Franz Werner ist der Name folgender Personen:
- Franz Werner (Domkapitular) (1761–1845), deutscher Domkapitular
- Franz Werner (Theologe) (1810–1866), österreichischer Theologe, Mitglied der Frankfurter Nationalversammlung
- Franz Werner (Architekt) (1829–1904), österreichischer Architekt
- Franz von Werner (1836–1881), österreichischer Schriftsteller und Diplomat
- Franz Werner (Zoologe) (1867–1939), österreichischer Herpetologe und Entomologe
- Franz Werner (Ingenieur) (1877–1927), deutscher Schiffbauingenieur und Hochschullehrer
- Franz Werner (General) (* 1937), deutscher Generalmajor
- Franz Donat Werner (1761–1836), deutscher katholischer Priester, Domdekan
- Franz Josef Werner (1847–1908), deutscher Journalist und Verleger
Siehe auch: