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TristomaviridaeEM Aufnahme eines TTV1 Virions Gattung Alphatristromavirus Balken 100 nm SystematikKlassifikation VirenRealm nicht klassifiziert 2 Reich Zilligvirae 2 Phylum Taleaviricota 2 Klasse Tokiviricetes 2 3 Ordnung Primavirales 2 Familie Tristomaviridae 1 Taxonomische MerkmaleGenom dsDNA linearBaltimore Gruppe 1Symmetrie helikalHulle vorhandenWissenschaftlicher NameTristomaviridaeLinksNCBI Taxonomy 2022738 Familie 2022739 Gattung ViralZone Expasy SIB 8556 Familie 8557 Gattung ICTV Taxon History 201905320 Familie 201905322 Gattung Tristromaviridae Tristomaviren ist die Bezeichnung einer Familie von Viren mit derzeit Stand Mitte Marz 2021 einer einzigen vom International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV offiziell bestatigten Gattung Alphatristromavirus fruher zu Alphalipothrixvirus in Familie Lipothrixviridae 4 Die Mitglieder der Gattung Alphatristromavirus sind langliche behullte Viren mit einer doppelstrangigen DNA dsDNA als Genom Als naturliche Wirte dienen die thermophilen Archaeen der Gattungen Thermoproteus en etwa Thermoproteus tenax und Pyrobaculum en beide in der Familie Thermoproteaceae en der Crenarchaeota und sind als thermophile Organismen an heissen vulkanischen Quellen und Geysiren zu finden Derzeit gibt es nur zwei bestatigte Spezies Arten in dieser Gattung Thermoproteus tenax virus 1 TTV1 5 und die Typusart Pyrobaculum filamentous virus 1 PFV1 6 Ein weiteres vorgeschlagenes Mitglied der Familie wenn nicht der Gattung ist Pyrobaculum filamentous virus 2 PFV2 3 Die Bezeichnung Tristroma leitet sich ab aus dem Griechischen tria fur drei und stroma fur Schicht 5 Inhaltsverzeichnis 1 Beschreibung 1 1 Morphologie 1 2 Genom 1 3 Proteine 2 Reproduktionszyklus 3 Systematik 4 Quellen 5 Einzelnachweise 6 WeblinksBeschreibung BearbeitenMorphologie Bearbeiten nbsp Schemazeichnung eines Virions der Gattung Alphatristromavirus im Querschnitt nbsp EM Aufnahme intakter und teilweise zerfallener TTV1 Virionen Gattung Alphatristromavirus Hulle und Kern zeigend Balken 100 nm Die Virusteilchen Virionen der Gattung Alphatristromavirus sind umhullt und erscheinen unter dem Elektronenmikroskop als gerade nicht flexible Stabchen Der Durchmesser betragt etwa 38 nm bei einer Lange von etwa 410 nm An beiden Enden befinden sich asymmetrische Verdickungen Ein Virusteilchen von Thermoproteus Tenax Virus 1 TTV 1 hat eine Molare Masse von etwa 3 3 x 108 Da und zeigt bei Dichtegradientenzentrifugation in Casiumchlorid eine Dichte von 1 25 g cm Sie sind bei 100 C noch vollstandig stabil nach Autoklavierung bei 120 C ist stets ein Teil der Viren noch vermehrungsfahig Genom Bearbeiten Das Genom ist unsegmentiert monopartit und besteht aus einem linearen Doppelstrang DNA Molekul mit einer Lange von etwa 15 9 kbp Kilobasenpaaren Proteine Bearbeiten Das TTV1 Virion enthalt vier viruskodierte Proteine TP1 4 alias VP1 4 Zwei an den DNA Strang gebundene Strukturproteine TP1 und TP2 bilden ein helikales Kapsid das von einer lipidhaltigen Virushulle umschlossen wird Diese Hulle besteht abweichend von normalen zellularen Lipiden vorwiegend aus Glycerol Tetraether Lipiden wie sie auch in der besonderen Zellmembran der Archaeen zu finden sind Die Phosphatreste dieser Phospholipide sind nach innen gerichtet wahrend die Glycosylreste die Aussenseite der Virushulle bilden In die Hulle ist zusatzlich das virale Hullprotein TP3 eingelagert Ein zusatzliches aber nicht genauer lokalisiertes Strukturprotein TP4 befindet sich im Virion 5 7 Die Proteine weisen keine Sequenzahnlichkeit zu Strukturproteinen von Viren aus anderen zum Entdeckungszeitpunkt bekannten Familien einschliesslich Lipothrixviren auf Das Nukleokapsidprotein TP1 hat sich offenbar aus einer Cas4 Endonuklease entwickelt einer konservierten Komponente der adaptiven CRISPR Cas Immunitat was den ersten beschriebenen Fall einer Exaptation eines Enzyms fur die Funktion eines Viruskapsidproteins darstellt 8 Mittels Kryo EM wurde die hochaufgeloste Struktur der Virionen fur Pyrobaculum filamentous virus 2 PFV2 bestimmt ein Virus das eng mit der Tupusspezies PFV1 verwandt ist 3 Die Struktur zeigte dass das Nukleokapsid aus zwei Hauptkapsidproteinen englisch major capsid proteins MCP1 und MCP2 gebildet wird MCP1 und MCP2 bilden ein Heterodimer das sich um das lineare dsDNA Genom wickelt und es in die A Form umwandelt Die Interaktion zwischen dem Genom und den MCPs bewirkt die Kondensation des Genoms zu einer Superhelix im Virion 3 Das helikale Nukleokapsid ist von einer Lipidhulle umgeben und enthalt weitere Virus Proteine wobei VP3 am haufigsten vorkommt 9 Die Faltung der MCPs sowie die Organisation der Virionen von Tristromaviren ahneln denen von Mitgliedern der Familien Rudiviridae 10 und Lipothrixviridae 11 12 die zusammen die Ordnung Ligamenvirales bilden 3 Reproduktionszyklus BearbeitenDie virale Replikation erfolgt im Zytoplasma der Wirtszelle Der Eintritt in die Wirtszelle erfolgt durch Adsorption Die Transkription benutzt das dsDNA Genom des Virus als Vorlage en DNA templated transkription Als naturliche Wirte dienen hyperthermophile und neutrophile Archaeen der Gattungen Thermoproteus und Pyrobaculum Familie Thermoproteaceae Die Virionen werden durch Lyse freigesetzt Die Ubertragung erfolgt durch passive Diffusion 6 5 Systematik BearbeitenDie Gattung wurde fruher in die Familie Lipothrixviridae der Ordnung Ligamenvirales eingeordnet 13 Aufgrund nicht ausreichender Sequenzahnlichkeit von TTV1 und PFV1 zu anderen Mitgliedern der LipothrixviridaeAufgrund nicht ubereinstimmender Genomsequenz von TTV1 und PFV1 zu den anderen Mitgliedern der Lipothrixviridae wurde die Gattung Alphalipothrixvirus vom ICTV in Alphatristromavirus umbenannt und in die neue Familie Tristromaviridae verschoben 1 9 14 Aufgrund der oben erwahnten strukturellen Ahnlichkeiten wurde jedoch inzwischen vorgeschlagen die Ordnung Ligamenvirales und die Familie Tristromaviridae in einer Klasse Tokiviricetes zu vereinen toki bedeutet Faden auf Georgisch und viricetes ist das offizielle Suffix fur Virusklassen 3 15 Systematik nach ICTV 6 erganzt nach NCBI Stand Mitte Marz 2023 Gruppe dsDNA Klasse Tokiviricetes Ordnung Primavirales Familie Tristromaviridae 16 Gattung Alphatristromavirus abgespaltet von Alphalipothrixvirus Spezies Alphatristomavirus PFV1 Pyrobaculum filamentous Virus 1 engl Pyrobaculum filamentous virus 1 PFV 1 bzw PFV1 Typus Spezies Alphatristtomavirus PFV2 Pyrobaculum filamentous Virus 2 engl Pyrobaculum filamentous virus 2 PFV 2 bzw PFV2 17 Gattung Betatristromavirus abgespaltet von Alphatristromavirus Spezies Thermoproteus tenax Virus 1 engl Thermoproteus tenax virus 1 TTV 1 bzw TTV1 Subtyp Thermoproteus tenax Virus 1 Stamm KRA1 engl Thermoproteus tenax virus 1 strain KRA1 Subtyp Thermoproteus tenax Virus 1 Stamm VT3 engl Thermoproteus tenax virus 1 strain VT3 Ordnung Ligamenvirales Familie Lipothrixviridae Gattung Alphalipothrixvirus 18 19 Spezies Alphalipothrixvirus SBFV2 Subtyp Sulfolobales Beppu filamentous virus 2 SBFV 2 Spezies Alphalipothrixvirus SFV1 Subtyp Sulfolobus filamentous Virus 1 engl Sulfolobus filamentous virus 1 Sulfolobales Beppu filamentous phage 1 SFV 1 Gattung Betalipothrixvirus 20 Spezies Acidianus filamentous Virus 3 wiss Acidianus filamentous virus 3 AFV 3 Spezies Acidianus filamentous Virus 6 wiss Acidianus filamentous virus 6 AFV 6 Spezies Acidianus filamentous Virus 7 wiss Acidianus filamentous virus 7 AFV 7 Spezies Acidianus filamentous Virus 8 wiss Acidianus filamentous virus 8 AFV 8 Spezies Acidianus filamentous Virus 9 wiss Acidianus filamentous virus 9 AFV 9 Spezies Sulfolobus islandicus filamentous Virus wiss Sulfolobus islandicus filamentous virus SIFV Gattung Deltalipothrixvirus 21 Spezies Acidianus filamentous Virus 2 wiss Acidianus filamentous virus 2 AFV 2 Spezies Deltalipothrixvirus SBFV3 engl Sulfolobales Beppu filamentous virus 3 22 Familie Ungulaviridae ausgegliedert aus Lipothrixviridae Gattung Captovirus fruher Gammalipothrixvirus 23 Spezies Captovirus AFV1 Acidianus filamentous Virus 1 engl Acidianus filamentous virus 1 AFV 1 Familie RudiviridaeQuellen BearbeitenK Stedman et al Genus Alphalipothrixvirus In C M Fauquet M A Mayo et al Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses London San Diego 2004 S 96 98 H Neumann V Schwass C Eckerskorn Wolfram Zillig Identification and characterization of the genes encoding three structural proteins of the Thermoproteus tenax virus TTV 1 Mol Gen Genet 1989 217 S 105 110 PMID 2505050Einzelnachweise Bearbeiten a b ICTV ICTV Master Species List 2019 v1 New MSL including all taxa updates since the 2018b release March 2020 MSL 35 a b c d e ICTV ICTV Master Species List 2021 v1 New MSL including all taxa updates since the 20120 release March 2022 MSL 37 a b c d e f F Wang D P Baquero Z Su T Osinski D Prangishvili E H Egelman M Krupovic Structure of a filamentous virus uncovers familial ties within the archaeal virosphere In Virus Evolution 6 Jahrgang Nr 1 Januar 2020 S veaa023 doi 10 1093 ve veaa023 PMID 32368353 PMC 7189273 freier Volltext oup com D Prangishvili E Rensen T Mochizuki M Krupovic Consortium ICTV Report ICTV Virus Taxonomy Profile Tristromaviridae In The Journal of General Virology 100 Jahrgang Nr 2 Februar 2019 S 135 136 doi 10 1099 jgv 0 001190 PMID 30540248 a b c d ViralZone Alphatristromavirus Expasy abgerufen am 23 Marz 2021 a b c ICTV Report Tristromaviridae Abgerufen im 1 Januar 1 Horst Neumann Volker Schwass Christoph Eckerskorn Wolfram Zillig Identification and characterization of the genes encoding three structural proteins of the Thermoproteus tenax virus TTV1 In MGG Molecular amp General Genetics 217 Jahrgang Nr 1 1989 S 105 110 doi 10 1007 BF00330948 M Krupovic V Cvirkaite Krupovic D Prangishvili E V Koonin Evolution of an archaeal virus nucleocapsid protein from the CRISPR associated Cas4 nuclease In Biol Direct 10 Jahrgang Nr 1 2015 S 65 doi 10 1186 s13062 015 0093 2 PMID 26514828 PMC 4625639 freier Volltext a b EI Rensen T Mochizuki E Quemin S Schouten M Krupovic D Prangishvili A virus of hyperthermophilic archaea with a unique architecture among DNA viruses In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 113 Jahrgang Nr 9 2016 S 2478 2483 doi 10 1073 pnas 1518929113 PMID 26884161 PMC 4780613 freier Volltext bibcode 2016PNAS 113 2478R F DiMaio X Yu E Rensen M Krupovic D Prangishvili E H Egelman Virology A virus that infects a hyperthermophile encapsidates A form DNA In Science 348 Jahrgang Nr 6237 2015 S 914 917 doi 10 1126 science aaa4181 PMID 25999507 PMC 5512286 freier Volltext P Kasson F DiMaio X Yu S Lucas Staat M Krupovic S Schouten D Prangishvili E H Egelman Model for a novel membrane envelope in a filamentous hyperthermophilic virus In eLife 6 Jahrgang 2017 doi 10 7554 eLife 26268 PMID 28639939 PMC 5517147 freier Volltext Y Liu T Osinski F Wang M Krupovic S Schouten P Kasson D Prangishvili E H Egelman Structural conservation in a membrane enveloped filamentous virus infecting a hyperthermophilic acidophile In Nature Communications 9 Jahrgang Nr 1 2018 S 3360 doi 10 1038 s41467 018 05684 6 PMID 30135568 PMC 6105669 freier Volltext bibcode 2018NatCo 9 3360L D Janekovic S Wunderl T Holz Wolfram Zillig A Gierl H Neumann TTV1 TTV2 and TTV3 a family of viruses of the extremely thermophilic anaerobic sulfur reducing archaebacterium Thermoproteus tenax In MGG Molecular amp General Genetics 192 Jahrgang Nr 1 2 1 Oktober 1983 S 39 45 doi 10 1007 BF00327644 englisch ICTV dsDNA Viruses gt Tristromaviridae Oktober 2018 Dann Turner Andrew M Kropinski Evelien M Adriaenssens A Roadmap for Genome Based Phage Taxonomy in MDPI Viruses Band 13 Nr 3 Section Bacterial Viruses 18 Marz 2021 506 doi 10 3390 v13030506 NCBI Tristomaviridae family NCBI Pyrobaculum filamentous virus 2 species NCBI Alphalipothrixvirus genus SIB Alphalipothrixvirus SIB Betalipothrixvirus auf ViralZone SIB Deltalipothrixvirus auf ViralZone NCBI Deltalipothrixvirus SBFV3 species SIB Gammalipothrixvirus auf ViralZoneWeblinks Bearbeiten Virus Taxonomy ICTV ICTV Report Tristromaviridae Alphalipothrixvirus Viralzone com Alphalipothrixviridae NCBI Virus databases online Struktur und Abbildung des TTV 1 Thermoproteus tenax virus 1 TTV1 genome Nucleotide result Teilsequenz des TTV 1 Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Tristromaviridae amp oldid 232346934