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ctRNA englisch counter transcribed RNA gegentranskribierte RNA sind RNA aus Bakterien mit der die Anzahl an Plasmiden in

ctRNA

ctRNA (englisch counter-transcribed RNA ‚gegentranskribierte RNA‘) sind RNA aus Bakterien, mit der die Anzahl an Plasmiden in einer Bakterienzelle begrenzt wird. Die Hemmung erfolgt bei der Replikation des Plasmids. Die Begrenzung der Replikation durch ctRNA ist ein Mechanismus zur Begrenzung der Plasmidkopieanzahl, z. B. zur Vermeidung einer übermäßigen Genexpression der Gene auf dem Plasmid.

Struktur der ctRNA p42d

Eigenschaften Bearbeiten

ctRNA sind nichtcodierende Ribonukleinsäuren, die an die mRNA von RepB binden und dessen Translation hemmen. RepB ist ein Protein, das die Rolling circle replication von Plasmiden einleitet. Durch die Hemmung der Transkription von RepB wird die Plasmidkopienanzahl im Bakterium gesenkt. Daher werden die ctRNA-enthaltenden Plasmide als low copy number plasmids bezeichnet.

In Corynebacterium glutamicum dient ctRNA als Antisense-RNA. In Enterococcus faecium enthält das Plasmid pJB01 die drei offenen Leseraster copA, repB und repC und auf dem gegenüberliegenden Strang zwischen copA und repB liegt die Sequenz der pJB01-ctRNA, welche an die drei offenen Leseraster bindet und deren Translation hemmt. Weitere ctRNA wurden bei Laktokokken, Streptococcus thermophilus, und Rhizobium etli beschrieben.

ctRNA, Iterons und Antisense-RNA sind bakterielle Mechanismen zur Beschränkung der Plasmidkopieanzahl.

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. T. Venkova-Canova, M. Pátek, J. Nesvera: Control of rep gene expression in plasmid pGA1 from Corynebacterium glutamicum. In: Journal of bacteriology. Band 185, Nummer 8, April 2003, S. 2402–2409, ISSN 0021-9193. PMID 12670963. PMC 152619 (freier Volltext).
  2. S. W. Kim, I. S. Jeong, E. J. Jeong, J. I. Tak, J. H. Lee, S. K. Eo, H. Y. Kang, J. D. Bahk: The terminal and internal hairpin loops of the ctRNA of plasmid pJB01 play critical roles in regulating copy number. In: Molecules and cells. Band 26, Nummer 1, Juli 2008, S. 26–33, ISSN 1016-8478. PMID 18511887.
  3. A. R. Raha, W. Y. Hooi, N. S. Mariana, S. Radu, N. R. Varma, K. Yusoff: DNA sequence analysis of a small cryptic plasmid from Lactococcus lactis subsp. lactis M14. In: Plasmid. Band 56, Nummer 1, Juli 2006, S. 53–61, ISSN 0147-619X. doi:10.1016/j.plasmid.2006.03.003. PMID 16675013.
  4. P. Petrova, V. Miteva, J. A. Ruiz-Masó, G. del Solar: Structural and functional analysis of pt38, a 2.9kb plasmid of Streptococcus thermophilus yogurt strain. In: Plasmid. Band 50, Nummer 3, November 2003, S. 176–189, ISSN 0147-619X. PMID 14597007.
  5. R. Cervantes-Rivera, C. Romero-López, A. Berzal-Herranz, M. A. Cevallos: Analysis of the mechanism of action of the antisense RNA that controls the replication of the repABC plasmid p42d. In: Journal of bacteriology. Band 192, Nummer 13, Juli 2010, S. 3268–3278, ISSN 1098-5530. doi:10.1128/JB.00118-10. PMID 20435728. PMC 2897686 (freier Volltext).
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ctRNA englisch counter transcribed RNA gegentranskribierte RNA sind RNA aus Bakterien mit der die Anzahl an Plasmiden in einer Bakterienzelle begrenzt wird 1 Die Hemmung erfolgt bei der Replikation des Plasmids Die Begrenzung der Replikation durch ctRNA ist ein Mechanismus zur Begrenzung der Plasmidkopieanzahl z B zur Vermeidung einer ubermassigen Genexpression der Gene auf dem Plasmid Struktur der ctRNA p42dEigenschaften BearbeitenctRNA sind nichtcodierende Ribonukleinsauren die an die mRNA von RepB binden und dessen Translation hemmen RepB ist ein Protein das die Rolling circle replication von Plasmiden einleitet Durch die Hemmung der Transkription von RepB wird die Plasmidkopienanzahl im Bakterium gesenkt Daher werden die ctRNA enthaltenden Plasmide als low copy number plasmids bezeichnet In Corynebacterium glutamicum dient ctRNA als Antisense RNA In Enterococcus faecium enthalt das Plasmid pJB01 die drei offenen Leseraster copA repB und repC und auf dem gegenuberliegenden Strang zwischen copA und repB liegt die Sequenz der pJB01 ctRNA welche an die drei offenen Leseraster bindet und deren Translation hemmt 2 Weitere ctRNA wurden bei Laktokokken 3 Streptococcus thermophilus 4 und Rhizobium etli beschrieben 5 ctRNA Iterons und Antisense RNA sind bakterielle Mechanismen zur Beschrankung der Plasmidkopieanzahl Einzelnachweise Bearbeiten T Venkova Canova M Patek J Nesvera Control of rep gene expression in plasmid pGA1 from Corynebacterium glutamicum In Journal of bacteriology Band 185 Nummer 8 April 2003 S 2402 2409 ISSN 0021 9193 PMID 12670963 PMC 152619 freier Volltext S W Kim I S Jeong E J Jeong J I Tak J H Lee S K Eo H Y Kang J D Bahk The terminal and internal hairpin loops of the ctRNA of plasmid pJB01 play critical roles in regulating copy number In Molecules and cells Band 26 Nummer 1 Juli 2008 S 26 33 ISSN 1016 8478 PMID 18511887 A R Raha W Y Hooi N S Mariana S Radu N R Varma K Yusoff DNA sequence analysis of a small cryptic plasmid from Lactococcus lactis subsp lactis M14 In Plasmid Band 56 Nummer 1 Juli 2006 S 53 61 ISSN 0147 619X doi 10 1016 j plasmid 2006 03 003 PMID 16675013 P Petrova V Miteva J A Ruiz Maso G del Solar Structural and functional analysis of pt38 a 2 9kb plasmid of Streptococcus thermophilus yogurt strain In Plasmid Band 50 Nummer 3 November 2003 S 176 189 ISSN 0147 619X PMID 14597007 R Cervantes Rivera C Romero Lopez A Berzal Herranz M A Cevallos Analysis of the mechanism of action of the antisense RNA that controls the replication of the repABC plasmid p42d In Journal of bacteriology Band 192 Nummer 13 Juli 2010 S 3268 3278 ISSN 1098 5530 doi 10 1128 JB 00118 10 PMID 20435728 PMC 2897686 freier Volltext Abgerufen von https de wikipedia org w index php title CtRNA amp oldid 170936642