Muddy River ist der Name folgender Flüsse in den Vereinigten Staaten:
- Muddy River (Connecticut) im Bundesstaat Connecticut
- Muddy River (Massachusetts) im Bundesstaat Massachusetts
- Muddy River (Washington) im Bundesstaat Washington
- Muddy River, ein Name des Amargosa River im Bundesstaat Nevada
- Muddy River (Birch Creek) in Alaska
- Muddy River, Fluss vom Peters-Gletscher zum McKinley River in Alaska