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Kollagen Typ 9α1 Kollagen Typ IX alpha 1 ist ein fibrillenassoziiertes Kollagen das vom Gen COL9A1 codiert wird Es bilde

Kollagen-Typ 9α1

Kollagen Typ IX, alpha 1 ist ein fibrillenassoziiertes Kollagen, das vom Gen COL9A1 codiert wird. Es bildet mit dem verwandten Kollagen Typ IX, alpha 2 und Kollagen Typ IX, alpha 3 Heterotrimere, die wiederum Kollagenfibrillen vom Typ IX formen.

Kollagen Typ IX, alpha 1
Bändermodell vom Protein COL9A1 nach PDB 2UUR
Andere Namen
  • Alpha-1-Typ-IX-Kollagen
  • Kollagen Alpha-1(IX)-Kette
  • Kollagen Alpha-1-Kette Typ IX

Vorhandene Strukturdaten: PDB 5CTD, PDB 5CTI

Eigenschaften des menschlichen Proteins
Masse/Länge Primärstruktur 921 Aminosäuren, 91.869 Da
Isoformen 3
Bezeichner
Gen-Namen COL9A1 ; EDM6, STL4, MED
Externe IDs
Vorkommen
Homologie-Familie Hovergen
Übergeordnetes Taxon Deuterostomia
Orthologe
Mensch Hausmaus
Entrez 1297 12839
Ensembl ENSG00000112280 ENSMUSG00000026147
UniProt P20849 Q05722
Refseq (mRNA) NM_001851 NM_001290691
Refseq (Protein) NP_001842.3 NP_031766.3
Genlocus Chr 6: 70.22 – 70.3 Mb Chr 1: 24.18 – 24.25 Mb
PubMed-Suche 1297 12839

Eigenschaften Bearbeiten

Kollagen Typ IX, alpha 1 ist Bestandteil des hyalinen Knorpels und des Glaskörpers. Kollagen Typ IX befindet sich auf der Oberfläche von Kollagenfibrillen und ist von entscheidender Bedeutung für die Knorpelintegrität und -stabilität. Die N-terminale NC4-Domäne von COL9A1 dient zur Interaktion mit verschiedenen Makromolekülen wie Proteoglykane und Thrombospondin-5.

Weblinks Bearbeiten

  • MeSH alpha-1(IX) chain Kollagen-Typ 9α1

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. A. Aszódi, E. B. Hunziker, B. R. Olsen, R. Fässler: The role of collagen II and cartilage fibril-associated molecules in skeletal development. In: Osteoarthritis Cartilage. 9. Jahrgang, 2001, S. 150–159, PMID 11680679.
  2. K. Nikopoulos et al.: Autosomal Recessive Stickler Syndrome in Two Families Is Caused by Mutations in the COL9A1 Gene. In: Investigative Ophthalmology & Visual Science. 52. Jahrgang, Nr. 7, 1. Juli 2011, S. 4774–4779, doi:10.1167/iovs.10-7128, PMID 21421862 (nih.gov).
  3. S. Carlsen, K. S. Nandakumar, R. Holmdahl: Type IX collagen deficiency enhances the binding of cartilage-specific antibodies and arthritis severity. In: Arthritis Res Ther. 8. Jahrgang, Nr. 4, 2006, S. 102, doi:10.1186/ar1989, PMID 16813664, PMC 1779414 (freier Volltext) – (biomedcentral.com).
  4. V. M. Leppänen, H. Tossaveinen, P. Permi, L. Lehtiö, G. Rönnholm, A. Goldman, I. Kilpelaïnen, T. Pihlajamaa: Crystal structure of the N-terminal NC4 domain of collagen IX, a zinc binding member of the laminin-neurexin-sex hormone binding globulin (LNS) domain family. In: J Biol Chem. 282. Jahrgang, Nr. 32, 10. August 2007, S. 23219–23230, doi:10.1074/jbc.M702514200, PMID 17553797 (jbc.org).
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Veröffentlichungsdatum:
Kollagen Typ IX alpha 1 ist ein fibrillenassoziiertes Kollagen das vom Gen COL9A1 codiert wird Es bildet mit dem verwandten Kollagen Typ IX alpha 2 und Kollagen Typ IX alpha 3 Heterotrimere die wiederum Kollagenfibrillen vom Typ IX formen Kollagen Typ IX alpha 1Bandermodell vom Protein COL9A1 nach PDB 2UURAndere Namen Alpha 1 Typ IX Kollagen Kollagen Alpha 1 IX Kette Kollagen Alpha 1 Kette Typ IXVorhandene Strukturdaten PDB 5CTD PDB 5CTIEigenschaften des menschlichen ProteinsMasse Lange Primarstruktur 921 Aminosauren 91 869 DaIsoformen 3BezeichnerGen Namen COL9A1 EDM6 STL4 MEDExterne IDs GeneCards COL9A1 OMIM 120210 UniProt P20849 MGI 88465VorkommenHomologie Familie HovergenUbergeordnetes Taxon DeuterostomiaOrthologeMensch HausmausEntrez 1297 12839Ensembl ENSG00000112280 ENSMUSG00000026147UniProt P20849 Q05722Refseq mRNA NM 001851 NM 001290691Refseq Protein NP 001842 3 NP 031766 3Genlocus Chr 6 70 22 70 3 Mb Chr 1 24 18 24 25 MbPubMed Suche 1297 12839Eigenschaften BearbeitenKollagen Typ IX alpha 1 ist Bestandteil des hyalinen Knorpels 1 und des Glaskorpers 2 Kollagen Typ IX befindet sich auf der Oberflache von Kollagenfibrillen und ist von entscheidender Bedeutung fur die Knorpelintegritat und stabilitat 3 Die N terminale NC4 Domane von COL9A1 dient zur Interaktion mit verschiedenen Makromolekulen wie Proteoglykane und Thrombospondin 5 4 Weblinks BearbeitenMeSH alpha 1 IX chain Kollagen Typ 9a1Einzelnachweise Bearbeiten A Aszodi E B Hunziker B R Olsen R Fassler The role of collagen II and cartilage fibril associated molecules in skeletal development In Osteoarthritis Cartilage 9 Jahrgang 2001 S 150 159 PMID 11680679 K Nikopoulos et al Autosomal Recessive Stickler Syndrome in Two Families Is Caused by Mutations in the COL9A1 Gene In Investigative Ophthalmology amp Visual Science 52 Jahrgang Nr 7 1 Juli 2011 S 4774 4779 doi 10 1167 iovs 10 7128 PMID 21421862 nih gov S Carlsen K S Nandakumar R Holmdahl Type IX collagen deficiency enhances the binding of cartilage specific antibodies and arthritis severity In Arthritis Res Ther 8 Jahrgang Nr 4 2006 S 102 doi 10 1186 ar1989 PMID 16813664 PMC 1779414 freier Volltext biomedcentral com V M Leppanen H Tossaveinen P Permi L Lehtio G Ronnholm A Goldman I Kilpelainen T Pihlajamaa Crystal structure of the N terminal NC4 domain of collagen IX a zinc binding member of the laminin neurexin sex hormone binding globulin LNS domain family In J Biol Chem 282 Jahrgang Nr 32 10 August 2007 S 23219 23230 doi 10 1074 jbc M702514200 PMID 17553797 jbc org Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Kollagen Typ 9a1 amp oldid 219807715