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DNA Klammer Eine englisch DNA clamp sliding clamp ist eine Proteinstruktur in manchen DNA bindenden Proteinen die einer

DNA-Klammer

Eine DNA-Klammer (englisch DNA clamp, sliding clamp) ist eine Proteinstruktur in manchen DNA-bindenden Proteinen, die einer Bindung eines DNA-modifizierenden Enzyms an die DNA während der DNA-Replikation dient. Die DNA-Klammer besteht aus mehreren Proteinen mit ungefähr keilförmigen Aufbau mit Proteindomänen zur sequenzunabhängigen DNA-Bindung und zur Multimerisierung, sodass sich die typische Ringform ergibt.

DNA-Klammer des PCNA frontal
DNA-Klammer des PCNA seitlich
DNA-Klammer der T4-DNA-Polymerase

Als notwendiger Bestandteil eines Proteinkomplexes mit der DNA-Polymerase III bindet es die Polymerase an die DNA. Die Wechselwirkungen zwischen der Polymerase und der DNA-Klammer sowie die Wechselwirkungen zwischen DNA-Klammer und DNA sind stärker als zwischen der Polymerase und der DNA.

DNA-Klammern können gentechnisch im Zuge eines Proteindesigns an thermostabile DNA-Polymerasen angehängt werden. Solche Fusionsproteine besitzen eine erhöhte Anzahl synthetisierter Nukleinbasen in einem Lauf (erhöhte Prozessivität) und eine erhöhte Syntheserate und werden daher zur Polymerasekettenreaktion eingesetzt. Die DNA-Klammer kann die Syntheserate um den Faktor 1000 erhöhen.

Literatur Bearbeiten

  • Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A, Levine M, Losick R: Molecular Biology of the Gene. Pearson/Benjamin Cummings, San Francisco 2004, ISBN 0-8053-4635-X.

Weblinks Bearbeiten

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. PDB 1W60; Kontopidis G, Wu SY, Zheleva DI, Taylor P, McInnes C, Lane DP, Fischer PM, Walkinshaw MD: Structural and biochemical studies of human proliferating cell nuclear antigen complexes provide a rationale for cyclin association and inhibitor design. In: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102. Jahrgang, Nr. 6, Februar 2005, S. 1871–6, doi:10.1073/pnas.0406540102, PMID 15681588, PMC 548533 (freier Volltext).
  2. V. Mizrahi, R. N. Henrie, J. F. Marlier, K. A. Johnson, S. J. Benkovic: Rate-limiting steps in the DNA polymerase I reaction pathway. In: Biochemistry. 24. Jahrgang, Nr. 15, 1985, S. 4010–4018, doi:10.1021/bi00336a031.
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Eine DNA Klammer englisch DNA clamp sliding clamp ist eine Proteinstruktur in manchen DNA bindenden Proteinen die einer Bindung eines DNA modifizierenden Enzyms an die DNA wahrend der DNA Replikation dient 1 Die DNA Klammer besteht aus mehreren Proteinen mit ungefahr keilformigen Aufbau mit Proteindomanen zur sequenzunabhangigen DNA Bindung und zur Multimerisierung sodass sich die typische Ringform ergibt DNA Klammer des PCNA frontalDNA Klammer des PCNA seitlichDNA Klammer der T4 DNA PolymeraseAls notwendiger Bestandteil eines Proteinkomplexes mit der DNA Polymerase III bindet es die Polymerase an die DNA Die Wechselwirkungen zwischen der Polymerase und der DNA Klammer sowie die Wechselwirkungen zwischen DNA Klammer und DNA sind starker als zwischen der Polymerase und der DNA DNA Klammern konnen gentechnisch im Zuge eines Proteindesigns an thermostabile DNA Polymerasen angehangt werden Solche Fusionsproteine besitzen eine erhohte Anzahl synthetisierter Nukleinbasen in einem Lauf erhohte Prozessivitat und eine erhohte Syntheserate und werden daher zur Polymerasekettenreaktion eingesetzt Die DNA Klammer kann die Syntheserate um den Faktor 1000 erhohen 2 Literatur BearbeitenWatson JD Baker TA Bell SP Gann A Levine M Losick R Molecular Biology of the Gene Pearson Benjamin Cummings San Francisco 2004 ISBN 0 8053 4635 X Weblinks BearbeitenSCOP DNA clamp fold CATH box architecture Clamping down on pathogenic bacteria how to shut down a key DNA polymerase complex Quips at PDBe MeSH DNA KlammerEinzelnachweise Bearbeiten PDB 1W60 Kontopidis G Wu SY Zheleva DI Taylor P McInnes C Lane DP Fischer PM Walkinshaw MD Structural and biochemical studies of human proliferating cell nuclear antigen complexes provide a rationale for cyclin association and inhibitor design In Proc Natl Acad Sci U S A 102 Jahrgang Nr 6 Februar 2005 S 1871 6 doi 10 1073 pnas 0406540102 PMID 15681588 PMC 548533 freier Volltext V Mizrahi R N Henrie J F Marlier K A Johnson S J Benkovic Rate limiting steps in the DNA polymerase I reaction pathway In Biochemistry 24 Jahrgang Nr 15 1985 S 4010 4018 doi 10 1021 bi00336a031 Abgerufen von https de wikipedia org w index php title DNA Klammer amp oldid 161129723