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Marnaviridae EM Aufnahme von Partikeln desHeterosigma akashiwo RNA virus HaRNAV Maßstab 50 nm SystematikKlassifikation V

Marnaviridae

Marnaviridae

EM-Aufnahme von Partikeln des
Heterosigma akashiwo RNA virus
(HaRNAV). Maßstab 50 nm.

Systematik
Taxonomische Merkmale
Wissenschaftlicher Name
Marnaviridae
Links
NCBI Taxonomy: 324901
ViralZone (Expasy, SIB): 170
ICTV Taxon History: 201901949

Marnaviridae ist die Bezeichnung einer Familie von positiv-einzelsträngigen RNA-Viren in der Ordnung Picornavirales. Die erste Art (Spezies) dieser Familie, die isoliert wurde (und daher die Typusart der Familie darstellt), ist das Heterosigma akashiwo RNA-Virus (HaRNAV) in der Gattung Marnavirus, das die toxische, blütenbildende Raphidophyten-Alge Heterosigma akashiwo infiziert. Auf Basis von DNA-Sequenzierungen wurden weitere zwanzig marine RNA-Virusspezies in die Familie aufgenommen, verteilt auf sechs Gattungen.

HaRNAV wurde aus dem Wasser in der Straße von Georgia in British Columbia (Kanada) isoliert, aus einer konzentrierten Virusansammlung mit dem Wirt Heterosigma akashiwo (NEPCC 522). HaRNAV darf nicht mit anderen Viren verwechselt werden, die diesen Wirt infizieren, wie z. B. dem dsDNA-Virus Heterosigma akashiwo virus 01 (HaV-1, mit Isolat HaV53) aus der Gattung Raphidovirus oder dem „Heterosigma akashiwo Nuclear Inclusion Virus“ (HaNIV, Vorschlag, ?Gattung Protobacilladnavirus).

Beschreibung Bearbeiten

H. akashiwo von der Linie [en] CCMP-452.
Schemazeichnung von H. akashiwo
Genomkarte der Marnaviridae.
Modifiziert nach ViralZone.
Schemazeichnung eines Virions der Familie Marnaviridae, Querschnitt und Seitenansicht.
Chaetoceros tenuissimus RNA virus 01, Gattung Bacillarnavirus: Die MCPs sind in Grün, Magenta und Cyan eingefärbt und das mCP in Gelb..

Die Viren der Marnaviridae sind nicht umhüllt und haben ikosaedrische Geometrie mit einer Triangulationszahl T=pseudo3. Der Durchmesser beträgt etwa 25 nm. Das Genom ist linear und monopartit (nicht segmentiert), mit einer Länge von ca. 8,6 kb (Kilobasen). Das Kapsid besteht aus drei Hauptkapsidproteinen (major capsid proteins, MCPs: VP1, VP2, VP3), die jeweils eine Jelly-Roll-Faltung aufweisen, und einem Minor-Capsid-Protein (minor capsid proteins, mCP), das sich auf der Innenseite des Kapsids an den Polen der Fünffach-Achse befindet.

Reproduktionszyklus Bearbeiten

Die Replikation folgt dem üblichen Schema für (+)ssRNA-Viren (en. positive stranded RNA virus replication model). Die Transkription folgt ebenfalls dem üblichen Schema für (+)ssRNA-Viren (en. positive stranded RNA virus transcription). Die neu gebildeten Virionen verlassen die Wirtszelle durch tubulusgeführte Virusbewegung (en. tubule-guided viral movement).

Als natürliche Wirte des einzigen gut bekannten Mitglieds HaRNAV der Familie Marnaviridae dient Heterosigma akashiwo (Raphidophyceae). Es wird angenommen, dass auch die anderen Vertreter marines Phytoplankton infizieren.

Systematik Bearbeiten

Die Systematik der Marnaviridae ist nach ICTV mit Stand Anfang April 2021 wie folgt:

Ordnung: Picornavirales

  • Familie: Marnaviridae

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35).
  2. Marnaviridae - Positive Sense RNA Viruses - Positive Sense RNA Viruses (2011) - International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). In: International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Abgerufen am 27. April 2017 (englisch).
  3. Virus Taxonomy: 2014 Release. ICTV, abgerufen am 15. Juni 2015.
  4. A. S. Lang, A. I. Culley, C. A. Suttle: Genome sequence and characterization of a virus (HaRNAV) related to picorna-like viruses that infects the marine toxic bloom-forming alga Heterosigma akashiwo. In: Virology. 320. Jahrgang, Nr. 2, 2004, S. 206–217, doi:10.1016/j.virol.2003.10.015, PMID 15016544.
  5. M. Vlok, A. S. Lang, C. A. Suttle: Application of a sequence-based taxonomic classification method to uncultured and unclassified marine single-stranded RNA viruses in the order Picornavirales. In: Virus Evolution. 31;5(2):vez056. Jahrgang, 2019, doi:10.1093/ve/vez056, PMID 31908848.
  6. Vera Tai, Janice E. Lawrence, Andrew S. Lang, Amy M. Chan, Alexander I. Culley, Curtis A. Suttle: Characterization of HaRNAV, a single-stranded RNA virus causing lysis of Heterosigma akashiwo (Raphidophyceae). In: Journal of Phycology. 39. Jahrgang, Nr. 2, 28. März 2003, S. 206–217, doi:10.1046/j.1529-8817.2003.01162.x.
  7. Janice E. Lawrence, Amy M. Chan, Curtis A. Suttle: A novel virus (HaNIV) causes lysis of the toxic bloom-forming alga Heterosigma akashiwo (Raphidophyceae). In: Journal of Phycology. 37. Jahrgang, Nr. 2, 1. Mai 2002, S. 216–222, doi:10.1046/j.1529-8817.2001.037002216.x.
  8. Y. Bettarel, J. Kan, K. Wang, Kurt E. Williamson, S. Cooney, S. Ribblett, F. Chen, K. Wommack, D. Coats: Isolation and preliminary characterisation of a small nuclear inclusion virus infecting the diatom Chaetoceros cf. gracilis, auf: Semantic Scholar – Biology – Aquatic Microbial Ecology, Corpus ID: 56157535, 2005, doi:10.3354/AME040103. „Chaetoceros nuclear inclusion virus: CspNIV“, „CspNIV shows some strong similarities with Heterosigma akashiwo nuclear inclusion virus (HaNIV)“
  9. Keizo Nagasaki: Dinoflagellates, diatoms, and their viruses, in: The Journal of Microbiology 46(3), Juli 2008, S. 235–243, doi:10.1007/s12275-008-0098-y. „CspNIV shows some strong similarities with Heterosigma akashiwo nuclear inclusion virus (HaNIV)“
  10. Stephanie Boone: Viruses and Algae, Februar 2004
  11. ↑ Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 15. Juni 2015.
  12. Anna Munke, Kei Kimura, Yuji Tomaru, Kenta Okamoto: Capsid Structure of a Marine Algal Virus of the Order. In: Journal of Virology. 94. Jahrgang, Nr. 9, 16. April 2020, doi:10.1128/JVI.01855-19.
  13. NCBI: Marnavirus (genus)
  14. NCBI: Heterosigma akashiwo RNA virus SOG263
  15. UniProt: UniProt: Proteomes - Heterosigma akashiwo RNA virus (strain SOG263)

Weblinks Bearbeiten

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Veröffentlichungsdatum:
MarnaviridaeEM Aufnahme von Partikeln desHeterosigma akashiwo RNA virus HaRNAV Massstab 50 nm SystematikKlassifikation VirenRealm Riboviria 1 Reich Orthornavirae 1 Phylum Pisuviricota 1 Klasse Pisoniviricetes 1 Ordnung PicornaviralesFamilie MarnaviridaeTaxonomische MerkmaleGenom ssRNA linearBaltimore Gruppe 4Symmetrie ikosaedrischHulle keineWissenschaftlicher NameMarnaviridaeLinksNCBI Taxonomy 324901ViralZone Expasy SIB 170ICTV Taxon History 201901949Marnaviridae ist die Bezeichnung einer Familie von positiv einzelstrangigen RNA Viren in der Ordnung Picornavirales 2 Die erste Art Spezies dieser Familie die isoliert wurde und daher die Typusart der Familie darstellt ist das Heterosigma akashiwo RNA Virus HaRNAV in der Gattung Marnavirus 3 das die toxische blutenbildende Raphidophyten Alge Heterosigma akashiwo infiziert 4 Auf Basis von DNA Sequenzierungen wurden weitere zwanzig marine RNA Virusspezies in die Familie aufgenommen verteilt auf sechs Gattungen 5 HaRNAV wurde aus dem Wasser in der Strasse von Georgia in British Columbia Kanada isoliert aus einer konzentrierten Virusansammlung mit dem Wirt Heterosigma akashiwo NEPCC 522 6 HaRNAV darf nicht mit anderen Viren verwechselt werden die diesen Wirt infizieren wie z B dem dsDNA Virus Heterosigma akashiwo virus 01 HaV 1 mit Isolat HaV53 aus der Gattung Raphidovirus oder dem Heterosigma akashiwo Nuclear Inclusion Virus HaNIV Vorschlag Gattung Protobacilladnavirus 7 8 9 10 Inhaltsverzeichnis 1 Beschreibung 2 Reproduktionszyklus 3 Systematik 4 Einzelnachweise 5 WeblinksBeschreibung Bearbeiten nbsp H akashiwo von der Linie en CCMP 452 nbsp Schemazeichnung von H akashiwo nbsp Genomkarte der Marnaviridae Modifiziert nach ViralZone 11 nbsp Schemazeichnung eines Virions der Familie Marnaviridae Querschnitt und Seitenansicht 11 nbsp Chaetoceros tenuissimus RNA virus 01 Gattung Bacillarnavirus Die MCPs sind in Grun Magenta und Cyan eingefarbt und das mCP in Gelb Die Viren der Marnaviridae sind nicht umhullt und haben ikosaedrische Geometrie mit einer Triangulationszahl T pseudo3 Der Durchmesser betragt etwa 25 nm Das Genom ist linear und monopartit nicht segmentiert mit einer Lange von ca 8 6 kb Kilobasen 11 Das Kapsid besteht aus drei Hauptkapsidproteinen major capsid proteins MCPs VP1 VP2 VP3 die jeweils eine Jelly Roll Faltung aufweisen und einem Minor Capsid Protein minor capsid proteins mCP das sich auf der Innenseite des Kapsids an den Polen der Funffach Achse befindet 12 Reproduktionszyklus BearbeitenDie Replikation folgt dem ublichen Schema fur ssRNA Viren en positive stranded RNA virus replication model Die Transkription folgt ebenfalls dem ublichen Schema fur ssRNA Viren en positive stranded RNA virus transcription Die neu gebildeten Virionen verlassen die Wirtszelle durch tubulusgefuhrte Virusbewegung en tubule guided viral movement 11 Als naturliche Wirte des einzigen gut bekannten Mitglieds HaRNAV der Familie Marnaviridae dient Heterosigma akashiwo Raphidophyceae Es wird angenommen dass auch die anderen Vertreter marines Phytoplankton infizieren 11 Systematik BearbeitenDie Systematik der Marnaviridae ist nach ICTV mit Stand Anfang April 2021 wie folgt 1 Ordnung Picornavirales Familie MarnaviridaeGattung Bacillarnavirus drei Arten Spezies Chaetoceros socialis forma radians RNA virus 1 Wirtsgattung Chaetoceros Spezies Chaetoceros tenuissimus RNA virus 01 CtenRNAV Wirtsgattung Chaetoceros Spezies Rhizosolenia setigera RNA virus 01 Wirtsgattung Rhizosolenia dd Gattung Kusarnavirus eine Art Spezies Astarnavirus mit Asterionellopsis glacialis RNA virus Wirtsgattung Asterionellopsis dd Gattung Labyrnavirus eine Art Spezies Aurantiochytrium single stranded RNA virus 01 Wirtsgattung Aurantiochytrium dd Gattung Locarnavirus vier Arten Spezies Jericarnavirus B Spezies Sanfarnavirus 1 Spezies Sanfarnavirus 2 Spezies Sanfarnavirus 3 dd Gattung Marnavirus eine bestatigte Art mehrere vorgeschlagene 13 Spezies Heterosigma akashiwo RNA virus HaRNAV mit Isolat SOG263 14 15 Wirtsspezies Heterosigma akashiwo Spezies Forsythia suspensa marnavirus Wirtsspezies Hange Forsythie Spezies Kummerowia striata marnavirus Wirtsgattung Kummerowia Spezies Lactuca sativa marnavirus Wirtsgattung Lactuca Spezies Lindernia crustacea marnavirus Wirtsgattung Lindernia Spezies Trichosanthes kirilowii marnavirus Wirtsspezies Trichosanthes kirilowii Spezies Zehneria japonica marnavirus Wirtsgattung Zehneria dd Gattung Salisharnavirus vier Arten Spezies Britarnavirus 1 Spezies Britarnavirus 4 Spezies Palmarnavirus 128 Spezies Palmarnavirus 473 dd Gattung Sogarnavirus sechs Arten Spezies Britarnavirus 2 Spezies Britarnavirus 3 Spezies Chaetarnavirus 2 Spezies Chaetenuissarnavirus II Spezies Jericarnavirus A Spezies Palmarnavirus 156 dd Einzelnachweise Bearbeiten a b c d e ICTV ICTV Master Species List 2019 v1 New MSL including all taxa updates since the 2018b release March 2020 MSL 35 Marnaviridae Positive Sense RNA Viruses Positive Sense RNA Viruses 2011 International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV In International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV Abgerufen am 27 April 2017 englisch Virus Taxonomy 2014 Release ICTV abgerufen am 15 Juni 2015 A S Lang A I Culley C A Suttle Genome sequence and characterization of a virus HaRNAV related to picorna like viruses that infects the marine toxic bloom forming alga Heterosigma akashiwo In Virology 320 Jahrgang Nr 2 2004 S 206 217 doi 10 1016 j virol 2003 10 015 PMID 15016544 M Vlok A S Lang C A Suttle Application of a sequence based taxonomic classification method to uncultured and unclassified marine single stranded RNA viruses in the order Picornavirales In Virus Evolution 31 5 2 vez056 Jahrgang 2019 doi 10 1093 ve vez056 PMID 31908848 Vera Tai Janice E Lawrence Andrew S Lang Amy M Chan Alexander I Culley Curtis A Suttle Characterization of HaRNAV a single stranded RNA virus causing lysis of Heterosigma akashiwo Raphidophyceae In Journal of Phycology 39 Jahrgang Nr 2 28 Marz 2003 S 206 217 doi 10 1046 j 1529 8817 2003 01162 x Janice E Lawrence Amy M Chan Curtis A Suttle A novel virus HaNIV causes lysis of the toxic bloom forming alga Heterosigma akashiwo Raphidophyceae In Journal of Phycology 37 Jahrgang Nr 2 1 Mai 2002 S 216 222 doi 10 1046 j 1529 8817 2001 037002216 x Y Bettarel J Kan K Wang Kurt E Williamson S Cooney S Ribblett F Chen K Wommack D Coats Isolation and preliminary characterisation of a small nuclear inclusion virus infecting the diatom Chaetoceros cf gracilis auf Semantic Scholar Biology Aquatic Microbial Ecology Corpus ID 56157535 2005 doi 10 3354 AME040103 Chaetoceros nuclear inclusion virus CspNIV CspNIV shows some strong similarities with Heterosigma akashiwo nuclear inclusion virus HaNIV Keizo Nagasaki Dinoflagellates diatoms and their viruses in The Journal of Microbiology 46 3 Juli 2008 S 235 243 doi 10 1007 s12275 008 0098 y CspNIV shows some strong similarities with Heterosigma akashiwo nuclear inclusion virus HaNIV Stephanie Boone Viruses and Algae Februar 2004 a b c d e Viral Zone ExPASy abgerufen am 15 Juni 2015 Anna Munke Kei Kimura Yuji Tomaru Kenta Okamoto Capsid Structure of a Marine Algal Virus of the Order In Journal of Virology 94 Jahrgang Nr 9 16 April 2020 doi 10 1128 JVI 01855 19 NCBI Marnavirus genus NCBI Heterosigma akashiwo RNA virus SOG263 UniProt UniProt Proteomes Heterosigma akashiwo RNA virus strain SOG263 Weblinks BearbeitenViralzone Marnaviridae ICTV NCBI Marnaviridae family ICTV Taxonomy History Marnaviridae Janice E Lawrence Corina P D Brussaard Curtis A Suttle Virus Specific Responses of Heterosigma akashiwo to Infection in Appl Environ Microbiol 72 12 Dezember 2006 S 7829 7834 PMC 1694243 freier Volltext PMID 17041155 doi 10 1128 AEM 01207 06 Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Marnaviridae amp oldid 225560022