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Chordopoxvirinae Humane Pockenviren TEM Abbildung SystematikKlassifikation VirenRealm Varidnaviria 1 Reich Bamfordvirae

Chordopoxvirinae

Chordopoxvirinae

Humane Pockenviren (TEM-Abbildung)

Systematik
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: komplex
Hülle: vorhanden
Wissenschaftlicher Name
Chordopoxvirinae
Kurzbezeichnung
ChPV
Links
NCBI Taxonomy: 10241
ViralZone (Expasy, SIB): 172
ICTV Taxon History: 201904738

Die Unterfamilie Chordopoxvirinae fasst acht Gattungen der Familie Poxviridae zusammen, die bei Wirbeltieren (Vertebraten), beispielsweise Säugetieren, Vögeln und Nagetieren, Infektionen verursachen können. Die Unterfamilie wurde geschaffen, um diese Gattungen von den Mitgliedern der Unterfamilie Entomopoxvirinae zu separieren, die nur Pockenviren bei Insekten umfassen. Aufgrund dieser Abtrennung wurde der Name der Gattung nicht nach den Wirbeltieren „Vertebropoxvirinae“ benannt, sondern nach dem Stamm der Chordatiere, obwohl noch keine Pockenviren bei nicht zu den Wirbeltieren gehörenden Chordatieren isoliert wurden. Diese Einteilung nach dem Wirtsspektrum spiegelt sich auch in der phylogenetischen Distanz zwischen Chordo- und Entomopoxvirinae wider.

Zwischen den Gattungen der Chordopoxvirinae wird eine serologische Kreuzreaktivität beobachtet, wobei die Mitglieder der Avipoxviren bei Vögeln diese Eigenschaft weniger aufweisen als die Viren bei Säugetieren. Einige Mitglieder der Chordopoxvirinae verursachen typische Läsionen auf der Chorioallantoismembran, wenn sie in embryonierten Hühnereiern für Laborzwecke angezüchtet werden.

Aufbau und Genom Bearbeiten

Die Mitglieder der Chordopoxvirinae stellen sich als ovoide oder Backstein-förmige Virionen dar.

Das lineare, doppelsträngige DNA-Genom besitzt gewöhnlich einen niedrigen GC-Gehalt von 30 bis 40 %, kann aber von 25 bis 67 % variieren. Ein hoher GC-Gehalt liegt bei den Gattungen Parapoxvirus und Crocodylidpoxvirus sowie dem Molluscum-contagiosum-Virus vor.

Das Genom von Molluscum contagiosum virus Subtyp 1 hat einen GC-Gehalt von 63,4 %, das der Parapoxviren Bovine papular stomatitis virus (Strain BV-AR02) und Orf virus (Strain OV-SA00) hat 64,5 % respektive 64,3 %. Das Genom des Nile crocodilepox virus hat eine Länge von 190.054 Basenpaaren (bp). Es kodiert vorhergesagt für 173 Proteine bei einem GC-Gehalt von 61,9 % (Strain Simbabwe).

Eine stets gleichförmig angeordnete Gruppe von zentralen Genen charakterisiert die Chordopoxvirinae trotz variabler Sequenzen zwischen den Gattungen.

Systematik Bearbeiten

Die innere Systematik der Chordopoxvirinae ist nach ICTV, Stand November 2018, wie folgt:

Für eine ausführliche Darstellung siehe Poxviridae.

Quellen Bearbeiten

  • R. M. Buller et al.: Subfamily Chordavirinae. In: C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London, San Diego, 2005, S. 122 ISBN 0-12-249951-4
  • B. Moss: Poxviridae: The Viruses and Their Replication. In: David M. Knipe, Peter M. Howley (eds.-in-chief): Fields’ Virology. 5. Auflage, Band 2, Philadelphia 2007, S. 2906ff ISBN 0-7817-6060-7

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Variola virus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  2. Eneida L. Hatcher, Chunlin Wang, Elliot J. Lefkowitz: Genome Variability and Gene Content in Chordopoxviruses: Dependence on Microsatellites, in: Viruses 7(4), 2015, S. 2126–2146, doi:10.3390/v7042126
  3. S. Roychoudhury, A. Pan, D. Mukherjee: Genus specific evolution of codon usage and nucleotide compositional traits of poxviruses. In: Virus Genes. 42. Jahrgang, Nr. 2, 2011, S. 189–199, doi:10.1007/s11262-010-0568-2, PMID 21369827.
  4. ↑ Yu Li, Hermann Meyer, Hui Zhao, Inger K. Damon: GC Content-Based Pan-Pox Universal PCR Assays for Poxvirus Detection, in: J Clin Microbiol. 48(1, Januar 2010, S. 268–276, online 11. November 2009, doi:10.1128/JCM.01697-09. PMC 2812294 (freier Volltext).
  5. David M. Needham, Alexandra Z. Worden et al.: (Memento des Originals vom 26. September 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/www.pnas.org, in: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, hier: Supplement 1 (xlsx)@1@2Vorlage:Toter Link/www.pnas.org (Seite nicht mehr abrufbar, festgestellt im Oktober 2022. Suche in Webarchiven.)  Info: Der Link wurde automatisch als defekt markiert. Bitte prüfe den Link gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
  6. ICTV: (Memento des Originals vom 14. März 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org, MSL including all taxa updates since the 2017 release. Fall 2018 (MSL #33)

Weblinks Bearbeiten

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Veröffentlichungsdatum:
ChordopoxvirinaeHumane Pockenviren TEM Abbildung SystematikKlassifikation VirenRealm Varidnaviria 1 Reich Bamfordvirae 1 Phylum Nucleocytoviricota 1 Klasse Pokkesviricetes 1 Ordnung Chitovirales 1 Familie PoxviridaeUnterfamilie ChordopoxvirinaeTaxonomische MerkmaleGenom dsDNA linearBaltimore Gruppe 1Symmetrie komplexHulle vorhandenWissenschaftlicher NameChordopoxvirinaeKurzbezeichnungChPVLinksNCBI Taxonomy 10241ViralZone Expasy SIB 172ICTV Taxon History 201904738Die Unterfamilie Chordopoxvirinae fasst acht Gattungen der Familie Poxviridae zusammen die bei Wirbeltieren Vertebraten beispielsweise Saugetieren Vogeln und Nagetieren Infektionen verursachen konnen Die Unterfamilie wurde geschaffen um diese Gattungen von den Mitgliedern der Unterfamilie Entomopoxvirinae zu separieren die nur Pockenviren bei Insekten umfassen Aufgrund dieser Abtrennung wurde der Name der Gattung nicht nach den Wirbeltieren Vertebropoxvirinae benannt sondern nach dem Stamm der Chordatiere obwohl noch keine Pockenviren bei nicht zu den Wirbeltieren gehorenden Chordatieren isoliert wurden Diese Einteilung nach dem Wirtsspektrum spiegelt sich auch in der phylogenetischen Distanz zwischen Chordo und Entomopoxvirinae wider Zwischen den Gattungen der Chordopoxvirinae wird eine serologische Kreuzreaktivitat beobachtet wobei die Mitglieder der Avipoxviren bei Vogeln diese Eigenschaft weniger aufweisen als die Viren bei Saugetieren Einige Mitglieder der Chordopoxvirinae verursachen typische Lasionen auf der Chorioallantoismembran wenn sie in embryonierten Huhnereiern fur Laborzwecke angezuchtet werden Inhaltsverzeichnis 1 Aufbau und Genom 2 Systematik 3 Quellen 4 Einzelnachweise 5 WeblinksAufbau und Genom BearbeitenDie Mitglieder der Chordopoxvirinae stellen sich als ovoide oder Backstein formige Virionen dar Das lineare doppelstrangige DNA Genom besitzt gewohnlich einen niedrigen GC Gehalt von 30 bis 40 kann aber von 25 bis 67 variieren Ein hoher GC Gehalt liegt bei den Gattungen Parapoxvirus und Crocodylidpoxvirus sowie dem Molluscum contagiosum Virus vor 2 3 4 Das Genom von Molluscum contagiosum virus Subtyp 1 hat einen GC Gehalt von 63 4 das der Parapoxviren Bovine papular stomatitis virus Strain BV AR02 und Orf virus Strain OV SA00 hat 64 5 respektive 64 3 4 Das Genom des Nile crocodilepox virus hat eine Lange von 190 054 Basenpaaren bp Es kodiert vorhergesagt fur 173 Proteine bei einem GC Gehalt von 61 9 Strain Simbabwe 5 4 Eine stets gleichformig angeordnete Gruppe von zentralen Genen charakterisiert die Chordopoxvirinae trotz variabler Sequenzen zwischen den Gattungen Systematik BearbeitenDie innere Systematik der Chordopoxvirinae ist nach ICTV Stand November 2018 wie folgt 6 Familie PoxviridaeUnterfamilie ChordopoxvirinaeGenus Orthopoxvirus Typusspezies Orthopoxvirus vaccinia en Vaccinia virus Genus Parapoxvirus Typusspezies Parapoxvirus ovis en Orf virus Genus Avipoxvirus Typusspezies Avipoxvirus galli en Fowlpox virus Genus Capripoxvirus Typusspezies Capripoxvirus ovis en Sheeppox virus Capripoxvirus caprae Capripoxvirus bovis nodularis Genus Centapoxvirus einzige Spezies Yokapox Virus en Yokapox virus Genus Cervidpoxvirus einzige Spezies Deerpox Virus en Mule deerpox virus Genus Crocodylidpoxvirus einzige Spezies Nile crocodilepox virus Genus Leporipoxvirus Typusspezies Leporipoxvirus myxomatosis en Myxoma virus Genus Molluscipoxvirus einzige Spezies Molluscum contagiosum virus Genus Suipoxvirus einzige Spezies Suipoxvirus suis en Swinepox virus Genus Yatapoxvirus Typusspezies Yaba monkey tumor virus dd Fur eine ausfuhrliche Darstellung siehe Poxviridae Quellen BearbeitenR M Buller et al Subfamily Chordavirinae In C M Fauquet M A Mayo et al Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses London San Diego 2005 S 122 ISBN 0 12 249951 4 B Moss Poxviridae The Viruses and Their Replication In David M Knipe Peter M Howley eds in chief Fields Virology 5 Auflage Band 2 Philadelphia 2007 S 2906ff ISBN 0 7817 6060 7Einzelnachweise 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