Johann Juncker ist der Name folgender Personen:
- Johann Juncker (1679–1759), deutscher Mediziner
- Johann Christian Wilhelm Juncker (1761–1800), deutscher Mediziner und Hochschullehrer
- Johann Georg Juncker (1662–1739), deutscher Jurist und Kirchenlieddichter
- Johann Matthaeus Juncker († 1703), deutscher Beamter
- Johann Michael Juncker (1640–1676), südwestdeutscher Kunstmaler
- Johann Philipp Juncker († 1706), deutscher Theologe