Emil Müller ist der Name folgender Personen:
- Emil Müller (Unternehmer, 1807) (1807–1857), deutscher Eisenbahnunternehmer
- Emil Müller (Politiker, 1836) (1836–1892), österreichischen Politiker, Mitglied des Abgeordnetenhauses
- Emil Müller (Chemiker) (1844–1910), deutscher Sprengstoffindustrieller
- Emil Müller (Mathematiker) (1861–1927), österreichischer Mathematiker und Hochschullehrer
- Emil Müller (Mundartautor) (1863–1940), deutscher Lehrer und Mundartautor
- Emil Müller (Maler, 1863), deutscher Maler
- Emil Müller (Pfarrer) (1864–1918), deutscher Pfarrer und Heimatkundler
- Emil Müller (Missionar) (1868–1940), deutscher Theologe, Pfarrer und Missionar
- Emil Müller (Politiker, 1890) (1890–1967), deutscher Politiker (SPD), MdL Rheinland-Pfalz
- Emil Müller (Politiker, Februar 1893) (1893–1963), deutscher Politiker (SPD), MdL Hessen
- Emil Müller (Politiker, März 1893) (1893–1974), Schweizer Politiker (SP) und Architekt
- Emil Müller (Unternehmer, 1894) (1894–1971), Schweizer Ingenieur und Unternehmer
- Emil Müller (Politiker, 1897) (1897–1958), deutscher Politiker (SPD), MdL Baden-Württemberg
- Emil Müller (Verwaltungsjurist) (1900–1992), deutscher Verwaltungsjurist
- Emil Müller (1905–1926), deutsches Mordopfer, siehe Fall Rouzier
- Emil Müller (Botaniker) (1920–2008), Schweizer Botaniker und Mykologe
- Emil Müller (Trainer) (* 1933), Schweizer Fußballtrainer
- Emil Müller (Ringer) (* 1949), deutscher Ringer
- Emil Müller-Ettikon (1911–1985), deutscher Lehrer und Heimatforscher
- Emil Müller-Ewald (1881–1941), deutscher Maler und Grafiker
- Emil Müller-von Siebenthal (vor 1897–1953), Schweizer Drucker und Verleger
- Emil Strebel-Müller (1890–1971), Schweizer Lehrer, Journalist, Chronist und Botaniker
- Emil Müller-Sturmheim (1886–1952), österreichischer Schriftsteller und Freimaurer
- Emil Franz Josef Müller-Büchi (1901–1980), Schweizer Publizistikwissenschafter, Rechtshistoriker und Hochschullehrer
- Emil Heinrich Otto Müller (1826–1914), deutscher Altphilologe und Pädagoge
- Emil K. Müller (1893–1941), Schweizer Ingenieur
- Emil R. Müller (1879–1950), deutscher Schriftsteller, Redakteur und Dichter