Die Hauptverwaltung Tiefseeforschung (russisch Главное управление глубоководных исследований, Abkürzung GUGI) ist eine Organisationseinheit des russischen Verteidigungsministeriums.
Die Hauptverwaltung betreibt Unterseeboote zur Aufklärung und Sabotage gegnerischer Einrichtungen am Meeresboden, beispielsweise Kleinst-U-Boote, die vom Überseeschiff Jantar ausgesetzt werden, oder das nukleargetriebene U-Boot Loscharik.
Kommandeur ist seit 2021 der Vizeadmiral Wladimir Grischetschkin (* 1965).