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SYPRO Ruby ist ein Fluoreszenzfarbstoff vom Ruthenium Chelatkomplex Typ 1 der zur Färbung von Proteinen im Zuge einer Pr

SYPRO Ruby

SYPRO Ruby ist ein Fluoreszenzfarbstoff vom Ruthenium-Chelatkomplex-Typ, der zur Färbung von Proteinen im Zuge einer Proteincharakterisierung verwendet wird, meistens in einem Western Blot, in 2D-Gelen oder IEF-Gelen.

Struktur von SYPRO Ruby, soweit bekannt.

Eigenschaften Bearbeiten

SYPRO Ruby bindet selektiv an basische Aminosäuren von Proteinen (auch Glykoproteine) in SDS-Micellen, nicht jedoch an DNA. Die Mutagenität, Reproduktionstoxizität und Karzinogenität von SYPRO Ruby ist unbekannt. Die Absorptionsmaxima liegen bei λ = 280 nm und 450 nm, die Emission ist bei λ = 610 nm maximal. Die Sensitivität bei SDS-PA-Gelen liegt mit SYPRO Ruby bei etwa 1 ng Protein, also etwa vergleichbar mit der Silberfärbung. Aufgrund der Fluoreszenz besitzt die SYPRO Ruby-Färbung bei einer Mengenabschätzung im Vergleich zur Silberfärbung oder Coomassie einen größeren linearen dynamischen Bereich, d. h. eine bessere Korrelation zwischen der Proteinmenge und der Signalintensität. Die SYPRO Ruby-Färbung besitzt eine vergleichsweise längere Färbezeit von vier Stunden.

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ Aleksandr Petrovich Demchenko: Advanced Fluorescence Reporters in Chemistry and Biology III: Applications in Sensing and Imaging Band 3 von Advanced Fluorescence Reporters in Chemistry and Biology. Springer 2011. ISBN 9783642180354. S. 181ff.
  2. ↑ Datenblatt SYPRO Ruby Protein Gel Stain bei Sigma-Aldrich, abgerufen am 28. November 2013 (PDF).
  3. K. Berggren, T. H. Steinberg, W. M. Lauber, J. A. Carroll, M. F. Lopez, E. Chernokalskaya, L. Zieske, Z. Diwu, R. P. Haugland, W. F. Patton: A luminescent ruthenium complex for ultrasensitive detection of proteins immobilized on membrane supports. In: Analytical biochemistry. Band 276, Nummer 2, Dezember 1999, S. 129–143, ISSN 0003-2697. doi:10.1006/abio.1999.4364. PMID 10603235.
  4. S. Gallagher, D. Chakavarti: Staining proteins in gels. In: Journal of visualized experiments : JoVE. Nummer 17, 2008, S. , ISSN 1940-087X. doi:10.3791/760. PMID 19066521. PMC 3253607 (freier Volltext).
  5. T. Rabilloud, J. M. Strub, S. Luche, A. van Dorsselaer, J. Lunardi: A comparison between Sypro Ruby and ruthenium II tris (bathophenanthroline disulfonate) as fluorescent stains for protein detection in gels. In: Proteomics. Band 1, Nummer 5, Mai 2001, S. 699–704, ISSN 1615-9853. doi:10.1002/1615-9861(200104)1:5<699::AID-PROT699>3.0.CO;2-C. PMID 11678039.
  6. A. Lamanda, A. Zahn, D. Röder, H. Langen: Improved Ruthenium II tris (bathophenantroline disulfonate) staining and destaining protocol for a better signal-to-background ratio and improved baseline resolution. In: Proteomics. Band 4, Nummer 3, März 2004, S. 599–608, ISSN 1615-9853. doi:10.1002/pmic.200300587. PMID 14997483.
  7. M. F. Lopez, K. Berggren, E. Chernokalskaya, A. Lazarev, M. Robinson, W. F. Patton: A comparison of silver stain and SYPRO Ruby Protein Gel Stain with respect to protein detection in two-dimensional gels and identification by peptide mass profiling. In: Electrophoresis. Band 21, Nummer 17, November 2000, S. 3673–3683, ISSN 0173-0835. doi:10.1002/1522-2683(200011)21:17<3673::AID-ELPS3673>3.0.CO;2-M. PMID 11271486.
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Veröffentlichungsdatum:
SYPRO Ruby ist ein Fluoreszenzfarbstoff vom Ruthenium Chelatkomplex Typ 1 der zur Farbung von Proteinen im Zuge einer Proteincharakterisierung verwendet wird meistens in einem Western Blot in 2D Gelen oder IEF Gelen 2 3 4 Struktur von SYPRO Ruby soweit bekannt 1 Eigenschaften BearbeitenSYPRO Ruby bindet selektiv an basische Aminosauren 1 von Proteinen auch Glykoproteine in SDS Micellen 1 nicht jedoch an DNA 2 5 Die Mutagenitat Reproduktionstoxizitat und Karzinogenitat von SYPRO Ruby ist unbekannt 2 Die Absorptionsmaxima liegen bei l 280 nm und 450 nm die Emission ist bei l 610 nm maximal 2 Die Sensitivitat bei SDS PA Gelen liegt mit SYPRO Ruby bei etwa 1 ng Protein 2 also etwa vergleichbar mit der Silberfarbung 6 Aufgrund der Fluoreszenz besitzt die SYPRO Ruby Farbung bei einer Mengenabschatzung im Vergleich zur Silberfarbung oder Coomassie einen grosseren linearen dynamischen Bereich d h eine bessere Korrelation zwischen der Proteinmenge und der Signalintensitat 2 7 Die SYPRO Ruby Farbung besitzt eine vergleichsweise langere Farbezeit von vier Stunden Einzelnachweise Bearbeiten a b c d Aleksandr Petrovich Demchenko Advanced Fluorescence Reporters in Chemistry and Biology III Applications in Sensing and Imaging Band 3 von Advanced Fluorescence Reporters in Chemistry and Biology Springer 2011 ISBN 9783642180354 S 181ff a b c d e f Datenblatt SYPRO Ruby Protein Gel Stain bei Sigma Aldrich abgerufen am 28 November 2013 PDF K Berggren T H Steinberg W M Lauber J A Carroll M F Lopez E Chernokalskaya L Zieske Z Diwu R P Haugland W F Patton A luminescent ruthenium complex for ultrasensitive detection of proteins immobilized on membrane supports In Analytical biochemistry Band 276 Nummer 2 Dezember 1999 S 129 143 ISSN 0003 2697 doi 10 1006 abio 1999 4364 PMID 10603235 S Gallagher D Chakavarti Staining proteins in gels In Journal of visualized experiments JoVE Nummer 17 2008 S ISSN 1940 087X doi 10 3791 760 PMID 19066521 PMC 3253607 freier Volltext T Rabilloud J M Strub S Luche A van Dorsselaer J Lunardi A comparison between Sypro Ruby and ruthenium II tris bathophenanthroline disulfonate as fluorescent stains for protein detection in gels In Proteomics Band 1 Nummer 5 Mai 2001 S 699 704 ISSN 1615 9853 doi 10 1002 1615 9861 200104 1 5 lt 699 AID PROT699 gt 3 0 CO 2 C PMID 11678039 A Lamanda A Zahn D Roder H Langen Improved Ruthenium II tris bathophenantroline disulfonate staining and destaining protocol for a better signal to background ratio and improved baseline resolution In Proteomics Band 4 Nummer 3 Marz 2004 S 599 608 ISSN 1615 9853 doi 10 1002 pmic 200300587 PMID 14997483 M F Lopez K Berggren E Chernokalskaya A Lazarev M Robinson W F Patton A comparison of silver stain and SYPRO Ruby Protein Gel Stain with respect to protein detection in two dimensional gels and identification by peptide mass profiling In Electrophoresis Band 21 Nummer 17 November 2000 S 3673 3683 ISSN 0173 0835 doi 10 1002 1522 2683 200011 21 17 lt 3673 AID ELPS3673 gt 3 0 CO 2 M PMID 11271486 Abgerufen von https de wikipedia org w index php title SYPRO Ruby amp oldid 212426844