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Organic Lake Virophage SystematikKlassifikation VirenRealm Varidnaviria 1 Reich Bamfordvirae 1 Phylum Preplasmiviricota

Organic-Lake-Virophage

Organic-Lake-Virophage
Systematik
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA
Baltimore: Gruppe 1
Hülle: vorhanden
Wissenschaftlicher Name
“Organic Lake virophage”
Kurzbezeichnung
OLV
Links
NCBI Taxonomy: 938080

Der „Organic-Lake-Virophage“ (wissenschaftlich „Organic Lake virophage“, OLV) ist ein doppelsträngiger DNA-Virophage, d. h. ein Virus, für dessen Replikation die Anwesenheit eines anderen Virus (Helfervirus) erforderlich ist, wobei die Replikationsfähigkeit dieses anderen Virus eingeschränkt wird. Er wurde metagenomisch in Proben aus dem Organic Lake in der Antarktis nachgewiesen.

Mit Stand März 2019 ist der OLV nicht vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) registriert. Das National Center for Biotechnology Information (NCBI) versteht das OLV als eine unbestätigte Virusspezies in der Familie Lavidaviridae, zu der auch die vom ICTV bestätigten Gattungen Sputnikvirus (mit den Spezies Sputnik-Virophage und Zamilona-Virophage) und Mavirus gehören.

Aufbau Bearbeiten

Die Virionen (Viruspartikel) von OLV scheinen einen Durchmesser von ca. 100 nm zu haben und umhüllt zu sein. Das Genom besteht aus doppelsträngiger DNA und hat eine Länge von 26.421 bp. Es kodiert 38 Proteine. Dazu gehören das Hüllprotein (englisch major coat protein), eine DNA-Packaging-ATPase, eine mutmaßliche DNA-Polymerase/Primase und eine N6-Adenin-spezifische DNA-Methyltransferase.

Vermehrung Bearbeiten

OLV parasitiert vermutlich Organic-Lake-Phycodnaviren (OLPV), die weniger zu den Phycodnaviridae als vielmehr zu den erweiterten Mimiviridae (d. h. der Ordnung Imitervirales) gehören (Gruppe III: vorgeschlagene Schwesterfamilie „Mesomimiviridae“ um die „OLPG“-Gruppe).

Systematik Bearbeiten

Für die Systematik der Lavidaviridae mit OLV, Sputnikvirus (mit Sputnik- und Zamilon-Virophagen), „Yellowstone-Lake-Virophage 1“ bis „7“ (YSLV1 bis YSLV7) und „Dishui-Lake-Virophage 1“ (DSLV1) wurden Verschiedene Vorschläge gemacht, etwa von Gong et al. (2016), Fig. 5, oder von Krupovic et al. (2016), Fig. 4.

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ S. Yau, F. M. Lauro, M. Z. Demaere, M. V. Brown, Thomas first5=T., M. J. Raftery, C. Andrews-Pfannkoch, M. Lewis, J. M. Hoffman, J. A. Gibson, R. Cavicchioli: Virophage control of antarctic algal host-virus dynamics. In: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108. Jahrgang, Nr. 15, April 2011, S. 6163–6168, doi:10.1073/pnas.1018221108, PMID 21444812, PMC 3076838 (freier Volltext), bibcode:2011PNAS..108.6163Y.
  3. ICTV: ICTV Master Species List 2018b.v2 MSL #34v vom März 2019
  4. NCBI: Organic Lake virophage
  5. Eugene V. Koonin, Mart Krupovic, Natalya Yutin: Evolution of double-stranded DNA viruses of eukaryotes: From bacteriophages to transposons to giant viruses, in: ResearchGate Literature Review, Februar 2015, doi: 10.1111/nyas.12728, Figure 3
  6. Blog of Carolina Reyes, Kenneth Stedman: Are Phaeocystis globosa viruses (OLPG) and Organic Lake phycodnavirus a part of the Phycodnaviridae or Mimiviridae?, on ResearchGate, Jan. 8, 2016
  7. Weijia Zhang, Jinglie Zhou, Taigang Liu, Yongxin Yu, Yingjie Pan, Shuling Yan, Yongjie Wang: Four novel algal virus genomes discovered from Yellowstone Lake metagenomes In: Scientific Reports, 5, Nr. 15131 (2015), doi:10.1038/srep15131
  8. Virus-Host DB: Yellowstone lake mimivirus
  9. Chaowen Gong, Weijia Zhang, Xuewen Zhou, Hongming Wang, Guowei Sun, Jinzhou Xiao, Yingjie Pan, Shuling Yan, Yongjie Wang: Novel Virophages detected in a Freshwater Lake in China. In: Front. Micribiol., 22. Januar 2016, doi:10.3389/fmicb.2016.00005
  10. Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Matthias G. Fischer: A classification system for virophages and satellite viruses, in: Archives of Virology, Januar 2016, Band 161, Nr. 1, S. 233–247, doi:10.1007/s00705-015-2622-9

Weblinks Bearbeiten

  • Organic Lake virophage. In: NCBI Taxonomy Browser. (938080).
  • J. Zhou, W. Zhang, S. Yan, J. Xiao, Y. Zhang, B. Li, Y. Pan, Y. Wang: Diversity of virophages in metagenomic data sets. In: Journal of Virology. Band 87, Nummer 8, April 2013, S. 4225–4236, doi:10.1128/JVI.03398-12, PMID 23408616, PMC 3624350 (freier Volltext).
  • Meriem Bekliz, Philippe Colson, Bernard La Scola; Eric O. Freed (Hrsg.): The Expanding Family of Virophages, in: Viruses v.8(11); November 2016, PMC 5127031 (freier Volltext), PMID 27886075, doi:10.3390/v8110317
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Veröffentlichungsdatum:
Organic Lake VirophageSystematikKlassifikation VirenRealm Varidnaviria 1 Reich Bamfordvirae 1 Phylum Preplasmiviricota 1 Klasse Maveriviricetes 1 Ordnung Priklausovirales 1 Familie LavidaviridaeUnterfamilie nicht klassifiziertGattung nicht klassifiziertArt Organic Lake virophage Taxonomische MerkmaleGenom dsDNABaltimore Gruppe 1Hulle vorhandenWissenschaftlicher Name Organic Lake virophage KurzbezeichnungOLVLinksNCBI Taxonomy 938080Der Organic Lake Virophage wissenschaftlich Organic Lake virophage OLV ist ein doppelstrangiger DNA Virophage d h ein Virus fur dessen Replikation die Anwesenheit eines anderen Virus Helfervirus erforderlich ist wobei die Replikationsfahigkeit dieses anderen Virus eingeschrankt wird Er wurde metagenomisch in Proben aus dem Organic Lake in der Antarktis nachgewiesen 2 Mit Stand Marz 2019 ist der OLV nicht vom International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV registriert 3 Das National Center for Biotechnology Information NCBI versteht das OLV als eine unbestatigte Virusspezies in der Familie Lavidaviridae zu der auch die vom ICTV bestatigten Gattungen Sputnikvirus mit den Spezies Sputnik Virophage und Zamilona Virophage und Mavirus gehoren 4 Inhaltsverzeichnis 1 Aufbau 2 Vermehrung 3 Systematik 4 Einzelnachweise 5 WeblinksAufbau BearbeitenDie Virionen Viruspartikel von OLV scheinen einen Durchmesser von ca 100 nm zu haben und umhullt zu sein Das Genom besteht aus doppelstrangiger DNA und hat eine Lange von 26 421 bp Es kodiert 38 Proteine Dazu gehoren das Hullprotein englisch major coat protein eine DNA Packaging ATPase eine mutmassliche DNA Polymerase Primase und eine N6 Adenin spezifische DNA Methyltransferase 2 Vermehrung BearbeitenOLV parasitiert vermutlich Organic Lake Phycodnaviren OLPV die weniger zu den Phycodnaviridae als vielmehr zu den erweiterten Mimiviridae d h der Ordnung Imitervirales 1 gehoren 5 6 Gruppe III vorgeschlagene Schwesterfamilie Mesomimiviridae um die OLPG Gruppe 7 8 Systematik BearbeitenFur die Systematik der Lavidaviridae mit OLV Sputnikvirus mit Sputnik und Zamilon Virophagen Yellowstone Lake Virophage 1 bis 7 YSLV1 bis YSLV7 und Dishui Lake Virophage 1 DSLV1 wurden Verschiedene Vorschlage gemacht etwa von Gong et al 2016 Fig 5 9 oder von Krupovic et al 2016 Fig 4 10 Einzelnachweise Bearbeiten a b c d e f ICTV ICTV Master Species List 2019 v1 New MSL including all taxa updates since the 2018b release March 2020 MSL 35 a b S Yau F M Lauro M Z Demaere M V Brown Thomas first5 T M J Raftery C Andrews Pfannkoch M Lewis J M Hoffman J A Gibson R Cavicchioli Virophage control of antarctic algal host virus dynamics In Proc Natl Acad Sci U S A 108 Jahrgang Nr 15 April 2011 S 6163 6168 doi 10 1073 pnas 1018221108 PMID 21444812 PMC 3076838 freier Volltext bibcode 2011PNAS 108 6163Y ICTV ICTV Master Species List 2018b v2 MSL 34v vom Marz 2019 NCBI Organic Lake virophage Eugene V Koonin Mart Krupovic Natalya Yutin Evolution of double stranded DNA viruses of eukaryotes From bacteriophages to transposons to giant viruses in ResearchGate Literature Review Februar 2015 doi 10 1111 nyas 12728 Figure 3 Blog of Carolina Reyes Kenneth Stedman Are Phaeocystis globosa viruses OLPG and Organic Lake phycodnavirus a part of the Phycodnaviridae or Mimiviridae on ResearchGate Jan 8 2016 Weijia Zhang Jinglie Zhou Taigang Liu Yongxin Yu Yingjie Pan Shuling Yan Yongjie Wang Four novel algal virus genomes discovered from Yellowstone Lake metagenomes In Scientific Reports 5 Nr 15131 2015 doi 10 1038 srep15131 Virus Host DB Yellowstone lake mimivirus Chaowen Gong Weijia Zhang Xuewen Zhou Hongming Wang Guowei Sun Jinzhou Xiao Yingjie Pan Shuling Yan Yongjie Wang Novel Virophages detected in a Freshwater Lake in China In Front Micribiol 22 Januar 2016 doi 10 3389 fmicb 2016 00005 Mart Krupovic Jens H Kuhn Matthias G Fischer A classification system for virophages and satellite viruses in Archives of Virology Januar 2016 Band 161 Nr 1 S 233 247 doi 10 1007 s00705 015 2622 9Weblinks BearbeitenOrganic Lake virophage In NCBI Taxonomy Browser Abgerufen im 1 Januar 1 938080 J Zhou W Zhang S Yan J Xiao Y Zhang B Li Y Pan Y Wang Diversity of virophages in metagenomic data sets In Journal of Virology Band 87 Nummer 8 April 2013 S 4225 4236 doi 10 1128 JVI 03398 12 PMID 23408616 PMC 3624350 freier Volltext Meriem Bekliz Philippe Colson Bernard La Scola Eric O Freed Hrsg The Expanding Family of Virophages in Viruses v 8 11 November 2016 PMC 5127031 freier Volltext PMID 27886075 doi 10 3390 v8110317 Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Organic Lake Virophage amp oldid 219635336