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Molekulare Epidemiologie Die molekularen Epidemiologie bzw molekulare Surveillance ist der Bereich der Epidemiologie bei

Molekulare Epidemiologie

Die molekularen Epidemiologie bzw. molekulare Surveillance ist der Bereich der Epidemiologie, bei dem Erkenntnisse aus dem molekularen Aufbau von Pathogenen gewonnen werden, z. B. aus der DNA-Sequenz oder der Aminosäuresequenz. Die im Rahmen der molekularen Untersuchung gewonnenen Erkenntnisse dienen unter anderem der Überwachung epidemischer Krankheitserreger.

Eigenschaften Bearbeiten

Die molekulare Epidemiologie verwendet sequenzbasierte Daten oder andere Typisierungsdaten eines oder mehrerer Biomarker zur Bestätigung oder zum Ausschluss von Epidemien, zur Ermittlung der Transmission und der Infektionswege, der Verbreitung, der Replikation und der Diversität von Pathogenen. Fehlerquellen der molekularen Epidemiologie sind z. B. eine unvollständige Datenerfassung. Teilweise können Erkenntnisse aus der molekularen Epidemiologie auch in eine Änderung von Handlungsanweisungen münden.

Projekte zur Koordinierung von Erkenntnissen und Methoden sind z. B. STROBE und STROME-ID.

Methoden Bearbeiten

Neben der DNA-Sequenzierung und anderen Genotypisierungsmethoden wird unter anderem auch die RNA-Seq und die Proteinsequenzierung verwendet.

Geschichte Bearbeiten

Die Bezeichnung ‚molekulare Epidemiologie‘ wurde 1973 durch E. D. Kilbourne geprägt und 1993 präzisiert.

Literatur Bearbeiten

  • M. T. Smith, P. Hainaut, F. Perera, P. A. Schulte, P. Boffetta, S. J. Chanock, N. Rothman: Future perspectives on molecular epidemiology. In: IARC scientific publications. Nummer 163, 2011, S. 493–500, ISSN 0300-5038. PMID 22997879.
  • M. García-Closas, R. Vermeulen, D. Cox, Q. Lan, N. E. Caporaso, N. Rothman: Population-based study designs in molecular epidemiology. In: IARC scientific publications. Nummer 163, 2011, S. 241–259, ISSN 0300-5038. PMID 22997866.

Einzelnachweise Bearbeiten

  1. ↑ R. Ranjbar, A. Karami, S. Farshad, G. M. Giammanco, C. Mammina: Typing methods used in the molecular epidemiology of microbial pathogens: a how-to guide. In: The new microbiologica. Band 37, Nummer 1, Januar 2014, S. 1–15, ISSN 1121-7138. PMID 24531166.
  2. ↑ N. Field, T. Cohen, M. J. Struelens, D. Palm, B. Cookson, J. R. Glynn, V. Gallo, M. Ramsay, P. Sonnenberg, D. Maccannell, A. Charlett, M. Egger, J. Green, P. Vineis, I. Abubakar: Strengthening the Reporting of Molecular Epidemiology for Infectious Diseases (STROME-ID): an extension of the STROBE statement. In: The Lancet Infectious Diseases. Band 14, Nummer 4, April 2014, S. 341–352, ISSN 1474-4457. doi:10.1016/S1473-3099(13)70324-4. PMID 24631223.
  3. M. Desai, J. Kubo, D. Esserman, M. B. Terry: The handling of missing data in molecular epidemiology studies. In: Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention. Band 20, Nummer 8, August 2011, S. 1571–1579, ISSN 1538-7755. doi:10.1158/1055-9965.EPI-10-1311. PMID 21750174.
  4. P. A. Schulte, N. Rothman, P. Hainaut, M. T. Smith, P. Boffetta, F. P. Perera: Molecular epidemiology: linking molecular scale insights to population impacts. In: IARC scientific publications. Nummer 163, 2011, S. 1–7, ISSN 0300-5038. PMID 22997853.
  5. J. A. Carriço, A. J. Sabat, A. W. Friedrich, M. Ramirez: Bioinformatics in bacterial molecular epidemiology and public health: databases, tools and the next-generation sequencing revolution. In: Eurosurveillance. Band 18, Nummer 4, 2013, S. 20382, ISSN 1560-7917. PMID 23369390.
  6. M. Pérez-Losada, P. Cabezas, E. Castro-Nallar, K. A. Crandall: Pathogen typing in the genomics era: MLST and the future of molecular epidemiology. In: Infection, Genetics and Evolution. Band 16, Juni 2013, S. 38–53, ISSN 1567-7257. doi:10.1016/j.meegid.2013.01.009. PMID 23357583.
  7. S. Baker, W. P. Hanage, K. E. Holt: Navigating the future of bacterial molecular epidemiology. In: Current Opinion in Microbiology. Band 13, Nummer 5, Oktober 2010, S. 640–645, ISSN 1879-0364. doi:10.1016/j.mib.2010.08.002. PMID 20846899. PMC 2963795 (freier Volltext).
  8. C. M. McHale, L. Zhang, R. Thomas, M. T. Smith: Analysis of the transcriptome in molecular epidemiology studies. In: Environmental and Molecular Mutagenesis. Band 54, Nummer 7, August 2013, S. 500–517, ISSN 1098-2280. doi:10.1002/em.21798. PMID 23907930.
  9. E. D. Kilbourne: The molecular epidemiology of influenza. In: The Journal of Infectious Diseases. Band 127, Nummer 4, April 1973, S. 478–487, ISSN 0022-1899. PMID 4121053.
  10. Schulte, Paul A.; Perera, Frederica P.: Molecular Epidemiology: Principles and Practice. Academic Press, 1993. ISBN 0-12-632346-1. S. 588.
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Veröffentlichungsdatum:
Die molekularen Epidemiologie bzw molekulare Surveillance ist der Bereich der Epidemiologie bei dem Erkenntnisse aus dem molekularen Aufbau von Pathogenen gewonnen werden z B aus der DNA Sequenz oder der Aminosauresequenz Die im Rahmen der molekularen Untersuchung gewonnenen Erkenntnisse dienen unter anderem der Uberwachung epidemischer Krankheitserreger Inhaltsverzeichnis 1 Eigenschaften 2 Methoden 3 Geschichte 4 Literatur 5 EinzelnachweiseEigenschaften BearbeitenDie molekulare Epidemiologie verwendet sequenzbasierte Daten oder andere Typisierungsdaten eines oder mehrerer Biomarker zur Bestatigung oder zum Ausschluss von Epidemien 1 zur Ermittlung der Transmission und der Infektionswege der Verbreitung der Replikation und der Diversitat von Pathogenen 2 Fehlerquellen der molekularen Epidemiologie sind z B eine unvollstandige Datenerfassung 3 Teilweise konnen Erkenntnisse aus der molekularen Epidemiologie auch in eine Anderung von Handlungsanweisungen munden 4 Projekte zur Koordinierung von Erkenntnissen und Methoden sind z B STROBE und STROME ID 2 Methoden BearbeitenNeben der DNA Sequenzierung 5 6 und anderen Genotypisierungsmethoden 7 wird unter anderem auch die RNA Seq 8 und die Proteinsequenzierung verwendet 1 Geschichte BearbeitenDie Bezeichnung molekulare Epidemiologie wurde 1973 durch E D Kilbourne gepragt und 1993 prazisiert 9 10 Literatur BearbeitenM T Smith P Hainaut F Perera P A Schulte P Boffetta S J Chanock N Rothman Future perspectives on molecular epidemiology In IARC scientific publications Nummer 163 2011 S 493 500 ISSN 0300 5038 PMID 22997879 M Garcia Closas R Vermeulen D Cox Q Lan N E Caporaso N Rothman Population based study designs in molecular epidemiology In IARC scientific publications Nummer 163 2011 S 241 259 ISSN 0300 5038 PMID 22997866 Einzelnachweise Bearbeiten a b R Ranjbar A Karami S Farshad G M Giammanco C Mammina Typing methods used in the molecular epidemiology of microbial pathogens a how to guide In The new microbiologica Band 37 Nummer 1 Januar 2014 S 1 15 ISSN 1121 7138 PMID 24531166 a b N Field T Cohen M J Struelens D Palm B Cookson J R Glynn V Gallo M Ramsay P Sonnenberg D Maccannell A Charlett M Egger J Green P Vineis I Abubakar Strengthening the Reporting of Molecular Epidemiology for Infectious Diseases STROME ID an extension of the STROBE statement In The Lancet Infectious Diseases Band 14 Nummer 4 April 2014 S 341 352 ISSN 1474 4457 doi 10 1016 S1473 3099 13 70324 4 PMID 24631223 M Desai J Kubo D Esserman M B Terry The handling of missing data in molecular epidemiology studies In Cancer Epidemiology Biomarkers amp Prevention Band 20 Nummer 8 August 2011 S 1571 1579 ISSN 1538 7755 doi 10 1158 1055 9965 EPI 10 1311 PMID 21750174 P A Schulte N Rothman P Hainaut M T Smith P Boffetta F P Perera Molecular epidemiology linking molecular scale insights to population impacts In IARC scientific publications Nummer 163 2011 S 1 7 ISSN 0300 5038 PMID 22997853 J A Carrico A J Sabat A W Friedrich M Ramirez Bioinformatics in bacterial molecular epidemiology and public health databases tools and the next generation sequencing revolution In Eurosurveillance Band 18 Nummer 4 2013 S 20382 ISSN 1560 7917 PMID 23369390 M Perez Losada P Cabezas E Castro Nallar K A Crandall Pathogen typing in the genomics era MLST and the future of molecular epidemiology In Infection Genetics and Evolution Band 16 Juni 2013 S 38 53 ISSN 1567 7257 doi 10 1016 j meegid 2013 01 009 PMID 23357583 S Baker W P Hanage K E Holt Navigating the future of bacterial molecular epidemiology In Current Opinion in Microbiology Band 13 Nummer 5 Oktober 2010 S 640 645 ISSN 1879 0364 doi 10 1016 j mib 2010 08 002 PMID 20846899 PMC 2963795 freier Volltext C M McHale L Zhang R Thomas M T Smith Analysis of the transcriptome in molecular epidemiology studies In Environmental and Molecular Mutagenesis Band 54 Nummer 7 August 2013 S 500 517 ISSN 1098 2280 doi 10 1002 em 21798 PMID 23907930 E D Kilbourne The molecular epidemiology of influenza In The Journal of Infectious Diseases Band 127 Nummer 4 April 1973 S 478 487 ISSN 0022 1899 PMID 4121053 Schulte Paul A Perera Frederica P Molecular Epidemiology Principles and Practice Academic Press 1993 ISBN 0 12 632346 1 S 588 Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Molekulare Epidemiologie amp oldid 220920180