Jürgen Werner ist der Name folgender Personen:
- Jürgen Werner (Philologe) (1931–2021), deutscher Altphilologe
- Jürgen Werner (Fußballspieler, 1935) (1935–2002), deutscher Fußballspieler
- Jürgen Werner (Fußballspieler, 1942) (1942–2014), deutscher Fußballspieler
- Jürgen Werner (Philosoph) (* 1956), deutscher Philosoph, Hochschullehrer, Redakteur und Autor
- Jürgen Werner (Fußballspieler, 1961) (* 1961), österreichischer Fußballspieler und Spielervermittler
- Jürgen Werner (Musiker), deutscher Musiker und Hochschullehrer
- Jürgen Werner (Autor) (* 1963), deutscher Drehbuchautor
- Jürgen Werner (Fußballspieler, 1967) (* 1967), österreichischer Fußballspieler
- Jürgen Werner (Radsportler) (* 1970), deutscher Radrennfahrer