Chemical Markup Language Die ChemML oder CML ist ein Dokumentenformat zur Darstellung von chemischen Formeln und komplex

Die Chemical Markup Language (ChemML oder CML) ist ein Dokumentenformat zur Darstellung von chemischen Formeln und komplexen Ausdrücken. Es handelt sich dabei um eine Auszeichnungssprache, die auf XML basiert und möglichst einfach zu verwenden sein soll. Erste Versionen wurden als DTD veröffentlicht. Spätere Versionen wurden XML Schema konform. Es existieren Erweiterungen für Reaktionsschemata, Spektren und analytische Daten.

Chemical Markup Language
Dateiendung:	`.cml`
MIME-Type:	`chemical/x-cml`
Website:	cml.sourceforge.net

Unterstützt wird es von den Bibliotheken OpenBabel, JUMBO, Bioclipse, JOELib, Avogadro sowie den Programmen Jmol und JChemPaint über das Chemistry Development Kit.

Siehe auch Bearbeiten

Mathematical Markup Language (MathML)

Einzelnachweise Bearbeiten

Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa, Michael Wright: Development of chemical markup language (CML) as a system for handling complex chemical content. In: New Journal of Chemistry. Band 25, Nr. 4, 2001, ISSN 1369-9261, S. 618–634, doi:10.1039/B008780G.
Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa: CML: Evolution and design. In: Journal of Cheminformatics. Band 3, Nr. 1, 2011, ISSN 1758-2946, S. 44, doi:10.1186/1758-2946-3-44, PMID 21999549.
Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa: Chemical Markup, XML, and the Worldwide Web. 1. Basic Principles. In: Journal of Chemical Information and Computer Sciences. Band 39, Nr. 6, 1999, ISSN 0095-2338, S. 928–942, doi:10.1021/ci990052b.
Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa: Chemical Markup, XML, and the World Wide Web. 4. CML Schema. In: Journal of Chemical Information and Computer Sciences. Band 43, Nr. 3, 2003, ISSN 0095-2338, S. 757–772, doi:10.1021/ci0256541.
Gemma L. Holliday, Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa: Chemical Markup, XML, and the World Wide Web. 6. CMLReact, an XML Vocabulary for Chemical Reactions. In: Journal of Chemical Information and Modeling. Band 46, Nr. 1, 2006, ISSN 1549-9596, S. 145–157, doi:10.1021/ci0502698.
Stefan Kuhn, Tobias Helmus, Robert J. Lancashire, Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa, Christoph Steinbeck, Egon L. Willighagen: Chemical Markup, XML, and the World Wide Web. 7. CMLSpect, an XML vocabulary for spectral data. In: Journal of Chemical Information and Modeling. Band 47, Nr. 6, 2007, ISSN 1549-9596, S. 2015–2034, doi:10.1021/ci600531a, PMID 17887743.
Egon Willighagen: Processing CML conventions in Java. In: Internet Journal of Chemistry. Band 4, 2001, doi:10.5281/zenodo.1495470.

Weblinks Bearbeiten

OpenSource Site for CML (englisch)

[1] Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa, Michael Wright: Development of chemical markup language (CML) as a system for handling complex chemical content. In: New Journal of Chemistry. Band 25, Nr. 4, 2001, ISSN 1369-9261, S. 618–634, doi:10.1039/B008780G.

[2] Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa: CML: Evolution and design. In: Journal of Cheminformatics. Band 3, Nr. 1, 2011, ISSN 1758-2946, S. 44, doi:10.1186/1758-2946-3-44, PMID 21999549.

[3] Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa: Chemical Markup, XML, and the Worldwide Web. 1. Basic Principles. In: Journal of Chemical Information and Computer Sciences. Band 39, Nr. 6, 1999, ISSN 0095-2338, S. 928–942, doi:10.1021/ci990052b.

[4] Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa: Chemical Markup, XML, and the World Wide Web. 4. CML Schema. In: Journal of Chemical Information and Computer Sciences. Band 43, Nr. 3, 2003, ISSN 0095-2338, S. 757–772, doi:10.1021/ci0256541.

[5] Gemma L. Holliday, Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa: Chemical Markup, XML, and the World Wide Web. 6. CMLReact, an XML Vocabulary for Chemical Reactions. In: Journal of Chemical Information and Modeling. Band 46, Nr. 1, 2006, ISSN 1549-9596, S. 145–157, doi:10.1021/ci0502698.

[6] Stefan Kuhn, Tobias Helmus, Robert J. Lancashire, Peter Murray-Rust, Henry S. Rzepa, Christoph Steinbeck, Egon L. Willighagen: Chemical Markup, XML, and the World Wide Web. 7. CMLSpect, an XML vocabulary for spectral data. In: Journal of Chemical Information and Modeling. Band 47, Nr. 6, 2007, ISSN 1549-9596, S. 2015–2034, doi:10.1021/ci600531a, PMID 17887743.

[7] Egon Willighagen: Processing CML conventions in Java. In: Internet Journal of Chemistry. Band 4, 2001, doi:10.5281/zenodo.1495470.