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Mollivirus sibericum SystematikKlassifikation VirenRealm Varidnaviria 1 Reich Bamfordvirae 1 Phylum Nucleocytoviricota 1

Mollivirus sibericum

„Mollivirus sibericum“

„Mollivirus sibericum“

Systematik
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Wissenschaftlicher Name
„Mollivirus sibericum“
Kurzbezeichnung
„MolliV“
Links
NCBI Taxonomy: 1678078
NCBI Reference: KR921745

„Mollivirus sibericum“ (‚Sibirisches Weichvirus‘ nach lateinisch mŏllĭs  ‚weich‘) ist ein DNA-Virus aus dem Jungpaläolithikum, das 2015 von französischen Wissenschaftlern des CNRS im Permafrostboden Nord-Ost-Russlands gefunden wurde. Mit einem Durchmesser von rund 600 nm gehört es möglicherweise zu den größten beschriebenen Viren oder virenähnlichen Organismen. „Mollivirus sibericum“ wurde 2015 in einer etwa 30.000 Jahre alten Schicht im Permafrostboden Sibiriens in etwa 30 Metern Tiefe gefunden. Es gibt Hinweise auf eine entfernte Verwandtschaft mit den Phycodnaviren: „Mollivirus“ hat wie die Pandoraviren offenbar einen gemeinsamen Vorfahren mit der Gattung Coccolithovirus innerhalb der Familie der Phycodnaviridae, was eine Zuordnung zu dieser Familie nahelegt.

Die hier vorgeschlagene Gattung „Mollivirus“ ist zu unterscheiden von der offiziellen Maribacter-Phagengattung Mollyvirus (Caudoviricetes).

Genom Bearbeiten

Das Genom von „Mollivirus sibericum“ (Isolat P1084-T) hat eine Länge von 651.523 Basenpaaren und kodiert vorhergesagt 523<1--sic!--> Proteine. Der GC-Gehalt liegt bei 60 %.

Systematik Bearbeiten

Innere Systematik Bearbeiten

Laut CNRS (2019) gibt es neben dem ursprünglichen „Mollivirus sibericum“ inzwischen noch eine zweite Spezies „Mollivirus kamchatka“.

Äußere Systematik Bearbeiten

Schulz et al., schlugen im November 2018 im Detail folgende Systematik vor:

 Phycodnaviridae  





„Yellowstone lake phycodnavirus 1“, „2“, „3“


   

Prasinovirus



   

Chlorovirus



   

Phaeovirus


   

„Mollivirus“


   

„Pandoravirus“





   

‚Sylvanvirus‘



   

Coccolithovirus



Vorlage:Klade/Wartung/Style

Mit den Phycodnaviridae als einer vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) anerkannten Virusfamilie bliebe für die Mollivirus-Klade anstelle einer eigenen Familie „Molliviridae“ wie gelegentlich vorgeschlagen allenfalls der Rang einer Unterfamilie, sollten sich diese Verwandtschaftsbeziehungen bestätigen: Der Sachverhalt ist derselbe wie bei den Pandora- und Coccolithoviren.

Literatur Bearbeiten

Weblinks Bearbeiten

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. David M. Needham, Susumu Yoshizawa, Toshiaki Hosaka, Camille Poirier, Chang Jae Choi, Elisabeth Hehenberger, Nicholas A. T. Irwin, Susanne Wilken, Cheuk-Man Yung, Charles Bachy, Rika Kurihara, Yu Nakajima, Keiichi Kojima, Tomomi Kimura-Someya, Guy Leonard, Rex R. Malmstrom, Daniel R. Mende, Daniel K. Olson, Yuki Sudo, Sebastian Sudek, Thomas A. Richards, Edward F. DeLong, Patrick J. Keeling, Alyson E. Santoro, Mikako Shirouzu, Wataru Iwasaki, Alexandra Z. Worden: (Memento des Originals vom 26. September 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/www.pnas.org, in: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, PDF
  3. E. Pertsch: Langenscheidts Handwörterbuch Lateinisch-Deutsch, 7. Aufl., 1978, ISBN 3-468-07200-7; sowie PONS Online-Wörterbuch
  4. M. Legendre et al.: In-depth study of Mollivirus sibericum, a new 30,000-y-old giant virus infecting Acanthamoeba. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. (2015) 112(38): E5327-5335 PMID 26351664
  5. ↑ Frederik Schulz, Lauren Alteio, Danielle Goudeau, Elizabeth M. Ryan, Feiqiao B. Yu, Rex R. Malmstrom, Jeffrey Blanchard, Tanja Woyke: Hidden diversity of soil giant viruses, in: Nature Communicationsvolume 9, Article number: 4881 (2018) vom 19. November 2018, doi:10.1038/s41467-018-07335-2
  6. (Memento des Originals vom 14. März 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org, auf: ICTV - MSL including all taxa updates since the 2017 release
  7. NCBI: Maribacter phage Molly (species)
  8. ICTV. Taxonomy history: Mollyvirus
  9. David M. Needham, Alexandra Z. Worden et al.: (Memento des Originals vom 26. September 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/www.pnas.org, in: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, hier: Supplement 1 (xlsx)@1@2Vorlage:Toter Link/www.pnas.org (Seite nicht mehr abrufbar, festgestellt im März 2022. Suche in Webarchiven.)  Info: Der Link wurde automatisch als defekt markiert. Bitte prüfe den Link gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
  10. Centre national de la recherche scientifique: List of the main “giant” viruses known as of today (March 2019), Université Aix Marseille, März 2019.
  11. Die Gattungen Prymnesiovirus und Raphidovirus sind in dieser Arbeit nicht berücksichtigt, Phaeovirus ist als Phaevirus verschrieben. Mit YLPV scheinen Yellowstone Phycodnavirus YSLPV 1 bis 3 gemeint zu sein, die Schreibweise Yellow Lake Phycodnavirus (Ylpv-A, Ylpv-B) findet sich sonst nur bei Kinyanyi et al. (2018). Zur Klärung siehe Zhang et al. (2015)
  12. Korrigiert, siehe Phycodnaviridae §Systematik
  13. Centre national de la recherche scientifique: List of the main “giant” viruses known as of today, Université Aix Marseille, 18. April 2018
  14. Chantal Abergel: (Memento des Originals vom 20. Dezember 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/www.i2bc.paris-saclay.fr, 24. März 2017, Laboratoire Information Génomique et Structurale (IGS), Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM), Marseille, France
  15. Claire Bertelli, Linda Mueller, Vincent Thomas, Trestan Pillonel, Nicolas Jacquier, Gilbert Greub: Cedratvirus lausannensis – digging into Pithoviridae diversity, Environmental Microbiology (2017) 19 (10), S. 4022–4034,doi:10.1111/1462-2920.13813
  16. Bruno Guigliarelli, Bénédicte Burlat: PhD proposal: Structure and functional role of a new iron-sulfur protein family in giant viruses, Ecole Doctorale des Sciences Chimiques ED250, 2017
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Veröffentlichungsdatum:
Mollivirus sibericum Mollivirus sibericum SystematikKlassifikation VirenRealm Varidnaviria 1 Reich Bamfordvirae 1 Phylum Nucleocytoviricota 1 Klasse Megaviricetes 1 Ordnung Algavirales 1 Familie Phycodnaviridae Molliviridae Gattung Mollivirus Art Mollivirus sibericum Taxonomische MerkmaleGenom dsDNA linearBaltimore Gruppe 1Wissenschaftlicher Name Mollivirus sibericum Kurzbezeichnung MolliV 2 LinksNCBI Taxonomy 1678078NCBI Reference KR921745 Mollivirus sibericum Sibirisches Weichvirus nach lateinisch mŏllĭs 3 weich ist ein DNA Virus aus dem Jungpalaolithikum das 2015 von franzosischen Wissenschaftlern des CNRS im Permafrostboden Nord Ost Russlands gefunden wurde Mit einem Durchmesser von rund 600 nm gehort es moglicherweise zu den grossten beschriebenen Viren oder virenahnlichen Organismen Mollivirus sibericum wurde 2015 in einer etwa 30 000 Jahre alten Schicht im Permafrostboden Sibiriens in etwa 30 Metern Tiefe gefunden 4 Es gibt Hinweise auf eine entfernte Verwandtschaft mit den Phycodnaviren Mollivirus hat wie die Pandoraviren offenbar einen gemeinsamen Vorfahren mit der Gattung Coccolithovirus innerhalb der Familie der Phycodnaviridae 5 6 was eine Zuordnung zu dieser Familie nahelegt Die hier vorgeschlagene Gattung Mollivirus ist zu unterscheiden von der offiziellen Maribacter Phagengattung Mollyvirus Caudoviricetes 7 8 Inhaltsverzeichnis 1 Genom 2 Systematik 2 1 Innere Systematik 2 2 Aussere Systematik 3 Literatur 4 Weblinks 5 EinzelnachweiseGenom BearbeitenDas Genom von Mollivirus sibericum Isolat P1084 T hat eine Lange von 651 523 Basenpaaren und kodiert vorhergesagt 523 lt 1 sic gt Proteine Der GC Gehalt liegt bei 60 9 Systematik BearbeitenInnere Systematik Bearbeiten Laut CNRS 2019 gibt es neben dem ursprunglichen Mollivirus sibericum inzwischen noch eine zweite Spezies Mollivirus kamchatka 10 Aussere Systematik Bearbeiten Schulz et al schlugen im November 2018 im Detail folgende Systematik vor 5 11 Phycodnaviridae Yellowstone lake phycodnavirus 1 2 3 12 Prasinovirus Chlorovirus Phaeovirus Mollivirus Pandoravirus Sylvanvirus CoccolithovirusVorlage Klade Wartung StyleMit den Phycodnaviridae als einer vom International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV anerkannten Virusfamilie bliebe fur die Mollivirus Klade anstelle einer eigenen Familie Molliviridae wie gelegentlich vorgeschlagen 13 14 15 16 allenfalls der Rang einer Unterfamilie sollten sich diese Verwandtschaftsbeziehungen bestatigen Der Sachverhalt ist derselbe wie bei den Pandora und Coccolithoviren Literatur BearbeitenDickson Kinyanyi George Obiero Peris W Amwayi Stephen Mwaniki Mark Wamalwa In silico structural and functional prediction of African swine fever virus protein B263R reveals features of a TATA binding protein in PeerJ 6 4 e4396 2018 doi 10 7717 peerj 4396 S 13 insbes Fig 7 Weijia Zhang Jinglie Zhou Taigang Liu Yongxin Yu Yingjie Pan Shuling Yan Yongjie Wang Four novel algal virus genomes discovered from Yellowstone Lake metagenomes in Scientific Reports volume 5 Artikel Nr 15131 2015 doi 10 1038 srep15131 Abstract Graziele Oliveira Bernard La Scola Jonatas Abrahao Giant virus vs amoeba fight for supremacy in Virol J 16 126 4 November 2019 doi 10 1186 s12985 019 1244 3 PDFWeblinks BearbeitenJean Luc Goudet Un virus geant Mollivirus renait du sol gele apres 30 000 ans auf Futura Sante futura sciences com 8 September 2015 mit bildlichen Darstellungen franzosisch Einzelnachweise Bearbeiten a b c d e ICTV ICTV Master Species List 2019 v1 New MSL including all taxa updates since the 2018b release March 2020 MSL 35 David M Needham Susumu Yoshizawa Toshiaki Hosaka Camille Poirier Chang Jae Choi Elisabeth Hehenberger Nicholas A T Irwin Susanne Wilken Cheuk Man Yung Charles Bachy Rika Kurihara Yu Nakajima Keiichi Kojima Tomomi Kimura Someya Guy Leonard Rex R Malmstrom Daniel R Mende Daniel K Olson Yuki Sudo Sebastian Sudek Thomas A Richards Edward F DeLong Patrick J Keeling Alyson E Santoro Mikako Shirouzu Wataru Iwasaki Alexandra Z Worden A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators Memento des Originals vom 26 September 2019 im Internet Archive nbsp Info Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht gepruft Bitte prufe Original und Archivlink gemass Anleitung und entferne dann diesen Hinweis 1 2 Vorlage Webachiv IABot www pnas org in PNAS 23 September 2019 doi 10 1073 pnas 1907517116 ISSN 0027 8424 PDF E Pertsch Langenscheidts Handworterbuch Lateinisch Deutsch 7 Aufl 1978 ISBN 3 468 07200 7 sowie PONS Online Worterbuch M Legendre et al In depth study of Mollivirus sibericum a new 30 000 y old giant virus infecting Acanthamoeba Proc Natl Acad Sci U S A 2015 112 38 E5327 5335 PMID 26351664 a b Frederik Schulz Lauren Alteio Danielle Goudeau Elizabeth M Ryan Feiqiao B Yu Rex R Malmstrom Jeffrey Blanchard Tanja Woyke Hidden diversity of soil giant viruses in Nature Communicationsvolume 9 Article number 4881 2018 vom 19 November 2018 doi 10 1038 s41467 018 07335 2 ICTV 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