SPLASH kurz für SPectraL hASH ist ein eindeutiger Bezeichner für ein Molekül der sich aus dessen Massenspektrum ableitet

SPLASH (kurz für SPectraL hASH) ist ein eindeutiger Bezeichner für ein Molekül, der sich aus dessen Massenspektrum ableitet. Er entstand daher, weil Datenbanken für Massenspektren unabhängig voneinander gepflegt wurden, jedoch untereinander teils redundant sind. Der SPLASH ist eindeutig, datenbankunabhängig und lässt sich ähnlich wie ein InChIKey gut ablegen und durchsuchen. Unterstützung für SPLASH wurde initial in den Datenbanken MassBank, MoNA, GNPS, HMDB, MetaboLights und mzCloud sowie der Software MZmine, MS-DIAL, RMassBank, BinBase, Bioclipse und dem übergreifenden Mass Spectrometry Development Kit (MSDK) integriert.

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Einzelnachweise Bearbeiten

Gert Wohlgemuth, Sajjan S. Mehta, Ramon F. Mejia, Steffen Neumann, Diego Pedrosa, Tomáš Pluskal, Emma L. Schymanski, Egon L. Willighagen, Michael Wilson, David S. Wishart, Masanori Arita, Pieter C. Dorrestein, Nuno Bandeira, Mingxun Wang, Tobias Schulze, Reza M. Salek, Christoph Steinbeck, Venkata Chandrasekhar Nainala, Robert Mistrik, Takaaki Nishioka, Oliver Fiehn: SPLASH, a hashed identifier for mass spectra. In: Nature Biotechnology. Band 34, Nr. 11, 2016, ISSN 1546-1696, S. 1099–1101, doi:10.1038/nbt.3689, PMID 27824832, PMC 5515539 (freier Volltext).

[1] Gert Wohlgemuth, Sajjan S. Mehta, Ramon F. Mejia, Steffen Neumann, Diego Pedrosa, Tomáš Pluskal, Emma L. Schymanski, Egon L. Willighagen, Michael Wilson, David S. Wishart, Masanori Arita, Pieter C. Dorrestein, Nuno Bandeira, Mingxun Wang, Tobias Schulze, Reza M. Salek, Christoph Steinbeck, Venkata Chandrasekhar Nainala, Robert Mistrik, Takaaki Nishioka, Oliver Fiehn: SPLASH, a hashed identifier for mass spectra. In: Nature Biotechnology. Band 34, Nr. 11, 2016, ISSN 1546-1696, S. 1099–1101, doi:10.1038/nbt.3689, PMID 27824832, PMC 5515539 (freier Volltext).