Diese Familie wurde vom ICTV eingerichtet, um alle T4-ähnlichen Phagen, die histotrophe Bakterien infizieren, zusammenzufassen – einschließlich der bestehenden Unterfamilien Tevenvirinae, Emmerichvirinae und Twarogvirinae. Um Monophylie herzustellen, wurden gleichzeitig die folgenden Gattungen aus der Unterfamilie Tevenvirinae ausgegliedert: Schizotequatrovirus, Slopekvirus, Pseudotevenvirus und Krischvirus . Die T4-ähnlichen Cyanophagen wurden dagegen in der Familie Kyanoviridae zusammengefasst. Phylogenetische Analysen zeigen eine tiefe Verzweigung zwischen den damals neu gebildeten Familien Straboviridae und Kyanoviridae.
BeschreibungBearbeiten
Die Viruspartikel (Virionen) der Straboviridae haben die für Mitglieder der Caudoviricetes typische Kopf-Schwanz-Struktur, das Kapsid des Kopfes hat keine Hülle. Der längliche ist 120 nm lang und 86 nm breit. Das Kapsid hat eine längliche (d. h. nicht-isometrische) ikosaedrische SymmetrieT=13 Q=21 und besteht aus 152 Kapsomeren. Der Schwanz ist kontraktil und hat 6 lange Endfasern, dazu 6 kurze Stacheln (Spikes) und eine kleine Grundplatte.
Genom und ProteomBearbeiten
Die Straboviridae haben ein lineares dsDNA-Genom mit einer Länge von etwa 169 kbp (Kilobasenpaaren), das für etwa 300 Proteinekodiert. Die Gene werden von Operonstranskribiert. Sie kodieren u. a. für folgende Gene:
EinVirion der Gattung SchizotequatrovirusVirionen des Stammes Vibriophage ϕpp2 der Spezies Schizotequatrovirus KVP40Gattung: Schizotequatrovirus (früher Schizot4virus, Schizot4likevirus; früher zu Tevenvirinae; 3 Spezies), mit
Spezies: Vibrio-Virus KVP40 (wiss. Schizotequatrovirus KVP40), mit
Unter histotrophen (oder histiotrophen) Bakterien werden solche verstanden, die im Gewebe (insbes. von Tieren wie den Landwirbeltieren) leben und sich dort auf üblicherweise deren Kosten (parasitisch) ernähren, vgl. Histiotrophe.
StraboviridaeSchemazeichnung einesVirions von Enterobacteria Phage T4 Gattung Tequattrovirus Querschnitte und Seitenansicht SystematikKlassifikation VirenRealm DuplodnaviriaReich HeunggongviraePhylum UroviricotaKlasse CaudoviricetesOrdnung incertae sedisFamilie StraboviridaeTaxonomische MerkmaleGenom dsDNA linearBaltimore Gruppe 1Symmetrie ikosaedrisch tailed Myoviren Wissenschaftlicher NameStraboviridaeLinksNCBI Taxonomy 2946170ViralZone Expasy SIB 10344ICTV Taxon History 202213666Straboviridae ist die Bezeichnung fur eine Familie von Viren mit sog Kopf Schwanz Aufbau Klasse Caudoviricetes die Bakterien infizieren solche bakteriellen Viren werden auch Bakteriophagen genannt Die Familie wurde im Marz April 2022 vom International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV eingerichtet 1 Inhaltsverzeichnis 1 Forschungsgeschichte 2 Beschreibung 3 Genom und Proteom 4 Replikation 5 Etymologie 6 Systematik 7 Wirtsspektrum 8 Anmerkungen 9 EinzelnachweiseForschungsgeschichte BearbeitenDiese Familie wurde vom ICTV eingerichtet um alle T4 ahnlichen Phagen die histotrophe Bakterien A 1 infizieren zusammenzufassen einschliesslich der bestehenden Unterfamilien Tevenvirinae Emmerichvirinae und Twarogvirinae Um Monophylie herzustellen wurden gleichzeitig die folgenden Gattungen aus der Unterfamilie Tevenvirinae ausgegliedert Schizotequatrovirus Slopekvirus Pseudotevenvirus und Krischvirus Die T4 ahnlichen Cyanophagen wurden dagegen in der Familie Kyanoviridae zusammengefasst Phylogenetische Analysen zeigen eine tiefe Verzweigung zwischen den damals neu gebildeten Familien Straboviridae und Kyanoviridae 2 Beschreibung BearbeitenDie Viruspartikel Virionen der Straboviridae haben die fur Mitglieder der Caudoviricetes typische Kopf Schwanz Struktur das Kapsid des Kopfes hat keine Hulle Der langliche ist 120 nm lang und 86 nm breit Das Kapsid hat eine langliche d h nicht isometrische ikosaedrische Symmetrie T 13 Q 21 und besteht aus 152 Kapsomeren Der Schwanz ist kontraktil und hat 6 lange Endfasern dazu 6 kurze Stacheln Spikes und eine kleine Grundplatte 3 2 Genom und Proteom BearbeitenDie Straboviridae haben ein lineares dsDNA Genom mit einer Lange von etwa 169 kbp Kilobasenpaaren das fur etwa 300 Proteine kodiert Die Gene werden von Operons transkribiert Sie kodieren u a fur folgende Gene 3 A 2 Desoxyadenosin Methylase DNA Adenin Methylase P04392 DNA abhangige DNA Polymerase P04415 DNA Topoisomerase P09176 DNA Primase P04520 Serin Protease Peptidase S77 P06807 ADP Ribosyl Transferase P39423 P39421 NAD Arginin ADP Ribosyl Transferase P12726 DNA Ligase P00970 RNA Ligase P32277 Exonuklease P04521 Endonuklease P04418 P07059 P39250 Terminase P17312 Desoxycytidin Desaminase P16006 Polynucleotid Kinase P06855 Ribonucleosid Diphosphat Reduktase P32282 Desoxynukleotid Monophosphat Kinase P04531 Dihydrofolatreduktase P04382 Thymidylat Synthase P00471 Thymidinkinase P13300 Ribonuklease H P13319 Exo Desoxyribonuklease P04536 Endolysin P09176 Replikation BearbeitenDie Replikation der Straboviridae findet im Zytoplasma der Wirtszellen statt Die einzelnen Schritte sind wie folgt 3 Adsorption Die Viruspartikel der Phagen heften sich uber ihre Schwanzfasern an die Zielzelle an Das Virus Exolysin Murein Hydrolase 4 baut die Zellwand lokal ab Injektion der Virus DNA in das Zytoplasma der Wirtszelle durch Kontraktion der Schwanzscheide Transkription und Translation von fruhen Genen Replikation des DNA Genoms Transkription und Translation von spaten Genen Assembly Aufbau eines leeren Prokapsids und Verpackung des Genoms Zusammenbau der Virusschwanzfasern und des Virusschwanzes Die reifen Virionen werden durch Lyse aus der Zelle freigesetzt Etymologie BearbeitenDie Bezeichnung der Familie Straboviridae verweist auf den griechischen Philosophen Strabon A 3 der Suffix viridae steht fur Virusfamilien 1 2 Systematik BearbeitenInnere Systematik der Familie Straboviridae Stand 4 November 2023 Familie Straboviridae 36 Gattungen 5 Unterfamilie Emmerichvirinae Gattung Ceceduovirus 3 Spezies Gattung Ishigurovirus 1 Spezies Spezies Aeromonas Virus 65 wiss Ishigurovirus osborne nbsp EM Aufnahme zweier Virionen der Gattung Tequatrovirus nbsp Escherichia Phage T4 Gattung TequatrovirusUnterfamilie Tevenvirinae 6 Gattung Dhakavirus fruher Js98virus Gattung Gelderlandvirus fruher S16virus Gattung Jiaodavirus fruher Jd18virus Gattung Kagamiyamavirus Gattung Kanagawavirus Gattung Karamvirus fruher Cc31virus Gattung Moonvirus Gattung Mosigvirus fruher Rb69virus Gattung Mosugukvirus Gattung Roskildevirus Gattung Tegunavirus fruher Tg1virus Gattung Tequatrovirus fruher T4virus T4likevirus T4 ahnliche Viren 7 mit Tequatrovirus T4 ohne Gattungszuweisung 1 Spezies Unterfamilie Twarogvirinae Gattung Acajnonavirus 1 Spezies Gattung Hadassahvirus 2 Spezies Gattung Lasallevirus 1 Spezies Gattung Lazarusvirus 8 Spezies Gattung Zedzedvirus 1 Spezies Spezies Acinetobacter Virus ZZ1 wiss Zedzedvirus zz1 ohne Unterfamilienzuweisung 15 Gattungen Gattung Angelvirus 1 Spezies Gattung Biquartavirus 1 Spezies Gattung Bragavirus 3 Spezies Gattung Carettavirus 1 Spezies Gattung Chrysonvirus 1 Spezies Gattung Cinqassovirus 2 Spezies Spezies Aeromonas Virus Aeh1 wiss Cinqassovirus aeh1 Gattung Gualtarvirus 1 Spezies Gattung Jiangsuvirus 1 Spezies Gattung Krischvirus fruher Rb49virus fruher zu Tevenvirinae 6 Spezies Spezies Escherichia Virus ECD7 wiss Krischvirus ecd7 Spezies Escherichia Virus GEC3S wiss Krischvirus gec3s Spezies Escherichia Virus JSE wiss Krischvirus jse Spezies Escherichia Virus phi1 wiss Krischvirus georgiaone Spezies Escherichia Virus RB49 wiss Krischvirus RB49 Gattung Mylasvirus ausgegliedert aus Schizotequatrovirus 1 Spezies Spezies Vibrio Virus nt1 wiss Mylasvirus persius mit Vibrio Phage nt 1 Gattung Nanhuvirus 1 Spezies Spezies Nanhuvirus LPCS28 mit Cronobacter Phage LPCS28 Gattung Pseudotevenvirus 9 Spezies Spezies Escherichia Virus RB16 wiss Pseudotevenvirus RB16 Spezies Escherichia Virus RB43 wiss Pseudotevenvirus RB43 nbsp EinVirion der Gattung Schizo tequatro virus nbsp Virionen des Stammes Vibriophage ϕpp2 der Spezies Schizo tequatro virus KVP40Gattung Schizotequatrovirus fruher Schizot4virus Schizot4likevirus fruher zu Tevenvirinae 3 Spezies 8 mit Spezies Vibrio Virus KVP40 wiss Schizotequatrovirus KVP40 mit Vibrio Phage KVP40 Typusstamm mit Vibrio Phage phi pp2 alias Vibriophage ϕpp2 Spezies Vibrio Virus ValKK3 wiss Schizotequatrovirus valkk3 Spezies Vibrio Virus VH7D wiss Schizotequatrovirus vh7d mit Vibrio Phage VH7D Gattung Slopekvirus fruher Kp15virus 5 Spezies A 4 Spezies Enterobacter Virus Eap3 Spezies Klebsiella Virus KP15 wiss Slopekvirus kp15 ehem Typus 9 Spezies Klebsiella Virus KP27 wiss Slopekvirus kp27 Spezies Klebsiella Virus Matisse wiss Slopekvirus matisse Spezies Klebsiella Virus Miro Spezies Klebsiell Virus PMBT1 mit Klebsiella Phage P KP2 Klebsiella Phage PMBT1 Klebsiella Phage vB KpnM M1 alias Phage vB Kp M1 10 9 Gattung Tulanevirus fruher Secunda5virus 8 Spezies Spezies Aeromonas Virus 25 wiss Tulanevirus bteighttwo mit Aeromonas Phage 25 engl Aeromonas phage 25 Wirtsspektrum BearbeitenDie Wirte der Straboviridae sind Gammaproteobakterien hauptsachlich aus der Ordnung Enterobacterales sowie einiger anderer Dazu gehoren A 5 11 Enterobacterales Citrobacter Cronobacter Erwinia Escherichia Klebsiella Pectobacterium Salmonella Serratia Shigella Yersinia Moraxellales 12 Acinetobacter Vibrionales Vibrio Aeromonadales Aeromonas Anmerkungen Bearbeiten Unter histotrophen oder histiotrophen Bakterien werden solche verstanden die im Gewebe insbes von Tieren wie den Landwirbeltieren leben und sich dort auf ublicherweise deren Kosten parasitisch ernahren vgl Histiotrophe In Klammern sind die UniProt IDs angegeben Der Zusammenhang ist unklar 1 Die Gattung Slopekvirus nicht zu verwechseln mit der Unterfamilie Slopekvirinae in Familie Autographiviridae siehe Systematik Einzelnachweise Bearbeiten a b c ICTV Taxon Details Family Straboviridae a b c Andrew Millard Richard Puxty Dan White Lucy Gannon Christian Harrison Ryan Cook Evelien M Adriaenssens Dann Turner Create two new families KyanoviridaeandStraboviridae Caudoviricetes Vorschlag 2021 082B zip docx Auf ICTV ictv global a b c SIB Straboviridae Auf Expasy ViralZone SIB Degradation of host peptidoglycans during virus entry Auf Expasy ViralZone ICTV Taxonomy Browser SIB Tevenvirinae SIB Tequatrovirus syn T4virus und T4likevirus SIB Schizotequatrovirus syn Schizot4likevirus Auf ViralZone a b Anais Eskenaz et al Combination of pre adapted bacteriophage therapy and antibiotics for treatment of fracture related infection due to pandrug resistantKlebsiella pneumoniae In Nature Communications Band 13 Nr 302 18 Januar 2022 doi 10 1038 s41467 021 27656 z insbes Fig 1 und Fig 3 Dazu Conor Fehly Special Phage Therapy Clears a Patient s Resistant Infection After 798 Days Aus sciencealert vom 21 Januar 2022 NCBI Taxonomy Browser Klebsiella phage vB KpnM M1 species NCBI Taxonomy Browser Straboviridae Details Straboviridae family LPSN Order Moraxellales Liao et al 2021 Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Straboviridae amp oldid 239433295
