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Komigrationsstandard Als oder Comigrationsstandard umgangssprachlich auch Größenmarker Größenleiter bezeichnet man in de

Komigrationsstandard

Als Komigrationsstandard oder Comigrationsstandard (umgangssprachlich auch Größenmarker, Größenleiter) bezeichnet man in der Biochemie und Molekularbiologie eine Probe bekannter Zusammensetzung, die in gelelektrophoretischen oder gelpermeationschromatographischen Auftrennungsverfahren eingesetzt wird, um einen Größenvergleich der Moleküle in Proben unbekannter Zusammensetzung zu ermöglichen. Dabei wird die Migration der enthaltenen Substanzen, beispielsweise Proteine oder DNA, in der Probe bekannter Zusammensetzung (Protein- oder DNA-Leiter) mit der Migration der Probe unbekannter Zusammensetzung verglichen. Eine gleiche Migrationsweite im Gel deutet dabei auf gleiche elektrophoretische Laufeigenschaften hin. Die gleichen Laufeigenschaften können mit Gelelektrophoresen, die einen direkten Zusammenhang zwischen der elektrophoretischen Mobilität und der molaren Masse aufweisen (z. B. Proteine per SDS-PAGE, DNA und RNA per Agarose-Gelelektrophorese), zur Bestimmung der Molmasse der in der Probe enthaltenen Moleküle verwendet werden.

DNA-Banden unter UV-Licht: Links ist der Komigrationsstandard aufgetragen, der als „Leiter“ erscheint

DNA-Marker Bearbeiten

DNA-Marker werden in der Agarose-Gelelektrophorese und der Polyacrylamid-Gelelektrophorese verwendet. Einer der früheren DNA-Marker war die DNA des Bakteriophagen λ, die mit dem Restriktionsenzym Hind III geschnitten wurde. Ein weiterer DNA-Marker war die mit HaeIII geschnittene DNA aus dem Bakteriophagen X174. Dabei waren die Größen der Fragmente in unregelmäßigen Abständen zueinander. Durch Ligation von Fragmenten von 100 Basenpaaren Länge kann eine DNA-Leiter mit ebendiesen Abständen erzeugt werden. Es wurden auch längere DNA-Sequenzen mit regelmäßigen Restriktionsschnittstellen per Polymerasekettenreaktion (PCR) erzeugt und anschließend mit der Restriktionsendonuklease SmaI teilweise geschnitten. Weiterhin wurden ausschließlich PCR-basierte Methoden zur Erzeugung von DNA-Leitern entwickelt.

Proteinmarker Bearbeiten

Proteinmarker in der linken Spur. Dicke Banden von oben nach unten: 66, 45, 35, 24, 18 und 9 kDa. In den übrigen Spuren sind gereinigte Hefeproteine aufgetrennt.

Typische Proteine in Proteinmarkern

Literatur Bearbeiten

  • Friedrich Lottspeich, Joachim W. Engels (Hrsg.): Bioanalytik. 2. Aufl., Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2006, ISBN 978-3827415202.
  • Hubert Rehm, Thomas Letzel: Der Experimentator: Proteinbiochemie / Proteomics. 6. Auflage, Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2009. ISBN 978-3-8274-2312-2.
  • Cornel Mülhardt: Der Experimentator: Molekularbiologie/Genomics. Sechste Auflage. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2008. ISBN 3-8274-2036-9.

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. Vo Thi Thuong Lan, Pham Thi Thanh Loan, Pham Anh Thuy Duong, Le Thi Thanh, Ngo Thi Ha, Ta Bich Thuan: Straightforward Procedure for Laboratory Production of DNA Ladder. In: Journal of Nucleic Acids. 2012, 2012, S. 1, doi:10.1155/2012/254630.
  2. MohammadReza Mofid, Mahdi Abbasian, Hadieh AlsadatEslampanah Seyedi, ZahraKhalili Boroujeni: Easy method for production of a home-made DNA ladder in every laboratory. In: Advanced Biomedical Research. 4, 2015, S. 70, doi:10.4103/2277-9175.153894. PMID 25878995.
  3. Saied Mostaan, Mehdi Ajorloo, Hossein Khanahmad, RezaAhangari Cohan, ZahraRikhtegaran Tehrani, Maryam Rezaei, Fateme Fazeli, Mehdi Behdani, SakinehKarimi Zare, Zeinab Karimi, Seyed Mozhgani, Rasul Moukhah: A novel combined method for cost-benefit production of DNA ladders. In: Advanced Biomedical Research. 4, 2015, S. 15, doi:10.4103/2277-9175.148298. PMID 25625121.
  4. T.-Y. Wang, L. Wang, F. Wang: Methodology Simplified preparation of a DNA ladder using PCR. In: Genetics and Molecular Research. 10, 2011, S. 1631, doi:10.4238/vol10-3gmr1177.
  5. Prestained Protein Molecular Weight Marker. (PDF; 216 kB) In: fishersci.com. Thermo Fisher Scientific, 2019, abgerufen am 12. November 2013 (englisch).
  6. ↑ @1@2Vorlage:Toter Link/view.officeapps.live.com (Seite nicht mehr abrufbar. Suche in Webarchiven.)
  7. Protein Molecular Weight Markers. In: Help Biotech. 2011, abgerufen am 12. November 2013 (englisch).
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Veröffentlichungsdatum:
Als Komigrationsstandard oder Comigrationsstandard umgangssprachlich auch Grossenmarker Grossenleiter bezeichnet man in der Biochemie und Molekularbiologie eine Probe bekannter Zusammensetzung die in gelelektrophoretischen oder gelpermeationschromatographischen Auftrennungsverfahren eingesetzt wird um einen Grossenvergleich der Molekule in Proben unbekannter Zusammensetzung zu ermoglichen Dabei wird die Migration der enthaltenen Substanzen beispielsweise Proteine oder DNA in der Probe bekannter Zusammensetzung Protein oder DNA Leiter mit der Migration der Probe unbekannter Zusammensetzung verglichen Eine gleiche Migrationsweite im Gel deutet dabei auf gleiche elektrophoretische Laufeigenschaften hin Die gleichen Laufeigenschaften konnen mit Gelelektrophoresen die einen direkten Zusammenhang zwischen der elektrophoretischen Mobilitat und der molaren Masse aufweisen z B Proteine per SDS PAGE DNA und RNA per Agarose Gelelektrophorese zur Bestimmung der Molmasse der in der Probe enthaltenen Molekule verwendet werden DNA Banden unter UV Licht Links ist der Komigrationsstandard aufgetragen der als Leiter erscheint Inhaltsverzeichnis 1 DNA Marker 2 Proteinmarker 3 Literatur 4 EinzelnachweiseDNA Marker Bearbeiten Hauptartikel DNA Leiter DNA Marker werden in der Agarose Gelelektrophorese und der Polyacrylamid Gelelektrophorese verwendet Einer der fruheren DNA Marker war die DNA des Bakteriophagen l die mit dem Restriktionsenzym Hind III geschnitten wurde Ein weiterer DNA Marker war die mit HaeIII geschnittene DNA aus dem Bakteriophagen X174 Dabei waren die Grossen der Fragmente in unregelmassigen Abstanden zueinander Durch Ligation von Fragmenten von 100 Basenpaaren Lange kann eine DNA Leiter mit ebendiesen Abstanden erzeugt werden Es wurden auch langere DNA Sequenzen mit regelmassigen Restriktionsschnittstellen per Polymerasekettenreaktion PCR erzeugt und anschliessend mit der Restriktionsendonuklease SmaI teilweise geschnitten 1 Weiterhin wurden ausschliesslich PCR basierte Methoden zur Erzeugung von DNA Leitern entwickelt 2 3 4 Proteinmarker Bearbeiten nbsp Proteinmarker in der linken Spur Dicke Banden von oben nach unten 66 45 35 24 18 und 9 kDa In den ubrigen Spuren sind gereinigte Hefeproteine aufgetrennt Hauptartikel Molmassenbestimmung im Artikel SDS PAGE Typische Proteine in Proteinmarkern Protein Molmasse in einer SDS PAGE kDa Beta Galactosidase 120 5 Phosphorylase B 94Bovines Serumalbumin BSA 67 6 Ovalbumin 42 8Truthahn Albumin 40 6 Carboanhydrase 30 6 Soja Trypsininhibitor 20 1 6 a Lactalbumin 14 4 6 Lysozym 14 7 Literatur BearbeitenFriedrich Lottspeich Joachim W Engels Hrsg Bioanalytik 2 Aufl Spektrum Akademischer Verlag Heidelberg 2006 ISBN 978 3827415202 Hubert Rehm Thomas Letzel Der Experimentator Proteinbiochemie Proteomics 6 Auflage Spektrum Akademischer Verlag Heidelberg 2009 ISBN 978 3 8274 2312 2 Cornel Mulhardt Der Experimentator Molekularbiologie Genomics Sechste Auflage Spektrum Akademischer Verlag Heidelberg 2008 ISBN 3 8274 2036 9 Einzelnachweise Bearbeiten Vo Thi Thuong Lan Pham Thi Thanh Loan Pham Anh Thuy Duong Le Thi Thanh Ngo Thi Ha Ta Bich Thuan Straightforward Procedure for Laboratory Production of DNA Ladder In Journal of Nucleic Acids 2012 2012 S 1 doi 10 1155 2012 254630 MohammadReza Mofid Mahdi Abbasian Hadieh AlsadatEslampanah Seyedi ZahraKhalili Boroujeni Easy method for production of a home made DNA ladder in every laboratory In Advanced Biomedical Research 4 2015 S 70 doi 10 4103 2277 9175 153894 PMID 25878995 Saied Mostaan Mehdi Ajorloo Hossein Khanahmad RezaAhangari Cohan ZahraRikhtegaran Tehrani Maryam Rezaei Fateme Fazeli Mehdi Behdani SakinehKarimi Zare Zeinab Karimi Seyed Mozhgani Rasul Moukhah A novel combined method for cost benefit production of DNA ladders In Advanced Biomedical Research 4 2015 S 15 doi 10 4103 2277 9175 148298 PMID 25625121 T Y Wang L Wang F Wang Methodology Simplified preparation of a DNA ladder using PCR In Genetics and Molecular Research 10 2011 S 1631 doi 10 4238 vol10 3gmr1177 Prestained Protein Molecular Weight Marker PDF 216 kB In fishersci com Thermo Fisher Scientific 2019 abgerufen am 12 November 2013 englisch a b c d e 1 2 Vorlage Toter Link view officeapps live com Seite nicht mehr abrufbar Suche in Webarchiven Protein Molecular Weight Markers In Help Biotech 2011 abgerufen am 12 November 2013 englisch Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Komigrationsstandard amp oldid 229378973