NidoviralesCoronavirusSystematikKlassifikation VirenRealm Riboviria 2 Reich Orthornavirae 1 Phylum Pisuviricota 1 Klasse Pisoniviricetes 1 Ordnung NidoviralesTaxonomische MerkmaleGenom ssRNA linearBaltimore Gruppe 4Symmetrie ikosaedrisch oder helikalHulle vorhandenWissenschaftlicher NameNidoviralesLinksNCBI Taxonomy 76804ICTV Taxon History 201901821Die Ordnung Nidovirales umfasst vier Familien von Viren mit einem nicht segmentierten einzelstrangigen RNA Genom von positiver Polaritat Der Name leitet sich von lateinisch nidus Nest ab was auf die geschachtelten engl nested messenger RNAs der Nidovirales anspielt Die drei Familien der Nidovirales unterscheiden sich hinsichtlich der Struktur und Funktion der viralen Replikase RNA Polymerase von allen anderen RNA Viren Aufgrund von Strukturuntersuchungen dieser Replikasen sprach man zunachst von einer Coronavirus like superfamily 3 Dies ist der Grund einer sonst nicht vorgenommenen Zusammenfassung anderer Familien in eine Ordnung Die Vertreter der Nidovirales verursachen wichtige Infektionen bei Saugetieren besonders die Familie Coronaviridae Lediglich die Familie Roniviridae wird nur bei Krustentieren gefunden Inhaltsverzeichnis 1 Genom 2 Systematik 3 Literatur 4 Weblinks 5 BelegeGenom BearbeitenDie Nidovirales haben vergleichsweise grosse RNA Genome von 13 16 kb Arterivirus bis zu 28 31 kb Coronaviridae In dieser Unterfamilie befindet sich auch jenes Virus mit dem bislang grossten bekannten nicht segmentierten RNA Genom das Maus Hepatitisvirus MHV mit einer Grosse von 31 526 nt 4 Die genomische RNA der Nidovirales ist polyadenyliert und besitzt ausser bei der Gattung Okavirus eine Cap Struktur an ihrem 5 Ende Typisch ist die Strategie der Nidovirales bei der Transkription der viralen mRNAs Die verschiedenen Transkripte mindestens eines Leserahmens besitzen das gleiche polyA Ende jedoch verschiedene Startpunkte sie sind daher polycistronische nested mRNAs Systematik BearbeitenNach Vorgabe des ICTV mit Stand Marz 2020 gliedern sich die Nidovirales wie folgt 1 Ordnung NidoviralesUnterordnung AbnidovirineaeFamilie AbyssoviridaeUnterfamilie TiamatvirinaeGenus AlphaabyssovirusSubgenus Aplyccavirus dd dd dd dd Familie ArteriviridaeUnterfamilie CrocarterivirinaeGenus Muarterivirus dd dd dd Unterfamilie EquarterivirinaeGenus Alphaarterivirus fruher Spezies Alphaarterivirus equid alias Equartevirus mit Equine arteritis virus 5 6 dd dd dd Unterfamilie HeroarterivirinaeGenus Lambdaarterivirus mit Spezies Lambdaarterivirus afriporav inkl African pouched rat arterivirus 7 6 dd dd dd Unterfamilie Simarterivirinae fruhere Gattung Simartevirus 8 Genus DeltaarterivirusSubgenus Hedartevirus mit Spezies Deltaarterivirus hemfev inkl Simian hemorrhagic fever virus 9 6 Genus EpsilonarterivirusSubgenus SheartevirusSpezies Simian hemorragic fever virus alias Epsilonarterivirus hemcep SHEV dd Genus Etaarterivirus Genus IotaarterivirusSubgenus Debiartevirus mit Spezies Iotaarterivirus debrazmo inkl DeBrazza s monkey arterivirus 10 6 Subgenus Kigiartevirus Subgenus PedartevirusGenus ThetaarterivirusSubgenus Kaftartevirus Subgenus MitartevirusGenus Zetaarterivirus dd dd dd dd Unterfamilie VariarterivirinaeGenus BetaarterivirusSubgenus AmpobartevirusSpezies PRRS 2 Virus engl Betaarterivirus suid 2 Subgenus Chibartevirus Subgenus EurpobartevirusSpezies PRRS 1 Virus engl Betaarterivirus suid 1 dd Genus Gammaarterivirus mit Spezies Gammaarterivirus lacdeh mit Lactate dehydrogenase elevating virus 11 6 Genus Nuarterivirus dd dd dd dd Unterfamilie Zealarterivirinae fruhere Gattung Nesartevirus Genus Kappaarterivirus dd dd dd Unterfamilie nicht klassifiziertSpezies Porcine reproductive and respiratory syndrome virus PRRSV vorgeschlagen 12 6 Spezies Southwest baboon virus 1 vorgeschlagen 13 6 dd dd dd dd Aufgrund der Reorganisation dieser Familie gibt es die fruheren Gattungen Dipartevirus Nesartevirus Porartevirus und Simartevirus nicht mehr dd Familie CremegaviridaeUnterfamilie RodepovirinaeGenus Pontunivirus dd dd dd Familie GresnaviridaeUnterfamilie ReternivirinaeGenus Cyclophivirus dd dd dd Familie OlifoviridaeUnterfamilie GofosavirinaeGenus Kukrinivirus dd dd dd Unterordnung CornidovirineaeFamilie CoronaviridaeUnterfamilie LetovirinaeGenus AlphaletovirusSubgenus Milecovirus mit Spezies Microhyla letovirus 1 dd dd dd dd Unterfamilie OrthocoronavirinaeGenus AlphacoronavirusSubgenus Colacovirus Subgenus Decacovirus Subgenus Duvinacovirus mit Spezies Human coronavirus 229E Subgenus Luchacovirus Subgenus Minacovirus Subgenus Minunacovirus mit Spezies Bat coronavirus HKU8 Subgenus Myotacovirus Subgenus Nyctacovirus Subgenus Pedacovirus mit Spezies Feline infectious peritonitis virus Subgenus Rhinacovirus Subgenus Setracovirus mit Spezies Human coronavirus NL63 Subgenus Soracovirus Subgenus Sunacovirus Subgenus Tegacovirus mit Spezies Porcine epidemic diarrhea virus Genus BetacoronavirusSubgenus Embecovirus mit Spezies Human coronavirus HKU1 und Betacoronavirus 1 inkl Human coronavirus OC43 Subgenus Hibecovirus Subgenus Merbecovirus mit Spezies MERS Coronavirus Subgenus Nobecovirus Subgenus Sarbecovirus mit Spezies SARS Coronavirus inkl SARS CoV 2 Genus GammacoronavirusSubgenus Brangacovirus Subgenus Cegacovirus mit Spezies Beluga Whale coronavirus SW1 Subgenus Igacovirus mit Spezies Avian coronavirus alias Avian infectious bronchitis virus Genus DeltacoronavirusSubgenus Andecovirus mit Spezies Wigeon coronavirus HKU20 Subgenus Buldecovirus inkl fruherem Subgenus Moordecovirus mit Spezies Common moorhen coronavirus HKU21 und Sparrow coronavirus HKU17 vorgeschlagen 14 6 Subgenus Herdecovirus dd dd dd dd Unterordnung MesnidovirineaeFamilie MedioniviridaeUnterfamilie MedionivirinaeGenus TurrinivirusSubgenus Beturrivirus mit Spezies Turrinivirus 1 inkl Beihai Nido like virus 1 dd dd dd dd dd Unterfamilie TunicanivirinaeGenus BolenivirusSubgenus Balbicanovirus dd dd dd dd dd Familie MesoniviridaeUnterfamilie HexponivirinaeGenus AlphamesonivirusSubgenus Casualivirus Subgenus Enselivirus mit Spezies Alphamesonivirus 8 inkl Nse virus Subgenus Hanalivirus Subgenus Kadilivirus Subgenus Karsalivirus Subgenus Menolivirus mit Spezies Alphamesonivirus 9 inkl Meno virus Subgenus Namcalivirus mit Spezies Alphamesonivirus 1 inkl Nam Dinh virus Subgenus Ofalivirus dd dd dd dd Unterordnung MonidovirineaeFamilie MononiviridaeUnterfamilie MononivirinaeGenus AlphamononivirusSubgenus Dumedivirus dd dd dd dd Unterordnung NanidovirineaeFamilie NanghoshaviridaeUnterfamilie ChimanivirinaeGenus Chimshavirus dd dd dd Familie NanhypoviridaeUnterfamilie HyporhamsavirinaeGenus Sajorinivirus dd dd dd Unterordnung RonidovirineaeFamilie EuroniviridaeUnterfamilie CeronivirinaeGenus CharybnivirusSubgenus Cradenivirus mit Spezies Charybnivirus 1 inkl Beihai Nido like virus 2 15 6 Subgenus Wenilivirus mit Spezies Decronivirus 1 inkl Wenling nido like virus 1 16 6 ohne Gattugszuordnung Spezies Wenzhou Nido like virus 1 17 6 dd dd dd dd dd Unterfamilie CrustonivirinaeGenus PaguronivirusSubgenus Behecravirus mit Spezies Paguronivirus 1 inkl Beihai hermit crab virus 4 18 6 dd dd dd dd Familie Roniviridae 19 Unterfamilie OkanivirinaeGenus Okavirus 20 Subgenus Tipravirus mit Spezies Okavirus 1 Gill associated virus 21 22 und Yellow head virus 23 24 25 26 27 dd dd dd dd Unterordnung TornidovirineaeFamilie TobaniviridaeUnterfamilie PiscanivirinaeGenus Bafinivirus fruher zu Coronaviridae Torovirinae Subgenus Blicbavirus mit Spezies Guster Virus en White bream virus 6 Subgenus Pimfabavirus mit Spezies Goldelritzen Nidovirus en Fathead minnow nidovirus 1 Genus OncotshavirusSubgenus Salnivirus mit Spezies Konigslachs Bafinivirus en Chinook salmon nidovirus 1 dd dd dd dd Unterfamilie RemotovirinaeGenus BostovirusSubgenus Bosnitovirus dd dd dd dd Unterfamilie SerpentovirinaeGenus InfratovirusSubgenus Hepoptovirus Subgenus Xintolivirus mit Spezies Infratovirus 1 inkl Xinzhou toro like virus 28 6 Genus LyctovirusSubgenus RebatovirusGenus Pregotovirus inkl fruherem Genus Tiruvirus Subgenus Roypretovirus mit Spezies Ball python nidovirus 1 6 Subgenus Snaturtovirus Subgenus TilitovirusGenus SectovirusSubgenus Sanematovirus mit Spezies Sectovirus 1 inkl Xinzhou nematode virus 6 29 6 dd dd dd dd Unterfamilie Torovirinae fruher zu Fam Coronaviridae Genus TorovirusSubgenus Renitovirus mit Spezies Porcine torovirus 6 und Bovine torovirus inkl Breda virus 30 dd dd dd dd Unterordnung nicht klassifiziert ShiM 2016 Nido like viruses 31 Spezies Hubei tetragnatha maxillosa virus 7 32 6 33 34 Spezies Wuhan insect virus 19 35 6 33 34 Spezies Wuhan nido like virus 1 36 6 33 34 Spezies Fuefuki virus 37 33 34 dd dd dd dd Im folgenden Kladogramm nach Mang Shi et al 2016 wurden die Bezeichnungen gemass ICTV MSL 35 Stand Marz 2020 aktualisiert 6 1 Nidovirales Cornidovirineae Coronaviridae Orthocoronavirinae MERS CoV SARS CoV mit SARS CoV 2 Letovirinae ICTV Mesnidovirineae Mesoniviridae Hexponivirinae Medioniviridae Medionivirinae und Tunicanivirinae gem ICTV Ronidovirineae Roniviridae Okanivirinae Euroniviridae Crustonivirinae Ceronivirinae Tornidovirineae Tobaniviridae Serpentovirinae Piscanivirinae Torovirinae Arnidovirineae Arteriviridae Heroarterivirinae Equarterivirinae Variarterivirinae Simarterivirinae ShiM 2016 Nido like virus clade 6 33 34 Vorlage Klade Wartung StyleLiteratur BearbeitenA M Q King M J Adams E B Carstens E J Lefkowitz Hrsg Virus Taxonomy Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses Amsterdam 2012 ISBN 978 0 12 384684 6 S 785 795 C M Fauquet M A Mayo et al Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses London San Diego 2005 David M Knipe Peter M Howley et al Hrsg Fields Virology 4 Auflage Philadelphia 2001Weblinks BearbeitenNidovirales Familien Genera und Spezies NCBI Belege Bearbeiten a b c d e ICTV ICTV Taxonomy history Severe acute respiratory syndrome related coronavirus EC 51 Berlin Germany July 2019 Email ratification March 2020 MSL 35 ICTV Master Species List 2018b v1 MSL 34 Feb 2019 Snijder EJ Spaan WJM The coronavirus like superfamily In Sidell SG Hrsg The Coronaviridae Plenumpress New York 1995 Referenzsequenz des MHV Genoms NCBI Equine arteritis virus no rank a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v Mang Shi Xiabn Dan Lin Jun Huia Tian et al Redefining the invertebrate RNA virosphere in Nature 540 S 539 543 23 November 2016 doi 10 1038 nature20167 via ResearchGate Volltext Supplement PDF NCBI African pouched rat arterivirus no rank SIB Simartevirus auf ViralZone NCBI Simian hemorrhagic fever virus no rank NCBI DeBrazza s monkey arterivirus no rank NCBI Lactate dehydrogenase elevating virus no rank NCBI 1 species NCBI Southwest baboon virus 1 species NCBI Sparrow coronavirus HKU17 species NCBI Beihai Nido like virus 2 no rank NCBI Wenling nido like virus 1 no rank NCBI Wenzhou Nido like virus 1 species NCBI Beihai hermit crab virus 4 no rank SIB Roniviridae auf ViralZone SIB Okavirus auf ViralZone NCBI Gill associated virus species ICTV ICTV Taxonomy history Gill associated virus EC 51 Berlin Germany July 2019 Email ratification March 2020 MSL 35 ThermoFisher Gelbkopfvirus YHV in Tierkrankheiten Aquakultur Fisch A R Ochoa Meza et al Evaluation of a detection system of yellow head disease virus YHV using Q PCR in Archives of Biological Sciences 65 4 S 1629 1636 Januar 2013 doi 10 2298 ABS1304629O OIE CHAPTER 2 2 9 Infection With Yellow Head Virus Genotype 1 Infection with yellow head virus genotype 1 means infection with the pathogenic agent yellow head virus genotype 1 YHV1 of the Genus Okavirus and Family Roniviridae in Manual of Diagnostic Tests for Aquatic Animals 19 August 2019 Cesar B Nadala Jr et al Yellow head virus a rhabdovirus like pathogen of penaeid shrimp Memento vom 2 November 2019 im Internet Archive in Dis Aquat Org Band 31 S 141 146 20 November 1997 Y Lu et al Infection of the yellow head baculo like virus YBV in two species of penaeid shrimp Penaeus stylirostris Stimpson and Penaeus vannamei Boone in Journal of Fish Diseases November 1994 doi 10 1111 j 1365 2761 1994 tb00263 x taxonomische Zuordnung offenbar veraltet NCBI Xinzhou toro like virus no rank NCBI Xinzhou nematode virus 6 no rank NCBI Breda virus no rank NCBI unclassified RNA viruses ShiM 2016 nur Nido ahnliche Kandidaten NCBI Hubei tetragnatha maxillosa virus 7 species a b c d e Nathan C Medd et al The virome of Drosophila suzukii an invasive pest of soft fruit in Virus Evolution Band 4 Nr 1 Academic Press Januar 2018 vey009 doi 10 1093 ve vey009 PrePrint a b c d e Nathan C Medd The viruses and antiviral responses of an invasive fruit pest Drosophila suzukii The University of Edinburgh Institute of Evolutionary Biology 2018 NCBI Wuhan insect virus 19 species NCBI Wuhan nido like virus 1 species NCBI Fuefuki virus species Normdaten Sachbegriff GND 4638626 9 lobid OGND AKS LCCN sh2007005762 Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Nidovirales amp oldid 223420641
