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Die PVC Gruppe englisch PVC group ist eine Klade Verwandtschaftsgruppe von Bakterien 2 Die Bezeichnung ist ein Akronym benannt nach den ursprunglichen drei Mitglieds Phyla Planctomycetota Planctomycetes Verrucomicrobiota Verrucomicrobia und Chlamydiota Chlamydiae 3 4 PVC GruppeChlamydia trachomatisSystematikKlassifikation LebewesenDomane Bakterien Bacteria ohne Rang Gracilicutesohne Rang PVC GruppeWissenschaftlicher NamePlanctobacteria 1 Cavalier Smith 1987Thomas Cavalier Smith postulierte 2002 dass die Bakterien dieser Gruppe ihre Peptidoglykan Zellwand zweimal verloren oder reduziert haben 5 In seiner Sys tematik nannte er die Gruppe Planctobacteria Planctobakterien im taxonomischen Rang eines Phylums und die namensgebenden Mitglieder lediglich als Klasse 5 Dies wird jedoch von der grosseren wissenschaftlichen Gemeinschaft nicht ubernommen und die PVC Gruppe dagegen eher als Superphylum eingestuft 6 und der Begriff Planctobacteria wird manchmal synonym zum Phylum Planctomycetes verwendet In der bakteriellen Megaklassifikation nach Cavalier Smith gehoren die Plancto bak terien alias PVC Gruppe zum bakteriellen Infrareich englisch infrakingom lateinisch infraregnum Gracilicutes und umfassen neben den genannten Plancto mycetes Verrucomicrobia und Chlamydiae insbesondere auch die Lentisphaerae 5 7 Inhaltsverzeichnis 1 Hypothese zur Eukaryogenese 2 Molekulargenetische Charakterisierung 3 Phylogenie 4 Systematik 5 Synonymien 6 EinzelnachweiseHypothese zur Eukaryogenese BearbeitenPatrick Forterre 2011 und Baum et al 2014 stellten die Hypothese auf dass ein Mitglied der PVC Klade in einem endosymbiotischen Ereignis in der Fruhzeit des Leben Wirtszelle gewesen sein konnte aus der die erste proto eukaryotische Zelle hervorging 8 9 Diese Hypothese steht in Konkurrenz zur Eozyten Hypothese nach der diese Wirtszellen stattdessen bestimmte Archaeen waren nach der ursprunglichen Vermutung Crenarchaeota alias Eozyten Diese Auffassung hat in jungster Zeit Unterstutzung bekommen so vermutet man den Ursprung der Eukaryoten heute eher bei oder in den neu entdeckten und mit den Crenarchaeota weitlaufig verwandten Asgard Archaeen Molekulargenetische Charakterisierung BearbeitenPlanctomycetes Verrucomicrobia und Chlamydiae werden in der konventionellen molekularen Phylogenie als Phyla d h Stamme oder Abteilungen englisch divisions betrachtet und in der PVC Gruppe als Superphylum zusammengefasst zusammen mit weiteren Kandidaten Phyla wie Omnitrophica 10 fruher OP3 und Poribacteria 3 Dies wird begrundet mit der Homologie ihrer 16S rRNA Phylogenetische Baume basierend auf dieser RNA zeigen die eine monophyletische Gruppierung dieser Phyla d h eine Abstammung von einem gemeinsamen Vorfahren 3 Trotz ihres gemeinsamen Ursprungs unterscheiden sich die Mitglieder des PVC Superstamms in Bezug auf Lebensweise Physiologie und Okologie erheblich Es ist daher ein wichtiges Anliegen zusatzlich Molekulare Marker zu identifizieren hochkonservierte Gene und die von ihnen kodierten Proteine die eine Zugehorigkeit zu dieser Gruppe anzeigen 2014 fanden es Ilias Lagkouvardos et al ein solches Protein genannt PVC Superphylum Signaturprotein en PVC superphylum sinature protein 11 Dieses konservierte Signaturprotein wird von allen PVC Mitgliedern mit Ausnahme der Poribacteria geteilt Es konnte daher einen Marker darstellen wie er gesucht wurde d h eine synapomorphe Eigenschaft darstellen und ein Mittel zur Unterscheidung dieser Bakteriengruppe von anderen sein Diesem Protein wurde eine wichtige Funktion bei der DNA RNA Bindung zugeschrieben 11 Diese Beobachtung bietet nicht nur ein Mittel zur Abgrenzung der PVC Supergruppe sondern unterstutzt auch deutlich eine evolutionare Beziehung der Mitglieder dieser Gruppe im Unterschied zu anderen Bakterien 12 13 Es wurden auch Conserved Signature Indels CSIs konservierte Signatur Indels gefunden die spezifisch fur Planctomycetes Verrucomicrobia und Chlamydiae sind und die die jeweiligen Stamme voneinander und von anderen Bakterien unterscheiden 12 14 Es wurde ein Drei Aminosaure Insertion im RNA Polymerase Protein RpoB 15 gefunden das allen sequenzierten Verrucomicrobia Chlamydiae und Lentisphaerae Arten gemeinsam ist Das CSI fehlt bei den benachbarten Planctomycetes und Poribacteria was auf eine gemeinsame Abstammung und nahere Verwandtschaft der Phyla hindeutet fur die das CSI spezifisch ist 12 Weitere Beweise fur die Existenz dieser Untergruppe sind das Vorhandensein von membranartigen Proteinen en membrane coat like proteins Tubulin der Syntheseweg fur Sterol und das Vorhandensein von kondensierter DNA 3 16 Phylogenie Bearbeiten nbsp In diesem Stammbaum des Lebens von 2016 auf Basis ribosomaler Proteine ist das PVC Superphylum auf der linken Seite zu finden 17 Siehe auch Dudek et al 1017 Fig 1 18 Links eine konservative Phylogenie nach Woese 1987 19 Rappe et al 2003 20 Wagner amp Horn 2006 3 und Spring et al 2016 21 rechts eine neuere nach der GTDB Datenbank 22 mit Annotree Mendler et al 2019 23 PVC Gruppe 2016 19 20 3 21 PVC Chlamydiae Verrucomicrobia Lentisphaerae Verrucomicrobia s s Kiritimatillaeota Chlamydiae Omnitrophica Planctomycetes AureabacteriaVorlage Klade Wartung Style PVC Gruppe 2019 22 PVC Chlamydiae Verrucomicrobia Verrucomicrobia s l Lentisphaerae Verrucomicrobiae Kiritimatiellae Chlamydiae Aureabacteria Omnitrophica Ratteibacteria PlanctomycetesVorlage Klade Wartung Style Eine ahnliche Situation ist bei der FCB Gruppe zu beobachten Systematik BearbeitenDie hier angegebene Konsensus Taxonomie der PVC Gruppe basiert mit Stand 15 Marz 2022 Update 17 September 2023 auf den folgenden Quellen L List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature LPSN Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen DSMZ 24 N National Center for Biotechnology Information NCBI Taxonomy Browser 2 G Genome Taxonomy Database GTDB University of Queensland UQ Australien 22 23 hier nur nachrangig eingeflossen siehe Anmerkung unten LPSN kennt die Supergruppe PVC selbst nicht daher sind unten die jeweiligen Mitgliedsphyla einzeln referenziert Die GTDB versteht abweichend von der folgenden Systematik das Phylum Verrucomicrobiota im weiteren Sinne d h es schliesst die Kiritimatiellae vorher Kiritimatiellaeota und Lentrispheria vorher Lentisphaerae etc mit ein die in diesem Zug von Phyla zu Klassen degradiert werden 25 Ublicherweise sind von den PVC Subtaxa nur die Klassen ausgefuhrt Mit Anfuhrungszeichen veroffentlichte Namen sind nicht gultig veroffentlicht weniger gebrauchliche Synonyme sind als Anmerkungen wiedergegeben Klade Superphylum PVC Gruppe englisch PVC group N alias Planctobacteria Cavalier Smith 1987 N Klade Chlamydiae Verrucomicrobia group N alias Chlamydiales Verrucomicrobia group N Phylum Chlamydiota Garrity amp Holt 2021 L N fruher Chlamydiae Garrity amp Holt 2012 26 S 1 Klasse Chlamydiia Horn 2016 G L bzw Horn 2011 emend Gupta et al 2016 N Phylum Kiritimatiellaeota Spring et al 2016 L N 27 S 2 Klasse Kiritimatiellae Spring et al 2017 L N G zu Verrucomicrobiota Klasse Tichowtungiia Mu et al 2020 L N G zu Kiritimatiellae mitSpezies Tichowtungia aerotolerans Mu et al 2020 N inkl Kiritimatiellaeota bacterium S 5007 G N alias UBA5540 sp009905215 G 28 dd dd Phylum Lentisphaeraeota Cho et al 2021 L N fruher Lentisphaerae Cho et al 2004 N 29 S 3 Klasse Lentisphaeria Cho et al 2012 L N G zu Verrucomicrobiota Klasse Oligosphaeria Qiu et al 2013 L N G zu Lentisphaeria Klade Candidate division VadinBE97 N Synonym Lentisphaerae subgroup L2 N mitSpezies Uncultured candidate division VadinBE97 bacterium N 09N211B 30 dd dd Phylum Verrucomicrobiota Hedlund 2021 G L N mit Synonymen Verrucomicrobaeota Oren et al 2015 L N Verrucomicrobia Hedlund L N 31 32 S 4 Klasse Methylacidiphilae N mit Klasse Opitutae Choo et al 2007 L N S 5 bei GTDB Ordnung Opitutales innerhalb Klasse Verrucomicrobiae mit Klasse Spartobacteria Sangwan et al 2004 L N Synonym Verrucomicrobia subdivision 2 N Xiphinematobacteriaceae N bei GTDB zu Ordnung Chthoniobacterales innerhalb Klasse Verrucomicrobiae mit Klasse Terrimicrobia Garcia Lopez et al 2020 L N bei GTDB Familie Terrimicrobiaceae zu Ordnung Chthoniobacterales Klasse Verrucomicrobiae Hedlund et al 1998 emend Yoon et al 2008 N S 6 dd Phyla ohne Zuordnung zu einer Subklade der PVC Gruppe Phylum Planctomycetota G L N mit Synonym Planctomycetes L N 33 S 7 Klasse Phycisphaerae Fukunaga et al 2010 G L N Klasse Planctomycetia Ward L N mit Synonym Planctomycetes Oren et al S 8 Klasse Candidatus Brocadiia Lodha et al 2021 N Synonym Ca Brocadiae Jenkins amp Staley 2013 G L N Klasse Candidatus Uabimicrobiia Lodha et al 2021 L N alias J132 G Phylum Candidatus Abyssubacteria G L N 34 S 9 Klasse SURF 5 G 35 mitSpezies Ca Abyssubacteria bacterium SURF 5 N alias SURF 5 sp003598085 G und Spezies Ca Abyssubacteria bacterium SURF 17 N alias SURF 17 sp003598055 G dd dd dd Phylum Candidatus Aureabacteria Momper et al 2017 G N Synonym Candidate phylum SURF CP 2 N 36 Phylum Candidatus Omnitrophica Rinke et al 2013 L N Synonym Ca Omnitrophicaeota N Ca Omnitrophota G N 37 38 39 S 10 Klasse Omnitrophia G Klasse 4484 213 G Klasse JACPQZ01 G Klasse Koll11 G dd Phyla incertae sedis Phylum Elusimicrobiota Geissinger et al 2021 mit Synonym Elusimicrobia phylum Geissinger et al 2010 40 41 S 11 Synonymien Bearbeiten Chlamydiae Garrity amp Holt 2012 N bzw Chlamydiae Garrity amp Holt 2001 L Synonyme Chlamydaeota Oren et al 2015 L N Chlamydiota Garrity amp Holt 2021 G L N Chlamydiota Whitman et al 2018 L Kiritimatiellaeota Spring et al 2016 L N Synonyme Kiritimatiellota Spring et al 2021 L Verrucomicrobia subdivision 5 N Lentisphaerae Cho et al 2004 N Synonyme Lentisphaeraeota Oren et al 2015 L N Lentisphaerota Whitman et al 2018 L N Verrucomicrobia Hedlund 2012 N oder 2021 L bzw Hedlund et al 1997 Yoon et al 2010 N Synonyme Verrucomicrobia Hedlund et al 1997 L oder Hedlund 2010 L Yoon et al 2010 L Verrucomicrobaeota Oren et al 2015 L N bzw Verrucomicrobiota Whitman et al 2018 G L N Opitutae Choo et al 2007 L N Synonyme Opitutia Cavalier Smith 2020 L Verrucomicrobia subdivision 4 N Verrucomicrobiae Hedlund et al 1998 emend Yoon et al 2008 N bzw Hedlund et al 1998 G L Synonym Verrucomicrobiia Cavalier Smith 2020 L Planctomycetes Garrity amp Holt 2001 emend Ward 2011 N Synonyme Planctomycetes Garrity amp Holt 2001 L Planctomycetaeota Oren et al 2015 L N Planctomycetota Garrity amp Holt 2021 G L N und Planctomycetota Whitman et al 2018 L Planctobacteria Cavalier Smith 1987 Cavalier Smith 2002 L Planctomycetia Ward 2011 N und Cavalier Smith 2020 L bzw Planctomycetia Ward 2020 L Synonyme Planctomycetacia Garrity amp Holt 2001 L N Planctomycea Cavalier Smith 2002 L N Planctomycetes Oren et al 2015 L bzw Planctomycetes Oren et al 2015 emend Lodha et al 2021 G N Candidatus Abyssubacteria G L N mit Schreibvariante Ca Abyssobacteria corrig Momper et al 2018 L Synonyme Ca Abyssubacteria Momper et al 2018 L Candidate division SURF CP 1 N Candidatus Omnitrophica Rinke et al 2013 L N Synonyme Ca Omnitrophicaeota N Ca Omnitrophota G N Candidate division WOR 2 N Candidate division White Oak River group 2 N Candidate division OP3 N Candidate division Obsidian Pool 3 N Elusimicrobiota Geissinger et al 2021 bzw Elusimicrobiota Whitman et al 2018 mit Synonymen Elusimicrobaeota Oren et al 2015 Elusimicrobia phylum Geissinger et al 2010 Candidate phylum division TG1 Candidate phylum division Termite Group 1Einzelnachweise Bearbeiten Thomas Cavalier Smith The Origin of Eukaryote and Archaebacterial Cells In Annals of the New York Academy of Sciences Band 503 Nr 1 Juli 1987 S 17 54 doi 10 1111 j 1749 6632 1987 tb40596 x PMID 3113314 a b NCBI PVC group Details PVC group clade includes Chlamydiae Verrucomicrobia group alias Chlamydiales Verrucomicrobia graphisch PVC group Lifemap NCBI Version a b c d e f Michael Wagner Matthias Horn The Planctomycetes Verrucomicrobia Chlamydiae and sister phyla comprise a superphylum with biotechnological and medical relevance In 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Rose S Kantor Daniela S Aliaga Goltsman Elisabeth M Bik Brian C Thomas Jillian F Banfield David A Relman Novel Microbial Diversity and Functional Potential in the Marine Mammal Oral Microbiome In Current Biology Band 27 Nr 24 S 3752 3762 e6 18 Dezember 2017 doi 10 1016 j cub 2017 10 040 PMID 29153320 Epub 16 November 2017 Siehe insbes Fig 1 a b Carl R Woese Bacterial evolution In Microbiological Reviews Band 51 Nr 2 1 Juni 1987 S 221 271 doi 10 1128 MMBR 51 2 221 271 1987 PMID 2439888 PMC 373105 freier Volltext a b Michael S Rappe Stephen J Giovannoni The Uncultured Microbial Majority In Annual Review of Microbiology Band 57 Oktober 2003 S 369 394 doi 10 1146 annurev micro 57 030502 090759 PMID 14527284 a b Stefan Spring Boyke Bunk Cathrin Sproer Peter Schumann Manfred Rohde Brian J Tindall Hans Peter Klenk Characterization of the first cultured representative of Verrucomicrobia subdivision 5 indicates the proposal of a novel phylum In Nature The ISME Journal Band 10 14 Juni 2016 S 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candidate division TG1 candidate division Termite Group 1 candidate phylum Termite Group 1 Abgerufen von https de wikipedia org w index php title PVC Gruppe amp oldid 237566152