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Bamfordvirae EM Aufnahme eines Virions Virusteilchens des MimivirusSystematikKlassifikation VirenRealm Varidnaviria 1 2

Bamfordvirae

Bamfordvirae

EM-Aufnahme eines Virions (Virusteilchens) des Mimivirus

Systematik
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA
Baltimore: Gruppe 1
Wissenschaftlicher Name
Bamfordvirae
Kurzbezeichnung
DJRV
Links
NCBI Taxonomy: 2732005
ICTV Taxon History: 201908707

Bamfordvirae bezeichnet ein Reich von Viren. Dieses Taxon ist gekennzeichnet durch Hauptkapsidproteine (englisch major capsid proteins) mit „double jelly roll“-Struktur (DJR-Viren). Vor der offiziellen Bestätigung durch das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) war diese Gruppe als PRD1-Adenovirus-Linie bezeichnet worden. Das Taxon ist nach Dennis H. Bamford benannt, der zuerst die evolutionäre Verwandtschaft aller Viren DJR-Hauptkapsidproteinen postulierte.

Das genetische Netzwerk, das verschiedene Gruppen der Bamfordvirae und eigennützige genetische Elemente (selfish genetic elements) verbindet. Die Verbindungen zwischen den Knoten sind farblich durch das Gen gekennzeichnet, dessen Sequenzhomologie die Verbindung herstellt.

Systematik Bearbeiten

Adenoviren im TEM
Virophage Mavirus (unten links) und das zugehörige Riesenvirus CroV

Vermutlich haben sich aus den kleineren Viren des Phylums Preplasmiviricota die Riesenviren des Phylums Nucleocytoviricota entwickelt (in diesem Fall wäre das Phylum Preplasmiviricota paraphyletisch). Auch wenn es sich bei den Preplasmiviricota tatsächlich um ein paraphyletisches Taxon handeln sollte, wird es für die Taxonomie der Viren verwendet, da die zugehörigen Taxa miteinander verwandt sind und charakteristische Merkmale aufweisen, die sie von Riesenviren unterscheiden.

Zu den Bamfordvirae gehören derzeit (mit Stand Ende April 2023) folgende vom ICTV bestätigten Mitglieder:

Anmerkungen Bearbeiten

  1. Legende zum genetischen Netzwerk:
    Knoten: Verbindungen:

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
  3. IPR000305: GIY-YIG endonuclease. Auf: InterPro: Classification of protein families.
  4. Joshua Pajak, Rockney Atz, Brendan J. Hilbert, Marc C. Morais, Brian A. Kelch, Paul J. Jardine, Gaurav Arya: Viral packaging ATPases utilize a glutamate switch to couple ATPase activity and DNA translocation. In: PNAS, Band 118, Nr. 17, 27. April 2021, e2024928118; doi:10.1073/pnas.2024928118, PMID 33888587, PMC 8092589 (freier Volltext) (englisch).
  5. FOLLICULIN; FLCN . Auf: omim.org
  6. Bernhard Zondek: Über das Schicksal des Follikelhormons (Folliculin) im Organismus. In: Hormone des Ovariums und des Hypophysenvorderlappens, Springer Berlin, Heidelberg 1935, S. 124–153; ISBN 978-3-642-90600-8; doi:10.1007/978-3-642-92458-3_16, Online ISBN 978-3-642-92458-3. Sowie Lancet 227, 356 (1934). - Skand. Arch. Physiol. (Berl. u. Lpz.) 70, 133 (1934).
  7. Natalya Yutin, Didier Raoult, Eugene V. Koonin: Virophages, polintons, and transpovirons: a complex evolutionary network of diverse selfish genetic elements with different reproduction strategies. In: Virology Journal. 10. Jahrgang, Nr. 1, 2013, S. 158, doi:10.1186/1743-422X-10-158, PMID 23701946, PMC 3671162 (freier Volltext) – (englisch).
  8. Virus Taxonomy: 2019 Release. In: talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses, März 2020, abgerufen am 25. April 2020 (englisch).
  9. ↑ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovič, Arvind Varsani, Yuri I. Wolf, Natalya Yutin, M. Zerbini, Jens H. Kuhn: Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for DNA viruses encoding vertical jelly roll-type major capsid proteins. In: ICTV Proposal (Taxoprop). Oktober 2019, S. 2019.003G, doi:10.13140/RG.2.2.14886.47684 (englisch, researchgate.net).
  10. Kathryn M. Kauffman, Fatima A. Hussain, Joy Yang, Philip Arevalo, Julia M. Brown, William K. Chang, David VanInsberghe, Joseph Elsherbini, Radhey S. Sharma, Michael B. Cutler, Libusha Kelly, Martin F. Polz: A major lineage of non-tailed dsDNA viruses as unrecognized killers of marine bacteria. In: Nature, Band 554, S. 118–122, 24. Januar 2018; doi:10.1038/nature25474 (englisch).
  11. ↑ Mart Krupovič, Dennis H. Bamford: Virus evolution: how far does the double β-barrel viral lineage extend? In: Nature Reviews Microbiology. 6. Jahrgang, Nr. 12, Dezember 2008, S. 941–948, doi:10.1038/nrmicro2033, PMID 19008892 (englisch).
  12. Dennis H. Bamford, R. M. Burnett, D. I. Stuart: Evolution of viral structure. In: Theoretical Population Biology. 61. Jahrgang, Nr. 4, 2002, S. 461–470, doi:10.1006/tpbi.2002.1591, PMID 12167365 (englisch).
  13. Dennis H. Bamford: Do viruses form3lineages across different domains of life? In: Research in Microbiology. 154. Jahrgang, Nr. 4, 2003, S. 231–236, doi:10.1016/S0923-2508(03)00065-2, PMID 12798226 (englisch).
  14. S. Duponchel, M. G. Fischer: Viva lavidaviruses! Five features of virophages that parasitize giant DNA viruses. In: PLoS pathogens, Band 15, Nr. 3, 2019; doi:10.1371/journal.ppat.1007592 (englisch).
  15. Natalya Yutin, Yuri I. Wolf, Eugene V. Koonin: Origin of giant viruses from smaller DNA viruses not from a fourth domain of cellular life. In: Virology, Band 466–467, Oktober 2014, S. 38–52; doi:10.1016/j.virol.2014.06.032, PMID 25042053, PMC 4325995 (freier Volltext), ResearchGate (englisch).
  16. Jonathan Filée: Route of NCLDV evolution: the genomic accordion. In: Current Opinion in Virology, Band 3, Nr. 5, Oktober 2013, S. 595–599; doi:10.1016/j.coviro.2013.07.003 (englisch).
  17. David Moreira, Céline Brochier-Armanet: Giant viruses, giant chimeras: The multiple evolutionary histories of Mimivirus genes. In: BMC Ecology and Evolution: Evolutionary Biology, Band 8, Nr. 12, 18. Januar 2008; doi:10.1186/1471-2148-8-12, PMID 18205905, PMC 2263039 (freier Volltext) (englisch).
  18. Tom Williams, T. Martin Embley, Eva Heinz: Informational Gene Phylogenies Do Not Support a Fourth Domain of Life for Nucleocytoplasmic Large DNA Viruses. In: PLoS ONE, Band 6, Nr. 6, 16. Juni 2011, S. e21080; doi:10.1371/journal.pone.0021080, ResearchGate (englisch).
  19. ICTV: Master Species Lists. § ICTV Master Species List 2022 MSL38 v1 (xlsx).
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Veröffentlichungsdatum:
BamfordviraeEM Aufnahme eines Virions Virusteilchens des MimivirusSystematikKlassifikation VirenRealm Varidnaviria 1 2 Reich Bamfordvirae 1 Taxonomische MerkmaleGenom dsDNABaltimore Gruppe 1Wissenschaftlicher NameBamfordviraeKurzbezeichnungDJRVLinksNCBI Taxonomy 2732005ICTV Taxon History 201908707Bamfordvirae bezeichnet ein Reich von Viren 8 Dieses Taxon ist gekennzeichnet durch Hauptkapsidproteine englisch major capsid proteins mit double jelly roll Struktur DJR Viren 9 10 Vor der offiziellen Bestatigung durch das International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV war diese Gruppe als PRD1 Adenovirus Linie bezeichnet worden 11 Das Taxon ist nach Dennis H Bamford benannt der zuerst die evolutionare Verwandtschaft aller Viren DJR Hauptkapsidproteinen postulierte 12 13 11 Das genetische Netzwerk das verschiedene Gruppen der Bamfordvirae und eigennutzige genetische Elemente selfish genetic elements verbindet Die Verbindungen zwischen den Knoten sind farblich durch das Gen gekennzeichnet dessen Sequenzhomologie die Verbindung herstellt A 1 7 Systematik Bearbeiten nbsp Adenoviren im TEM nbsp Virophage Mavirus unten links und das zugehorige Riesenvirus CroV 14 Vermutlich haben sich aus den kleineren Viren des Phylums Preplasmiviricota die Riesenviren des Phylums Nucleocytoviricota entwickelt in diesem Fall ware das Phylum Preplasmiviricota paraphyletisch Auch wenn es sich bei den Preplasmiviricota tatsachlich um ein paraphyletisches Taxon handeln sollte wird es fur die Taxonomie der Viren verwendet da die zugehorigen Taxa miteinander verwandt sind und charakteristische Merkmale aufweisen die sie von Riesenviren unterscheiden 9 15 16 17 18 Zu den Bamfordvirae gehoren derzeit mit Stand Ende April 2023 folgende vom ICTV bestatigten Mitglieder 19 Phylum Nucleocytoviricota fruher englisch Nucleocytoplasmic large DNA viruses NCLDVs mit Pocken und Riesenviren Phylum Preplasmiviricota fruher Polinton artige Viren engl polinton like viruses PLVs u a mit Tectiviridae inklusive Phage PRD1 Adenoviren und VirophagenAnmerkungen Bearbeiten Legende zum genetischen Netzwerk Knoten Transpoviron plasmidahnliches genetisches Element in den Genomen von Riesen DNA Viren TLR1 NCLDV Nucleocytoviricota Phagen Adenoviren Polintons Virophagen Verbindungen Primase Helikase Integrase DNA Polymerase B GIY ZnR GIY YIG Endonuclease GIY 3 und Zn ribbon domain ZnR Cystein Protease Packaging ATPase 4 TLR 6F TLR Helikase MV19 Peptidase in Cyanophagen MV20 FNIP Repeats englisch folliculin interacting protein FNIP ein Co Chaperon des Proteins Folliculin 5 6 Einzelnachweise Bearbeiten a b ICTV ICTV Master Species List 2019 v1 New MSL including all taxa updates since the 2018b release March 2020 MSL 35 ICTV ICTV Master Species List 2020 v1 New MSL including all taxa updates since the 2019 release March 2021 MSL 36 IPR000305 GIY YIG endonuclease Auf InterPro Classification of protein families Joshua Pajak Rockney Atz Brendan J Hilbert Marc C Morais Brian A Kelch Paul J Jardine Gaurav Arya Viral packaging ATPases utilize a glutamate switch to couple ATPase activity and DNA translocation In PNAS Band 118 Nr 17 27 April 2021 e2024928118 doi 10 1073 pnas 2024928118 PMID 33888587 PMC 8092589 freier Volltext englisch FOLLICULIN FLCN Auf omim org Bernhard Zondek Uber das Schicksal des Follikelhormons Folliculin im Organismus In Hormone des Ovariums und des Hypophysenvorderlappens Springer Berlin Heidelberg 1935 S 124 153 ISBN 978 3 642 90600 8 doi 10 1007 978 3 642 92458 3 16 Online ISBN 978 3 642 92458 3 Sowie Lancet 227 356 1934 Skand Arch Physiol Berl u Lpz 70 133 1934 Natalya Yutin Didier Raoult Eugene V Koonin Virophages polintons and transpovirons a complex evolutionary network of diverse selfish genetic elements with different reproduction strategies In Virology Journal 10 Jahrgang Nr 1 2013 S 158 doi 10 1186 1743 422X 10 158 PMID 23701946 PMC 3671162 freier Volltext englisch Virus Taxonomy 2019 Release In talk ictvonline org International Committee on Taxonomy of Viruses Marz 2020 abgerufen am 25 April 2020 englisch a b Eugene V Koonin Valerian V Dolja Mart Krupovic Arvind Varsani Yuri I Wolf Natalya Yutin M Zerbini Jens H Kuhn Create a megataxonomic framework filling all principal taxonomic ranks for DNA viruses encoding vertical jelly roll type major capsid proteins In ICTV Proposal Taxoprop Oktober 2019 S 2019 003G doi 10 13140 RG 2 2 14886 47684 englisch researchgate net Kathryn M Kauffman Fatima A Hussain Joy Yang Philip Arevalo Julia M Brown William K Chang David VanInsberghe Joseph Elsherbini Radhey S Sharma Michael B Cutler Libusha Kelly Martin F Polz A major lineage of non tailed dsDNA viruses as unrecognized killers of marine bacteria In Nature Band 554 S 118 122 24 Januar 2018 doi 10 1038 nature25474 englisch a b Mart Krupovic Dennis H Bamford Virus evolution how far does the double b barrel viral lineage extend In Nature Reviews Microbiology 6 Jahrgang Nr 12 Dezember 2008 S 941 948 doi 10 1038 nrmicro2033 PMID 19008892 englisch Dennis H Bamford R M Burnett D I Stuart Evolution of viral structure In Theoretical Population Biology 61 Jahrgang Nr 4 2002 S 461 470 doi 10 1006 tpbi 2002 1591 PMID 12167365 englisch Dennis H Bamford Do viruses form3lineages across different domains of life In Research in Microbiology 154 Jahrgang Nr 4 2003 S 231 236 doi 10 1016 S0923 2508 03 00065 2 PMID 12798226 englisch S Duponchel M G Fischer Viva lavidaviruses Five features of virophages that parasitize giant DNA viruses In PLoS pathogens Band 15 Nr 3 2019 doi 10 1371 journal ppat 1007592 englisch Natalya Yutin Yuri I Wolf Eugene V Koonin Origin of giant viruses from smaller DNA viruses not from a fourth domain of cellular life In Virology Band 466 467 Oktober 2014 S 38 52 doi 10 1016 j virol 2014 06 032 PMID 25042053 PMC 4325995 freier Volltext ResearchGate englisch Jonathan Filee Route of NCLDV evolution the genomic accordion In Current Opinion in Virology Band 3 Nr 5 Oktober 2013 S 595 599 doi 10 1016 j coviro 2013 07 003 englisch David Moreira Celine Brochier Armanet Giant viruses giant chimeras The multiple evolutionary histories of Mimivirus genes In BMC Ecology and Evolution Evolutionary Biology Band 8 Nr 12 18 Januar 2008 doi 10 1186 1471 2148 8 12 PMID 18205905 PMC 2263039 freier Volltext englisch Tom Williams T Martin Embley Eva Heinz Informational Gene Phylogenies Do Not Support a Fourth Domain of Life for Nucleocytoplasmic Large DNA Viruses In PLoS ONE Band 6 Nr 6 16 Juni 2011 S e21080 doi 10 1371 journal pone 0021080 ResearchGate englisch ICTV Master Species Lists ICTV Master Species List 2022 MSL38 v1 xlsx Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Bamfordvirae amp oldid 237826771