Der Peak Counting Score Abk PCS ist ein Wert der die Ahnlichkeit zweier Massenspektren angibt Der PCS hangt von der Anzahl gemeinsamer und unterschiedlicher Spitzenwerte Peaks in beiden Spektren ab Der Wert ist eine sehr einfache Moglichkeit zwei Massenspektren miteinander zu vergleichen Berechnung BearbeitenGegeben seien SA Das Massenspektrum A als Peakliste SB Das Massenspektrum B als Peakliste d Ein Schwellenwert der angibt unterhalb welcher Massendifferenz 2 Peaks als ahnlich gelten sollen e Der leere Peak Falls ein Peak nur in einem Spektrum vorkommt steht e fur die Stelle im anderen Spektrum p c s S A S B i a h n l i c h j s c o r e i j i nicht in B s c o r e i e j nicht in A s c o r e e j displaystyle pcs S A S B sum rm i ddot a hnlich j score i j sum text i nicht in B score i rm varepsilon sum text j nicht in A score rm varepsilon j nbsp s c o r e i j 1 wenn m a s s e i m a s s e j d 0 sonst displaystyle score i j begin cases 1 amp text wenn left masse i masse j right leq rm delta 0 amp text sonst end cases nbsp s c o r e i e s c o r e e j 0 displaystyle score i rm varepsilon score rm varepsilon j 0 nbsp Beispiel BearbeitenSA 10 20 30 50 SB 22 30 45 53 d 4Das Alignment ware in diesem Fall Peakliste A 10 20 30 e 50Peakliste B e 22 30 45 53Die Wertepaare 20 und 22 30 und 30 bzw 50 und 53 werden als Treffer Match eingestuft da ihre Differenzbetrage kleiner gleich d 4 sind Der PCS ware demnach hier p c s S A S B s c o r e 10 e s c o r e 20 22 s c o r e 30 30 s c o r e e 45 s c o r e 50 53 0 1 1 0 1 3 displaystyle begin aligned pcs S A S B amp score 10 rm varepsilon score 20 22 score 30 30 score rm varepsilon 45 score 50 53 amp 0 1 1 0 1 amp 3 end aligned nbsp Weblinks BearbeitenFachartikel zum Thema Informatische Methoden zur Protein Identifikation Folien zum Thema PDF Datei 373 kB Abgerufen von https de wikipedia org w index php title Peak Counting Score amp oldid 205109625
