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Erich Bornberg Bauer 1963 in Wien ist ein österreichischer Biochemiker Theoretischer Biologe und Bioinformatiker Inhalts

Erich Bornberg-Bauer

Erich Bornberg-Bauer (* 1963 in Wien) ist ein österreichischer Biochemiker, Theoretischer Biologe und Bioinformatiker.

Leben Bearbeiten

Bornberg-Bauer wurde nach Studien der Biochemie, Physik und Mathematik 1995 am Institut für Theoretische Chemie der Universität Wien bei Peter Schuster zum Thema Vergleich der evolutionären Fitnesslandschaften von RNA und Proteinen promoviert. Nach einer kurzen Zeit als Universitätsassistent am Institut für Mathematik der Universität Wien arbeitete er bis 1998 als Post-Doktorand bei Martin Vingron am Deutschen Krebsforschungszentrum in Heidelberg an Algorithmen zur Sequenzanalyse und bis 2000 als Projektleiter am EML (heute Teil des Heidelberger Institut für Theoretische Studien) bevor er an die University of Manchester als Senior Lecturer in Bioinformatics wechselte. Seit 2003 ist er Professor für Molekulare Evolution und Bioinformatik am Institut für Evolution und Biodiversität der Universität Münster. Seit 2018 ist er Guest Scientist am Max-Planck-Institut für Biologie Tübingen.

Forschung Bearbeiten

Bornberg-Bauer beschäftigte sich mit Aspekte von RNA- und Proteinevolution, vor allem mit Fragen der neutralen Evolution sowie der Evolvierbarkeit und Robustheit gegen Mutationen. Hier entwickelte er mit Hue Sun Chan (Toronto) das Konzept des Superfunnels auf neutralen Netzen, welches postuliert, wie molekulare Populationen mittels Gendrift den Sequenzraum explorieren, um Übergangssequenzen (Switches) zu neuen Netzwerken zu finden. Er leitete auch die Ausarbeitung des Konzeptes eines look ahead-Effektes, das postuliert, dass phenotypische Mutationen helfen, den Sequenzraum rascher zu durchwandern und somit die Wahrscheinlichkeit für sonst extrem unwahrscheinliche nützliche Doppelmutationen (Epistasis) drastisch erhöhen. Seit 2005 beschäftigt er sich auch mit Fragen der modularen Evolution von Proteinen und seit auch 2010 mit der Frage, ob und wie aus nicht-kodierenden DNA-Abschnitten völlig neue de novo Protein-kodierende Gene entstehen können. Viele dieser Ansätze konnten in mehreren Genomanalysen, vor allem an sozialen Insekten erfolgreich Anwendung finden.

Seine Arbeiten sind vorwiegend computativ, aber seit einiger Zeit auch mit Experimenten zur gerichteten Evolution von promisken (multifunktionalen) Enzymen und der Analyse von De novo-Proteinen gekoppelt. Bornberg-Bauers Arbeiten wurden unter anderem von der Deutschen Forschungsgemeinschaft, der Volkswagenstiftung, der Europäischen Kommission und 2006, 2013, 2018 und 2023 mit Forschungsgeldern des Human Frontier Science Program gefördert. Seit 2021 leitet Bornberg-Bauer das Schwerpunktprogramm „Die genomischen Grundlagen evolutionärer Innovationen (GEvol)“ der Deutschen Forschungsgemeinschaft.

Weblinks Bearbeiten

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ Westfälische Wilhelms-Universität Münster: Homepage Bornberg-Bauer. In: uni-muenster.de. Abgerufen am 10. Juli 2018.
  2. MPI for Biology Tübingen, Department Protein Evolution. 28. Februar 2022;.
  3. E. Bornberg-Bauer, H. S. Chan: Modeling evolutionary landscapes: Mutational stability, topology, and superfunnels in sequence space. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. Band 96, Nr. 19, 14. September 1999, S. 10689, doi:10.1073/pnas.96.19.10689.
  4. Y. Cui, W. H. Wong, E. Bornberg-Bauer, H. S. Chan: Recombinatoric exploration of novel folded structures: A heteropolymer-based model of protein evolutionary landscapes. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. Band 99, Nr. 2, 22. Januar 2002, S. 809, doi:10.1073/pnas.022240299.
  5. Dion J Whitehead, Claus O Wilke, David Vernazobres, Erich Bornberg-Bauer: The look-ahead effect of phenotypic mutations. In: Biology Direct. Band 3, Nr. 1, 2008, S. 18, doi:10.1186/1745-6150-3-18.
  6. Erich Bornberg-Bauer, M Mar Albà: Dynamics and adaptive benefits of modular protein evolution. In: Current Opinion in Structural Biology. Band 23, Nr. 3, Juni 2013, S. 459, doi:10.1016/j.sbi.2013.02.012.
  7. Andrew D. Moore, Åsa K. Björklund, Diana Ekman, Erich Bornberg-Bauer, Arne Elofsson: Arrangements in the modular evolution of proteins. In: Trends in Biochemical Sciences. Band 33, Nr. 9, September 2008, S. 444, doi:10.1016/j.tibs.2008.05.008.
  8. Erich Bornberg-Bauer, Jonathan Schmitz, Magdalena Heberlein: Emergence of proteins from ‘dark genomic matter’ by ‘grow slow and moult’. In: Biochemical Society Transactions. Band 43, Nr. 5, 9. Oktober 2015, S. 867, doi:10.1042/BST20150089.
  9. Emily L. Rivard, Andrew G. Ludwig, Prajal H. Patel, Anna Grandchamp, Sarah E. Arnold, Alina Berger, Emilie M. Scott, Brendan J. Kelly, Grace C. Mascha, Erich Bornberg-Bauer, Geoffrey D. Findlay: A putative de novo evolved gene required for spermatid chromatin condensation in Drosophila melanogaster. In: PLOS Genetics. Band 17, Nr. 9, 3. September 2021, S. e1009787, doi:10.1371/journal.pgen.1009787.
  10. Lothar Wissler, Jürgen Gadau, Daniel F. Simola, Martin Helmkampf, Erich Bornberg-Bauer: Mechanisms and Dynamics of Orphan Gene Emergence in Insect Genomes. In: Genome Biology and Evolution 5, 2013, S. 439–455, doi:10.1093/gbe/evt009.
  11. Tristan Bitard-Feildel, Magdalena Heberlein, Erich Bornberg-Bauer, Isabelle Callebaut: Detection of orphan domains in Drosophila using “hydrophobic cluster analysis”. In: Biochimie. Band 119, Dezember 2015, S. 244, doi:10.1016/j.biochi.2015.02.019.
  12. Steffen Klasberg, Tristan Bitard‐Feildel, Isabelle Callebaut, Erich Bornberg‐Bauer: Origins and structural properties of novel and protein domains during insect evolution. In: The FEBS Journal. Band 285, Nr. 14, Juli 2018, S. 2605, doi:10.1111/febs.14504.
  13. Erich Bornberg-Bauer, Klara Hlouchova, Andreas Lange: Structure and function of naturally evolved de novo proteins. In: Current Opinion in Structural Biology 68, 2021, S. 175–183, doi:10.1016/j.sbi.2020.11.010.
  14. Andreas Lange, Prajal H. Patel, Brennen Heames, Adam M. Damry, Thorsten Saenger, Colin J. Jackson, Geoffrey D. Findlay, Erich Bornberg-Bauer: Structural and functional characterization of a putative de novo gene in Drosophila. In: Nature Communications. Band 12, Nr. 1, Dezember 2021, doi:10.1038/s41467-021-21667-6.
  15. HFSPO is pleased to announce the 2023 research grants and postdoctoral fellowships approved by the Board of Trustees in March 2023. Abgerufen am 6. April 2023 (englisch).
  16. DFG SPP Genomic Basis of Evolutionary Innovations. 28. Februar 2022;.
Personendaten
NAME Bornberg-Bauer, Erich
KURZBESCHREIBUNG österreichischer Biochemiker, Theoretischer Biologe und Bioinformatiker
GEBURTSDATUM 1963
GEBURTSORT Wien
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Veröffentlichungsdatum:
Erich Bornberg Bauer 1963 in Wien ist ein osterreichischer Biochemiker Theoretischer Biologe und Bioinformatiker Inhaltsverzeichnis 1 Leben 2 Forschung 3 Weblinks 4 EinzelnachweiseLeben BearbeitenBornberg Bauer wurde nach Studien der Biochemie Physik und Mathematik 1995 am Institut fur Theoretische Chemie der Universitat Wien bei Peter Schuster zum Thema Vergleich der evolutionaren Fitnesslandschaften von RNA und Proteinen promoviert 1 Nach einer kurzen Zeit als Universitatsassistent am Institut fur Mathematik der Universitat Wien arbeitete er bis 1998 als Post Doktorand bei Martin Vingron am Deutschen Krebsforschungszentrum in Heidelberg an Algorithmen zur Sequenzanalyse und bis 2000 als Projektleiter am EML heute Teil des Heidelberger Institut fur Theoretische Studien bevor er an die University of Manchester als Senior Lecturer in Bioinformatics wechselte Seit 2003 ist er Professor fur Molekulare Evolution und Bioinformatik am Institut fur Evolution und Biodiversitat der Universitat Munster 1 Seit 2018 ist er Guest Scientist am Max Planck Institut fur Biologie Tubingen 2 Forschung BearbeitenBornberg Bauer beschaftigte sich mit Aspekte von RNA und Proteinevolution vor allem mit Fragen der neutralen Evolution sowie der Evolvierbarkeit und Robustheit gegen Mutationen Hier entwickelte er mit Hue Sun Chan Toronto das Konzept des Superfunnels auf neutralen Netzen welches postuliert wie molekulare Populationen mittels Gendrift den Sequenzraum explorieren um Ubergangssequenzen Switches zu neuen Netzwerken zu finden 3 4 Er leitete auch die Ausarbeitung des Konzeptes eines look ahead Effektes das postuliert dass phenotypische Mutationen helfen den Sequenzraum rascher zu durchwandern und somit die Wahrscheinlichkeit fur sonst extrem unwahrscheinliche nutzliche Doppelmutationen Epistasis drastisch erhohen 5 Seit 2005 beschaftigt er sich auch mit Fragen der modularen Evolution von Proteinen 1 6 7 und seit auch 2010 mit der Frage ob und wie aus nicht kodierenden DNA Abschnitten vollig neue de novo Protein kodierende Gene entstehen konnen 8 9 Viele dieser Ansatze konnten in mehreren Genomanalysen vor allem an sozialen Insekten erfolgreich Anwendung finden 10 11 12 Seine Arbeiten sind vorwiegend computativ aber seit einiger Zeit auch mit Experimenten zur gerichteten Evolution von promisken multifunktionalen Enzymen und der Analyse von De novo Proteinen gekoppelt 13 14 Bornberg Bauers Arbeiten wurden unter anderem von der Deutschen Forschungsgemeinschaft der Volkswagenstiftung der Europaischen Kommission und 2006 2013 2018 und 2023 mit Forschungsgeldern des Human Frontier Science Program gefordert 15 Seit 2021 leitet Bornberg Bauer das Schwerpunktprogramm Die genomischen Grundlagen evolutionarer Innovationen GEvol der Deutschen Forschungsgemeinschaft 16 Weblinks BearbeitenWebsite von Erich Bornberg Bauer Google Scholar Profil OrcidEinzelnachweise Bearbeiten a b c Westfalische Wilhelms Universitat Munster Homepage Bornberg Bauer In uni muenster de Abgerufen am 10 Juli 2018 MPI for Biology Tubingen Department Protein Evolution 28 Februar 2022 abgerufen im 1 Januar 1 E Bornberg Bauer H S Chan Modeling evolutionary landscapes Mutational stability topology and superfunnels in sequence space In Proceedings of the National Academy of Sciences Band 96 Nr 19 14 September 1999 S 10689 doi 10 1073 pnas 96 19 10689 Y Cui W H Wong E Bornberg Bauer H S Chan Recombinatoric exploration of novel folded structures A heteropolymer based model of protein evolutionary landscapes In Proceedings of the National Academy of Sciences Band 99 Nr 2 22 Januar 2002 S 809 doi 10 1073 pnas 022240299 Dion J Whitehead Claus O Wilke David Vernazobres Erich Bornberg Bauer The look ahead effect of phenotypic mutations In Biology Direct Band 3 Nr 1 2008 S 18 doi 10 1186 1745 6150 3 18 Erich Bornberg Bauer M Mar Alba Dynamics and adaptive benefits of modular protein evolution In Current Opinion in Structural Biology Band 23 Nr 3 Juni 2013 S 459 doi 10 1016 j sbi 2013 02 012 Andrew D Moore Asa K Bjorklund Diana Ekman Erich Bornberg Bauer Arne Elofsson Arrangements in the modular evolution of proteins In Trends in Biochemical Sciences Band 33 Nr 9 September 2008 S 444 doi 10 1016 j tibs 2008 05 008 Erich Bornberg Bauer Jonathan Schmitz Magdalena Heberlein Emergence of proteins from dark genomic matter by grow slow and moult In Biochemical Society Transactions Band 43 Nr 5 9 Oktober 2015 S 867 doi 10 1042 BST20150089 Emily L Rivard Andrew G Ludwig Prajal H Patel Anna Grandchamp Sarah E Arnold Alina Berger Emilie M Scott Brendan J Kelly Grace C Mascha Erich Bornberg Bauer Geoffrey D Findlay A putative de novo evolved gene required for spermatid chromatin condensation in Drosophila melanogaster In PLOS Genetics Band 17 Nr 9 3 September 2021 S e1009787 doi 10 1371 journal pgen 1009787 Lothar Wissler Jurgen Gadau Daniel F Simola Martin Helmkampf Erich Bornberg Bauer Mechanisms and Dynamics of Orphan Gene Emergence in Insect Genomes In Genome Biology and Evolution 5 2013 S 439 455 doi 10 1093 gbe evt009 Tristan Bitard Feildel Magdalena Heberlein Erich Bornberg Bauer Isabelle Callebaut Detection of orphan domains in Drosophila using hydrophobic cluster analysis In Biochimie Band 119 Dezember 2015 S 244 doi 10 1016 j biochi 2015 02 019 Steffen Klasberg Tristan Bitard Feildel Isabelle Callebaut Erich Bornberg Bauer Origins and structural properties of novel and protein domains during insect evolution In The FEBS Journal Band 285 Nr 14 Juli 2018 S 2605 doi 10 1111 febs 14504 Erich Bornberg Bauer Klara Hlouchova Andreas Lange Structure and function of naturally evolved de novo proteins In Current Opinion in Structural Biology 68 2021 S 175 183 doi 10 1016 j sbi 2020 11 010 Andreas Lange Prajal H Patel Brennen Heames Adam M Damry Thorsten Saenger Colin J Jackson Geoffrey D Findlay Erich Bornberg Bauer Structural and functional characterization of a putative de novo gene in Drosophila In Nature Communications Band 12 Nr 1 Dezember 2021 doi 10 1038 s41467 021 21667 6 HFSPO is pleased to announce the 2023 research grants and postdoctoral fellowships approved by the Board of Trustees in March 2023 Abgerufen am 6 April 2023 englisch DFG SPP Genomic Basis of Evolutionary Innovations 28 Februar 2022 abgerufen im 1 Januar 1 Normdaten Person GND 1243599340 lobid OGND AKS LCCN no2002054089 VIAF 9513091 Wikipedia Personensuche PersonendatenNAME Bornberg Bauer ErichKURZBESCHREIBUNG osterreichischer Biochemiker Theoretischer Biologe und BioinformatikerGEBURTSDATUM 1963GEBURTSORT Wien Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Erich Bornberg Bauer amp oldid 236166801