phage VH7D (no rank)
  13. NCBI: unclassified Schizotequatrovirus
  14. NCBI: Vibrio phage 1.081.O._10N.286.52.C2 (species)
  15. NCBI: Vibrio phage phi-ST2 (species)
  16. NCBI: Vibrio phage phiVA3 (species)
  17. NCBI: Vibrio phage phi V05 (species)
  18. NCBI: Vibrio phage phi V07 (species)
  19. NCBI: Vibrio phage phi V09 (species)
  20. NCBI: Vibrio phage vB_ValM_R10Z (species)
  21. NCBI: Vibrio phage vB_ValM_R11Z (species)
  22. NCBI: Schizot4virus Complete Genomes. Abgerufen am 30. März 2020.
  23. ViralZone: Degradation of host peptidoglycans during virus entry, SIB ExPASy; vgl. auch Endolysine
  24. ICTV Proposal

Weblinks Bearbeiten

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Veröffentlichungsdatum:
SchizotequatrovirusElektronenmikroskopische Aufnahmeeines Virions von SchizotequattrovirusSystematikKlassifikation VirenRealm Duplodnaviria 2 Reich Heunggongvirae 2 Phylum Uroviricota 2 Klasse Caudoviricetes 1 Ordnung incertae sedisFamilie Straboviridae 1 Unterfamilie incertae sedisGattung SchizotequatrovirusTaxonomische MerkmaleGenom dsDNA linearBaltimore Gruppe 1Symmetrie ikosaedrisch tailed Myoviren Hulle keineWissenschaftlicher NameSchizotequatrovirusLinksNCBI Taxonomy 1198137ViralZone Expasy SIB 2820ICTV Taxon History 201900313Die Gattung Schizotequatrovirus veraltet Schizot4virus oder Schizot4likevirus umfasst Viren der Unterfamilie Tevenvirinae der Familie Straboviridae in der Klasse Caudoviricetes Ihre Virionen Viruspartikel sind vom Morphotyp der Myoviren mit Kopf Schwanz Aufbau Ihre naturlichen Wirte sind Bakterien es handelt sich also um Bakteriophagen nicht taxonomische Klassifizierung Mit Stand Marz 2022 gibt es in dieser Gattung vom International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV drei anerkannte Arten Spezies darunter die Typusart Vibrio Virus KVP40 wiss Schizotequatrovirus KVP40 3 4 5 Inhaltsverzeichnis 1 Systematik 2 Aufbau 3 Genom 4 Vermehrungszyklus 5 Historie 6 Einzelnachweise 7 WeblinksSystematik BearbeitenMit der neuen Master Species List MSL 37 Ende Marz 2022 hat das ICTV die fruhere Ordnung Caudovirales und Familie Myoviridae aufgelost Die Ordnung ist jetzt ersetzt durch die Klasse Caudoviricetes die Myoviren sind nur noch ein nicht taxonomischer Morphotyp neue Familie ist jetzt Straboviridae 6 Zur Gattung Schizotequatrovirus gehoren mit Stand Ende Marz 2022 folgende vom ICTV per Master Species List MSL 2021 v1 bestatigten 6 bzw vom US National Center for Biotechnology Information NCBI aufgefuhrten unklassifizierten 7 Vertreter Baltimore Gruppe 1 dsDNA Klasse Caudoviricetes mit Morphotyp MyovirenFamilie Straboviridae 6 ohne zugewiesene UnterfamilieGenus Schizotequatrovirus veraltet Schizot4virus Schizot4likevirus 8 Spezies Schizotequatrovirus KVP40 de Vibrio Virus KVP40 fruher Vibrio virus KVP40 mit Typusstamm Vibrio Phage KVP40 und Vibrio Phage VH1 2019 9 Spezies Schizotequatrovirus valkk3 de Vibrio Virus ValKK3 fruher Vibrio virus ValKK3 mit Vibrio Phage ValKK3 10 und Vibrio Phage phi Grn1 11 Spezies Schizotequatrovirus vh7d de Vibrio Virus VH7d mit Vibrio Phage VH7D 12 vorgeschlagene Vertreter nach NCBI Stand 3 Februar 2021 13 Spezies Vibrio Phage 1 081 O 10N 286 52 C2 14 Spezies Vibrio Phage phi ST2 15 Spezies Vibrio Phage phiVA3 alias Vibrio Phage ValB1 HC 16 Spezies Vibrio Phage phi V05 17 Spezies Vibrio Phage phi V07 18 Spezies Vibrio Phage phi V09 19 Spezies Vibrio Phage vB ValM R10Z 20 Spezies Vibrio Phage vB ValM R11Z 21 dd dd dd Die Spezies Vibrio Virus nt1 en Vibrio virus nt1 mit Vibrio Phage nt 1 wurde als Mylasvirus persius in die neue Gattung Mylasvirus der Straboviridae verschoben Aufbau Bearbeiten nbsp Schemazeichnung eines Virus teilchens des Vibrio Virus KVP40 Querschnitt und Seitenansicht Die Virionen Virusteilchen von Viren der Gattung Schizotequatrovirus sind nicht umhullt und haben einen Kopf und Schwanz Der Kopf ist ein verlangertes Ellipsoid englisch prolate spheroid mit einer Lange von ungefahr 140 nm und einer Breite von 70 nm Der Schwanz ist ca 140 nm lang hat 6 lange Endfasern en terminal fibers 6 kurze Spikes Peplomere und eine kleine Grundplatte Der Schwanz ist von einer Hulle umgeben die sich beim Zusammenziehen lost und um den Schwanzkern gleitet 3 Das Kapsid hat eine Symmetrie mit einer Triangulationszahl T 13 Q 21 Die Virionen sind unbehullt Genom BearbeitenDas Genom ist ein einzelner linearer dsDNA Strang d h unsegmentiert monopartit 3 Alle drei Arten wurden vollstandig sequenziert Die Genomlange betragt zwischen 244 und 248 kbp Kilobasenpaare das Genom kodiert 381 bis 405 Proteinen Das vollstandige Genom ist zusammen mit dem vollstandigen Genom fur den bislang nicht klassifizierten Vibrio Phagen VH7D beim NCBI abrufbar 22 Vermehrungszyklus BearbeitenDie Virusreplikation ist zytoplasmatisch d h sie geschieht im Zellplasma nicht im Kern Die Virionen binden sich unter Verwendung ihrer terminalen Fasern an die Wirtszelle Mit Hilfe eines viralen Exolysins Murein Hydrolase 23 wird die Zellwand des Bakteriums so weit abgebaut dass die virale DNA durch Kontraktion der Schwanzhulle in das Wirtszytoplasma ausgestossen wird Die Methode der Transkription ist die DNA gestutzte Transkription Sobald die viralen Gene repliziert wurden wird als Vorlaufer des Kapsids ein Prokapsid zusammengesetzt assembliert und verpackt Anschliessend wird auch der Schwanz assembliert und schliesslich werden die reifen Virionen durch Lyse des Bakteriums Platzen mit Tod freigesetzt 3 Die Ubertragung geschieht durch passive Diffusion 3 Historie BearbeitenLaut dem ICTV Bericht 2010 11 wurde die Gattung Schizot4likevirus erstmals als neue Gattung akzeptiert gleichzeitig mit ihrer Typusart Vibrio Phage KVP40 und der sie enthaltenden Unterfamilie Tevenvirinae Gleichzeitig wurde der Vibrio Phage nt 1 aus seiner vorherigen Klassifizierung T4 like viruses spater T4virus heute Tequatrovirus in diese Gattung verschoben 24 2015 wurde die Gattung in Schizot4virus umbenannt Mit der Master Species List 34 wurde die Gattung 2019 erneut umbenannt nach Schizotequatrovirus 4 Einzelnachweise Bearbeiten a b ICTV ICTV Master Species List 2021 v2 New MSL including some corrections a b c ICTV ICTV Taxonomy history Enterobacteria phage T4 EC 51 Berlin Germany July 2019 Email ratification March 2020 MSL 35 a b c d e Viral Zone ExPASy abgerufen am 30 Marz 2020 a b ICTV Master Species List 2018b v2 MSL 34v Marz 2019 ncbi Schizotequatrovirus genus a b c ICTV ICTV Master Species List 2021 v1 New MSL including all taxa updates since the 2020 release March 2022 MSL 37 NCBI unclassified Schizotequatrovirus ICTV Taxonomy history Schizot4virus In International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV Abgerufen im 1 Januar 1 NCBI Vibrio phage VH1 2019 species NCBI Vibrio phage ValKK3 no rank NCBI Vibrio phage phi Grn1 species NCBI Vibrio phage VH7D no rank NCBI unclassified Schizotequatrovirus NCBI Vibrio phage 1 081 O 10N 286 52 C2 species NCBI Vibrio phage phi ST2 species NCBI Vibrio phage phiVA3 species NCBI Vibrio phage phi V05 species NCBI Vibrio phage phi V07 species NCBI Vibrio phage phi V09 species NCBI Vibrio phage vB ValM R10Z species NCBI Vibrio phage vB ValM R11Z species NCBI Schizot4virus Complete Genomes Abgerufen am 30 Marz 2020 ViralZone Degradation of host peptidoglycans during virus entry SIB ExPASy vgl auch Endolysine ICTV ProposalWeblinks BearbeitenICTV Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Schizotequatrovirus amp oldid 238816499