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Senecavirus SystematikKlassifikation VirenRealm Riboviria 2 1 Reich Orthornavirae 1 Phylum Pisuviricota 1 Klasse Pisoniv

Senecavirus

Senecavirus

Senecavirus

Systematik
Taxonomische Merkmale
Wissenschaftlicher Name
Senecavirus
Links
NCBI Taxonomy: 586425
NCBI Reference: NC_011349.1
ViralZone (Expasy, SIB): 697
ICTV Taxon History: 201902060

Die Gattung Senecavirus umfasst derzeit nur eine Spezies (Art) eines unbehüllten Virus aus der Familie Picornaviridae, das für die Gattung namensgebende Seneca-Valley-Virus (SVV). Dieses Virus ist das bislang einzige bekannte apathogene Picornavirus (Mitglied der Picornaviridae). In seiner natürlichen Form ist es in der Lage, spezifische Tumorzellen von einigen Hirntumor-Arten zu zerstören; damit besitzt es die Eigenschaft eines onkolytischen Virus.

Das SVV wurde im Jahr 2002 zufällig in einem Unternehmen für Gentherapie in Gaithersburg (Maryland) isoliert. Bei der Suche nach Kontaminationen von Zellkulturen wurden aus dem Kulturmedium einer PER.C6-Zelllinie (transformierte, fötale Retinoblastom-Zellen) mehrere porzine Picornaviren isoliert, von denen eines sich als neues Virus herausstellte, das schließlich 2005 als neu charakterisiertes Virus veröffentlicht wurde. Da sich die Firma in Gaithersburg im sogenannten Seneca Valley (Gebiet des Little Seneca Lakes und des Seneca Creeks) befindet, wurde das Virus danach benannt. Nach seiner Identifizierung konnte es in verschiedenen Hausschweinen von Schweinefarmen in den USA entdeckt werden.

Genom und Struktur Bearbeiten

Das Genom besteht aus einer linearen einzelsträngigen RNA mit positiver Polarität und hat bei dem bisher einzigen bekannten Serotyp SVV-001 eine Länge von 7310 nt. Die nicht codierende Region am 5'-Ende ist 666 nt lang und beinhaltet eine IRES vom Typ IV, die eine Ähnlichkeit zu den IRES-Strukturen der Pestiviren aufweist. Am 3'-Ende befindet sich ebenfalls eine 71 nt lange nicht codierende Region, die mit ihrer möglichen Faltungsstruktur typisch ist zur Bildung eines Kissing-Loops, um beide RNA-Enden während der RNA-Replikation als Rolling-Circle zusammenzuführen Die größte Sequenzähnlichkeit besteht zu Mitgliedern der Gattung Cardiovirus und Aphthovirus. Im Vergleich zu den Cardioviren und den Erboviren jedoch fehlen dem SVV zwei für die katalytische Funktion notwendigen Aminsosäurepositionen, die üblicherweise die Funktion als Protease und Phosphorylase ermöglichen. Dies kann ein Grund für die fehlende Erkrankung im natürlichen Wirt sein.

Das 32,5 nm große unbehüllte Kapsid des SVV besteht aus den vier Kapsidproteinen VP1, VP2, VP3 und VP4 (VP für Virusprotein). Die äußeren Proteindomänen von VP1 und VP2 vermitteln sehr wahrscheinlich die Bindung an die Wirtszelle und damit den Zelltropismus des Virus.

Biologische Eigenschaften Bearbeiten

Der natürliche Wirt des SVV sind wahrscheinlich Schweine, aus denen das Virus zwar isoliert werden kann, die aber gleichzeitig keine Symptome einer Erkrankung zeigen. Antikörper gegen das SVV konnten auch in weiteren landwirtschaftlichen Nutztieren gefunden werden, so bei Rindern und Schafen; bei Menschen findet man hingegen keine anti-SVV-Antikörper. In die Zellkultur, in der das Virus entdeckt wurde, scheint es wahrscheinlich durch fetales Kälber- oder -Ferkel-Serum gelangt zu sein, welches zur Kultivierung der Zellen verwendet worden war.

Das SVV besitzt neben dem natürlichen Zelltropismus im Wirtstier zusätzlich in der Zellkultur einen Tropismus für Neuroendokrine Tumorzellen wie dem Retinoblastom, Neuroblastom, Medulloblastom und dem Kleinzelligen Bronchialkarzinom. Diese in vitro infizierbaren Zellen werden während der Virusreplikation zerstört. Aus diesem Grunde gilt das SVV als ein möglicherweise in der Therapie dieser Tumore anwendbares onkolytisches Virus.

Systematik Bearbeiten

Literatur Bearbeiten

  • A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (Hrsg.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012, ISBN 978-0-12-384684-6, S. 872f
  • N. J. Knowles, P. L. Hallenbeck: A new picornavirus is most closely related to cardioviruses. EUROPIC 2005: XIIIth Meeting of the European Study Group on the Molecular Biology of Picornaviruses, Lunteren, Niederlande, 23.–29. Mai 2005, Abstract A14 (Erstbeschreibung)
  • N. J. Knowles et al.: Epidemiology of Seneca Valley virus: Identification and characterization of isolates from pigs in the United States. EUROPIC 2005: European Study Group on the Molecular Biology of Picornaviruses XIIIth Meeting, Lunteren, Niederlande, Mai 2005 (pdf)
  • S. Venkataraman et al.: Structure of Seneca Valley Virus-001: an oncolytic picornavirus representing a new genus. Structure (2008) 16(10): S. 1555–1561. PMID 18940610, PMC 2572565 (freier Volltext)
  • L. M. Hales et al.: Complete genome sequence analysis of Seneca Valley virus-001, a novel oncolytic picornavirus. J. Gen. Virol. (2008) 89(Pt 5): S. 1265–1275. PMID 18420805
  • S. Venkataraman et al.: Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of Seneca Valley virus-001, a new member of the Picornaviridae family. Acta Crystallogr. Sect F Struct. Biol. Cryst. Commun. (2008) 64(Pt 4): S. 293–296. PMID 18391430, PMC 2374260 (freier Volltext)

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterovirus C, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  2. ICTV Master Species List 2018b.v2. MSL #34, März 2019
  3. M. M. Willcocks et al.: Structural features of the Seneca Valley virus internal ribosome entry site (IRES) element: a picornavirus with a pestivirus-like IRES. J. Virol. (2011) 85(9): S. 4452–4461 PMID 21325406 PMC 3126232 (freier Volltext)
  4. P. S. Reddy et al.: Seneca Valley virus, a systemically deliverable oncolytic picornavirus, and the treatment of neuroendocrine cancers. J. Natl. Cancer. Inst. (2007) 99(21): S. 1623–1633 PMID 17971529
  5. ICTV: (Memento des Originals vom 14. März 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org, MSL including all taxa updates since the 2017 release. Fall 2018 (MSL #33)
  6. ICTV 2016 Master Species List #31 with Acronyms, (Excel XLSX), auf ViralZone, Swiss Institute of Bioinformatics (SIB)
  7. Details: Senecavirus A, The Picornavirus Pages 2006–2019, The Pirbright Institute, UK. Abgerufen 17. Februar 2019
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Veröffentlichungsdatum:
SenecavirusSenecavirusSystematikKlassifikation VirenRealm Riboviria 2 1 Reich Orthornavirae 1 Phylum Pisuviricota 1 Klasse Pisoniviricetes 1 Ordnung PicornaviralesFamilie PicornaviridaeGattung SenecavirusTaxonomische MerkmaleGenom ssRNA linearBaltimore Gruppe 4Symmetrie ikosaedrischHulle keineWissenschaftlicher NameSenecavirusLinksNCBI Taxonomy 586425NCBI Reference NC 011349 1ViralZone Expasy SIB 697ICTV Taxon History 201902060Die Gattung Senecavirus umfasst derzeit nur eine Spezies Art eines unbehullten Virus aus der Familie Picornaviridae das fur die Gattung namensgebende Seneca Valley Virus SVV Dieses Virus ist das bislang einzige bekannte apathogene Picornavirus Mitglied der Picornaviridae In seiner naturlichen Form ist es in der Lage spezifische Tumorzellen von einigen Hirntumor Arten zu zerstoren damit besitzt es die Eigenschaft eines onkolytischen Virus Das SVV wurde im Jahr 2002 zufallig in einem Unternehmen fur Gentherapie in Gaithersburg Maryland isoliert Bei der Suche nach Kontaminationen von Zellkulturen wurden aus dem Kulturmedium einer PER C6 Zelllinie transformierte fotale Retinoblastom Zellen mehrere porzine Picornaviren isoliert von denen eines sich als neues Virus herausstellte das schliesslich 2005 als neu charakterisiertes Virus veroffentlicht wurde Da sich die Firma in Gaithersburg im sogenannten Seneca Valley Gebiet des Little Seneca Lakes und des Seneca Creeks befindet wurde das Virus danach benannt Nach seiner Identifizierung konnte es in verschiedenen Hausschweinen von Schweinefarmen in den USA entdeckt werden Inhaltsverzeichnis 1 Genom und Struktur 2 Biologische Eigenschaften 3 Systematik 4 Literatur 5 EinzelnachweiseGenom und Struktur BearbeitenDas Genom besteht aus einer linearen einzelstrangigen RNA mit positiver Polaritat und hat bei dem bisher einzigen bekannten Serotyp SVV 001 eine Lange von 7310 nt Die nicht codierende Region am 5 Ende ist 666 nt lang und beinhaltet eine IRES vom Typ IV die eine Ahnlichkeit zu den IRES Strukturen der Pestiviren aufweist 3 Am 3 Ende befindet sich ebenfalls eine 71 nt lange nicht codierende Region die mit ihrer moglichen Faltungsstruktur typisch ist zur Bildung eines Kissing Loops um beide RNA Enden wahrend der RNA Replikation als Rolling Circle zusammenzufuhren Die grosste Sequenzahnlichkeit besteht zu Mitgliedern der Gattung Cardiovirus und Aphthovirus Im Vergleich zu den Cardioviren und den Erboviren jedoch fehlen dem SVV zwei fur die katalytische Funktion notwendigen Aminsosaurepositionen die ublicherweise die Funktion als Protease und Phosphorylase ermoglichen Dies kann ein Grund fur die fehlende Erkrankung im naturlichen Wirt sein Das 32 5 nm grosse unbehullte Kapsid des SVV besteht aus den vier Kapsidproteinen VP1 VP2 VP3 und VP4 VP fur Virusprotein Die ausseren Proteindomanen von VP1 und VP2 vermitteln sehr wahrscheinlich die Bindung an die Wirtszelle und damit den Zelltropismus des Virus Biologische Eigenschaften BearbeitenDer naturliche Wirt des SVV sind wahrscheinlich Schweine aus denen das Virus zwar isoliert werden kann die aber gleichzeitig keine Symptome einer Erkrankung zeigen Antikorper gegen das SVV konnten auch in weiteren landwirtschaftlichen Nutztieren gefunden werden so bei Rindern und Schafen bei Menschen findet man hingegen keine anti SVV Antikorper In die Zellkultur in der das Virus entdeckt wurde scheint es wahrscheinlich durch fetales Kalber oder Ferkel Serum gelangt zu sein welches zur Kultivierung der Zellen verwendet worden war Das SVV besitzt neben dem naturlichen Zelltropismus im Wirtstier zusatzlich in der Zellkultur einen Tropismus fur Neuroendokrine Tumorzellen wie dem Retinoblastom Neuroblastom Medulloblastom und dem Kleinzelligen Bronchialkarzinom Diese in vitro infizierbaren Zellen werden wahrend der Virusreplikation zerstort Aus diesem Grunde gilt das SVV als ein moglicherweise in der Therapie dieser Tumore anwendbares onkolytisches Virus 4 Systematik BearbeitenGenus SenecavirusSpezies Seneca Valley Virus en Senecavirus A SeVV A 5 6 Serotyp Seneca Valley Virus USA SVV 001 SVV 1 7 dd dd Literatur BearbeitenA M Q King M J Adams E B Carstens E J Lefkowitz Hrsg Virus Taxonomy Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses Amsterdam 2012 ISBN 978 0 12 384684 6 S 872f N J Knowles P L Hallenbeck A new picornavirus is most closely related to cardioviruses EUROPIC 2005 XIIIth Meeting of the European Study Group on the Molecular Biology of Picornaviruses Lunteren Niederlande 23 29 Mai 2005 Abstract A14 Erstbeschreibung N J Knowles et al Epidemiology of Seneca Valley virus Identification and characterization of isolates from pigs in the United States EUROPIC 2005 European Study Group on the Molecular Biology of Picornaviruses XIIIth Meeting Lunteren Niederlande Mai 2005 pdf S Venkataraman et al Structure of Seneca Valley Virus 001 an oncolytic picornavirus representing a new genus Structure 2008 16 10 S 1555 1561 PMID 18940610 PMC 2572565 freier Volltext L M Hales et al Complete genome sequence analysis of Seneca Valley virus 001 a novel oncolytic picornavirus J Gen Virol 2008 89 Pt 5 S 1265 1275 PMID 18420805 S Venkataraman et al Crystallization and preliminary X ray diffraction studies of Seneca Valley virus 001 a new member of the Picornaviridae family Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 2008 64 Pt 4 S 293 296 PMID 18391430 PMC 2374260 freier Volltext Einzelnachweise Bearbeiten a b c d ICTV ICTV Taxonomy history Enterovirus C EC 51 Berlin Germany July 2019 Email ratification March 2020 MSL 35 ICTV Master Species List 2018b v2 MSL 34 Marz 2019 M M Willcocks et al Structural features of the Seneca Valley virus internal ribosome entry site IRES element a picornavirus with a pestivirus like IRES J Virol 2011 85 9 S 4452 4461 PMID 21325406 PMC 3126232 freier Volltext P S Reddy et al Seneca Valley virus a systemically deliverable oncolytic picornavirus and the treatment of neuroendocrine cancers J Natl Cancer Inst 2007 99 21 S 1623 1633 PMID 17971529 ICTV Master Species List 2018a v1 Memento des Originals vom 14 Marz 2019 im Internet Archive nbsp Info Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht gepruft Bitte prufe Original und Archivlink gemass Anleitung und entferne dann diesen Hinweis 1 2 Vorlage Webachiv IABot talk ictvonline org MSL including all taxa updates since the 2017 release Fall 2018 MSL 33 ICTV 2016 Master Species List 31 with Acronyms Excel XLSX auf ViralZone Swiss Institute of Bioinformatics SIB Details Senecavirus A The Picornavirus Pages 2006 2019 The Pirbright Institute UK Abgerufen 17 Februar 2019 Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Senecavirus amp oldid 229630746